本文關(guān)鍵詞：特異長(zhǎng)鏈非編碼RNA在鼻咽癌中的表達(dá)及其意義

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【摘要】：目的分析長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)在鼻咽癌與慢性鼻咽炎組織中表達(dá)水平的變化,尋找可能與鼻咽癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)的特異lnc RNA。方法采用lnc RNA芯片技術(shù)分析lnc RNA和m RNA在鼻咽癌與慢性鼻咽炎組織的表達(dá)譜,篩選差異表達(dá)的lnc RNA和m RNA,進(jìn)一步研究使用了聚類分析、GO分析、pathway分析等生物信息學(xué)技術(shù)。結(jié)果差異表達(dá)的lnc RNA(2倍以上變化且P0.05)共856條,其中上調(diào)的共425條,下調(diào)的共431條;差異表達(dá)的m RNA共767條,其中上調(diào)的共426條,下調(diào)的共341條。利用聚類分析方法將差異表達(dá)的lnc RNA分成3類:增強(qiáng)子型lnc RNA、HOX基因簇、基因間lnc RNA。GO分析將m RNA分成3類:生物學(xué)過(guò)程類、細(xì)胞組分類、分子功能類。Pathway分析顯示m RNA共參與28條信號(hào)通路,其中參與細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用信號(hào)通路的上調(diào)差異表達(dá)的m RNA的富集度最高。結(jié)論與慢性鼻咽炎相比,lnc RNA在鼻咽癌組織的表達(dá)水平明顯改變,提示差異表達(dá)的lnc RNA可能與鼻咽癌的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。
【作者單位】： 福建醫(yī)科大學(xué)協(xié)和臨床醫(yī)學(xué)院;廈門大學(xué)附屬中山醫(yī)院耳鼻咽喉科;
【關(guān)鍵詞】： 鼻咽癌 長(zhǎng)鏈非編碼RNA 長(zhǎng)鏈非編碼RNA芯片
【基金】：福建省自然科學(xué)基金(2013D003) 廈門市科技局科技惠民項(xiàng)目(3502Z20134019)
【分類號(hào)】：R739.63
【正文快照】： 0引言鼻咽癌是中國(guó)南方及東南亞地區(qū)發(fā)病率較高的一種惡性腫瘤,其在廣東省的發(fā)病率大約是歐洲和北美的100倍[1]。鼻咽癌起病隱匿、早期診斷困難,大多數(shù)患者就診時(shí)已達(dá)中晚期。近年來(lái),盡管鼻咽癌的診治水平有了較大的提高,但鼻咽癌患者的5年生存率仍只有70%左右[2]。目前,鼻咽

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：978606