組蛋白去乙�;敢种苿┑奶摂M篩選及對人肝癌細胞HepG2體外抑制作用的研究
本文關(guān)鍵詞:組蛋白去乙酰化酶抑制劑的虛擬篩選及對人肝癌細胞HePG2體外抑制作用的研究
更多相關(guān)文章: 組蛋白去乙�;敢种苿� 虛擬篩選 多胺類化合物 HepG2
【摘要】:肝癌(Liver Cancer),是常見的消化系統(tǒng)腫瘤之一,原發(fā)性肝癌的死亡率在我國排第二位,世界排第三位,已成為僅次于胃癌和食道癌的第三大常見惡性腫瘤,嚴(yán)重威脅著人類的健康與生命,目前臨床上仍然缺乏有效藥物。組蛋白去乙�;敢种苿�(HDACI)能干擾組蛋白去乙酰化酶功能,具有抑制腫瘤細胞增殖、誘導(dǎo)細胞分化和(或)凋亡的功能。組蛋白去乙�;敢种苿┮殉蔀榭鼓[瘤靶向治療的研究新熱點。本文對一系列天然化合物及其衍生物的組蛋白去乙酰化酶抑制作用、優(yōu)選組蛋白去乙酰化酶抑制作用化合物制備方法及對人肝癌細胞HepG2體外抑制作用進行了研究,現(xiàn)總結(jié)如下:1.建立了組蛋白去乙�;敢种苿┨摂M篩選方法從蛋白質(zhì)晶體數(shù)據(jù)庫PDB中選取與防治腫瘤有關(guān)的兩種組蛋白去乙�;割愋虷DAC2和HDAC8的受體模型。通過查閱文獻搜集,或者進行母核的衍生物設(shè)計,共得到369個化合物結(jié)構(gòu)作為配體庫,其中木脂素類化合物345個,多胺類化合物28個,已上市的組蛋白去乙�;敢种苿�3個。用Sybyl-X2.0軟件將兩個受體與配體庫進行分子對接試驗。通過打分及分子對接模式圖綜合考慮,最終確定了6個多胺類衍生物作為組蛋白去乙酰化酶抑制劑活性化合物,進行下一步的合成制備。2.篩選出了組蛋白去乙酰化酶抑制作用化合物的合成方法通過查閱文獻,得到席夫堿反應(yīng)后再還原的總路線,然后不斷的試驗原料藥比例、保護氣體選擇、回流溶劑選擇、反應(yīng)溫度設(shè)置、反應(yīng)時長設(shè)置等各項條件,篩選出了以胱胺鹽酸鹽和精胺為原料,通過第一步分別與對羥基苯甲醛、呋喃甲醛、吡咯甲醛的席夫堿反應(yīng),生成的亞胺在第二步被硼氫化鈉還原,最后分離提純的合成方法,制備出了6個以胱胺和精胺為母核的多胺類化合物。3.完了合成的組蛋白去乙�;敢种谱饔没衔锏慕Y(jié)構(gòu)確證采用紅外光譜、核磁共振及質(zhì)譜等光譜學(xué)方法,通過對合成的6個化合物的波譜進行解析,確證結(jié)構(gòu)分別為N,N’-(二硫基-2,1-二乙基)雙(4-羥基苯甲胺),N,N’-(二硫基-2,1-二乙基)雙(2-呋喃甲胺),N,N’-(二硫基-2,1-二乙基)雙(2-吡咯甲胺),1,16,-2-(4-羥基苯基)-2,6,11,15-四氮雜十六烷,1,16,-2-(2-呋喃)-2,6,11,15-四氮雜十六烷,1,16,-2-(2-吡咯)-2,6,11,15-四氮雜十六烷。4.進行了組蛋白去乙�;敢种谱饔没衔飳θ烁伟┘毎鸋epG2的體外抑制作用試驗采用MTT法,以5-氟尿嘧啶為陽性對照,通過合成的6個化合物對人肝癌細胞HepG2的體外抑制作用試驗,篩選出了最佳抑制人肝癌細胞HepG2的化合物為N,N’-(二硫基-2,1-二乙基)雙(2-吡咯甲胺),且從抑制率和IC50等數(shù)據(jù)可判斷其活性略優(yōu)于5-氟尿嘧啶。
【關(guān)鍵詞】:組蛋白去乙�;敢种苿� 虛擬篩選 多胺類化合物 HepG2
【學(xué)位授予單位】:重慶理工大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R96
【目錄】:
- 摘要4-6
- Abstract6-11
- 英文縮寫索引11-12
- 1 緒論12-20
- 1.1 引言12
- 1.2 肝癌的治療現(xiàn)狀12-14
- 1.2.1 影響肝癌療效的原因12-13
- 1.2.2 臨床上治療肝癌的方法13-14
- 1.3 組蛋白去乙酰化酶抑制劑14-17
- 1.3.1 組蛋白去乙�;傅姆诸�15-16
- 1.3.2 組蛋白去乙�;敢种苿┛鼓[瘤機制16
- 1.3.3 組蛋白去乙酰化酶抑制劑抗腫瘤藥物現(xiàn)狀16-17
