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LSD1小分子抑制劑篩選方法的建立及其抑制劑的篩選和抗腫瘤活性研究

發(fā)布時間:2020-05-02 19:08
【摘要】:表觀遺傳學研究的是在DNA序列沒有改變的情況下,由染色體變化引起的可遺傳的表型變化。常見的染色體變化有DNA修飾、RNA修飾與組蛋白修飾等。組蛋白修飾是調節(jié)轉錄調控中重要的一部分。本文研究對象組蛋白賴氨酸特異性去甲基化酶1是第一個被確定的組蛋白去甲基化酶,可以特異性地去除組蛋白H3K4和H3K9單雙甲基。據(jù)報道,LSD1在多種癌癥中過表達,如胃癌和白血病。LSD1功能的抑制可以降低癌細胞的增殖和轉移能力,因此獲取高效靶向LSD1抑制劑將成為癌癥治療新策略。目前LSD1抑制劑篩選方法較為有限,多為檢測抑制劑對LSD1抑制活性,在檢測抑制劑對LSD1靶向結合能力方面略有不足。且一些實驗方法例如基于H_2O_2定量的方法,無法評價與H_2O_2反應的化合物,具有一定局限性。因此建立多角度篩選方法可彌補篩選的局限性。待使用建立的篩選方法篩選得到分子水平活性較好的抑制劑后,對抑制劑進行進一步細胞水平抗腫瘤活性研究,為LSD1抑制劑進一步設計與優(yōu)化提供新思路。本課題圍繞以下問題開展:(1)LSD1截斷體重組蛋白的表達與純化本課題使用親和層析法與離子交換色譜柱法對LSD1截斷體重組蛋白進行純化,獲得純度95%的LSD1截斷體重組蛋白,可滿足后期抑制劑篩選與酶動力學研究需求。(2)LSD1抑制劑篩選方法建立本課題從化合物對酶抑制活性檢測、化合物與靶標結合以及酶-配體動力學三個角度進行了LSD1抑制劑篩選方法建立的實驗設計。課題首先表達并純化了甲醛脫氫酶,通過定量甲醛從而定量了LSD1去甲基化活性及小分子抑制劑對LSD1活性的抑制能力;其次使用染料SYPRO Orange實時監(jiān)測熒光值,反應化合物與蛋白的結合;最后本課題應用表面等離子共振技術實現(xiàn)了對抑制劑的篩選并獲得相應酶動力學數(shù)據(jù),彌補了現(xiàn)有LSD1抑制劑篩選方法無法評價抑制劑對LSD1靶向結合動力學的不足。(3)新型LSD1抑制劑抗腫瘤活性的研究本課題組通過對組內化合物庫的篩選與優(yōu)化,得到一個二苯乙烯類、一個吲哚衍生物類及兩個三唑并嘧啶類共四個高效LSD1靶向抑制劑,并在分子水平和細胞水平進行了活性評價。新型二苯乙烯類LSD1抑制劑DYC-8c在分子水平通過FAD競爭的方式可逆地抑制LSD1活性,所得IC_(50)=0.28μM,且以快結合(Kon=1.82×10~3 1/(M?s))、慢解離(Koff=1.00×10~-22 1/s)的方式作用于LSD1。在細胞水平,DYC-8c促進白血病THP-1細胞白細胞分化抗原CD86的表達并促進其髓樣分化,抑制其增殖與克隆形成能力,IC_(50)為5.76μM。此外,它還能使THP-1細胞中LSD1底物H3K4me2的累積逐漸增加,說明其在細胞內同樣靶向抑制LSD1的活性。新型不可逆吲哚衍生物類LSD1抑制劑XHW-9e為首個非單胺氧化酶抑制劑類的不可逆LSD1抑制劑,分子水平對LSD1 IC_(50)=1.23μM,并提高LSD1的穩(wěn)定性,說明其有效地靶向LSD1重組蛋白,且同樣以快結合(Kon=2.98×10~31/(M?s))、慢解離(Koff=6.05×10~(-2)1/s)的方式靶向作用于LSD1。細胞水平,XHW-9e可有效抑制THP-1的增殖與克隆形成能力,增殖抑制IC_(50)為1.20μM,促進了CD86的表達,促進了髓樣分化。新型三唑并嘧啶類LSD1抑制劑WS-996以可逆的形式通過競爭FAD從而抑制LSD1蛋白活性,IC_(50)=34.45 nM。在THP-1中可達到IC_(50)=1.65μM的細胞增殖抑制作用,促進THP-1的分化,有效提升細胞內LSD1熱穩(wěn)定性,說明其靶向細胞內LSD1并發(fā)揮作用。新型三唑并嘧啶類LSD1抑制劑WS-812與WS-996相比,具有相似的分子水平活性抑制能力與作用方式,IC_(50)=38.15 nM,K_D=6.23μM。此外,WS-812不僅對白血病THP-1細胞具有細胞增殖、克隆形成的抑制作用與促分化作用,而且可以較好地抑制胃癌細胞MGC-803的細胞增殖,有效抑制其克隆形成與轉移能力。綜上所述,本課題首次使用兩步法得到高純度LSD1重組蛋白,并首次根據(jù)副產物定量、蛋白熱穩(wěn)定性與表面等離子共振原理建立了三個LSD1抑制劑篩選方法,發(fā)現(xiàn)了四個新型LSD1抑制劑,其中三個為可逆抑制劑,一個為首個非單胺氧化酶抑制劑類的不可逆抑制劑。后期的抑制劑生物活性評價結果揭示了抑制劑的抗腫瘤活性,為新型靶向LSD1抗腫瘤藥物的開發(fā)提供了重要的依據(jù)。
【圖文】:

模型圖,核小體,串珠,模型


圖 1.1 核小體“串珠模型”結構NA 修飾A 的主要修飾為 DNA 甲基化。在真核細胞中,DNA 的 CpG CpGIs)二核苷酸胞嘧啶在合成后被 DNA 甲基轉移酶ansferase,,DNMT)將 S-甲硫腺苷(S-adenosylmethionine,SA胞嘧啶的 C5 位置,轉化為 5-甲基胞嘧啶(5-methycytosine,5修飾[11](圖 1.2)。DNA 的甲基化可以抑制轉錄因子與 DNA 募具有抑制基因表達功能的酶,從而造成基因沉默[12]。因此 D組關鍵的表觀遺傳修飾,參與許多細胞過程,包括基因轉錄、胚失活、染色體穩(wěn)定和基因組印記等[13]。

甲基化


圖 1.1 核小體“串珠模型”結構修飾為 DNA 甲基化。在真核細胞中,DNA 二核苷酸胞嘧啶在合成后被 DNA 甲基,DNMT)將 S-甲硫腺苷(S-adenosylmethion的 C5 位置,轉化為 5-甲基胞嘧啶(5-methycy(圖 1.2)。DNA 的甲基化可以抑制轉錄因子與抑制基因表達功能的酶,從而造成基因沉默[12]的表觀遺傳修飾,參與許多細胞過程,包括基因染色體穩(wěn)定和基因組印記等[13]。
【學位授予單位】:鄭州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:R91;R96

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本文編號:2647400

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