- 1.4 木脂素類化合物與抗腫瘤的關(guān)系17
- 1.5 多胺類化合物與抗腫瘤的關(guān)系17
- 1.6 本章小結(jié)17-20
- 2 抑制組蛋白去乙�;富钚晕镔|(zhì)的虛擬篩選20-34
- 2.1 虛擬篩選的流程20
- 2.1.1 受體的準(zhǔn)備20
- 2.1.2 配體庫的建立20
- 2.1.3 分子對接20
- 2.1.4 篩選目標(biāo)化合物20
- 2.2 材料與方法20-22
- 2.2.1 軟件,硬件的準(zhǔn)備20
- 2.2.2 受體的準(zhǔn)備20-21
- 2.2.3 構(gòu)建配體庫21-22
- 2.2.4 分子對接試驗22
- 2.2.5 評價方法22
- 2.3 結(jié)果與分析22-32
- 2.3.1 篩選結(jié)果22-28
- 2.3.2 受體與配體對接模式分析28-32
- 2.4 結(jié)論與討論32-34
- 3 多胺類化合物的合成34-41
- 3.1 多胺類化合物合成路線設(shè)計34
- 3.2 多胺類化合物的制備34-39
- 3.2.1 實驗儀器及試劑34-35
- 3.2.2 胱胺的制備35-36
- 3.2.3 多胺類化合物的合成36-39
- 3.3 結(jié)果與分析39-40
- 3.3.1 合成制備結(jié)果39
- 3.3.2 制備過程中存在問題的分析39-40
- 3.4 結(jié)論與討論40-41
- 4 結(jié)構(gòu)確證41-56
- 4.1 材料與方法41-43
- 4.1.1 材料41-42
- 4.1.2 實驗方法42-43
- 4.2 結(jié)果與分析43-55
- 4.2.1 N,N’-(二硫基-2,1-二乙基)雙(4-羥基苯甲胺)的結(jié)構(gòu)確證43-45
- 4.2.2 N,N’-(二硫基-2,1-二乙基)雙(2-呋喃甲胺)的結(jié)構(gòu)確證45-47
- 4.2.3 N,N’-(二硫基-2,1-二乙基)雙(2-吡咯甲胺)的結(jié)構(gòu)確證47-49
- 4.2.4 1,16,2(4-羥基苯基)-2,6,11,15-四氮雜十六烷的結(jié)構(gòu)確證49-51
- 4.2.5 1,16,2(2-呋喃)-2,6,11,15-四氮雜十六烷的結(jié)構(gòu)確證51-53
- 4.2.6 1,16,2(2-吡咯)-2,6,11,15-四氮雜十六烷的結(jié)構(gòu)確證53-55
- 4.3 結(jié)論與討論55-56
- 5 化合物對人肝癌細胞HepG2體外抑制作用試驗56-70
- 5.1 實驗材料與試劑56-57
- 5.1.1 材料56
- 5.1.2 培養(yǎng)基,藥物的配制56-57
- 5.2 實驗方法57-58
- 5.2.1 細胞解凍與培養(yǎng)57
- 5.2.2 細胞傳代57
- 5.2.3 細胞凍存57-58
- 5.3 MTT實驗58-70
- 5.3.1 篩選化合物作用濃度58-62
- 5.3.1.1 實驗分組58
- 5.3.1.2 實驗步驟58-59
- 5.3.1.3 結(jié)果與分析59-62
- 5.3.1.4 結(jié)論與討論62
- 5.3.2 測6個化合物和陽性藥物 5-氟尿嘧啶(5-FU)對HepG2細胞在24h,,48,72h下的抑制率62-70
- 5.3.2.1 實驗分組62
- 5.3.2.2 實驗步驟62-63
- 5.3.2.3 結(jié)果與分析63-67
- 5.3.2.4 結(jié)論與討論67-70
- 6 全文總結(jié)與展望70-72
- 6.1 全文總結(jié)70-71
- 6.2 展望71-72
- 致謝72-74
- 參考文獻74-78
- 附錄78-90
- 個人簡歷、在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及取得的研究成果90
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