喉癌線粒體DNA D-loop區(qū)突變的檢測和分析
發(fā)布時間:2017-09-26 22:37
本文關鍵詞:喉癌線粒體DNA D-loop區(qū)突變的檢測和分析
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【摘要】:目的: 線粒體(mitochondria)是迄今發(fā)現(xiàn)的唯一不依賴核基因組進行復制、轉錄和翻譯的細胞器。近年來,線粒體DNA(mtDNA)的改變與人類腫瘤發(fā)生的關系備受關注,越來越多的研究證明mtDNA的突變與腫瘤的發(fā)生關系密切,尤以D-loop區(qū)的突變率最高。mtDNA D-loop區(qū)位于16024~576bp之間,占全部mtDNA的6%左右,主要負責調(diào)控mtDNA的轉錄和復制。本研究中我們通過檢測與分析喉癌組織中mtDNAD-loop區(qū)突變情況,進而闡述mtDNA D-loop區(qū)的突變與喉癌發(fā)生的關系。 方法: 以吉林大學第二醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科手術治療的40名喉癌患者為研究對象,年齡在45歲-75歲之間,其中男性28例,女性12例,術中切取病人的腫瘤組織及相應的癌旁組織,總計80例標本,置于負80度冰柜凍存?zhèn)溆,通過提取組織標本的DNA,利用PCR擴增、產(chǎn)物純化和直接測序等技術,,運用美國NCBI數(shù)據(jù)庫的基因序列分析軟件,將腫瘤組織mtDNA D-loop區(qū)序列和癌旁組織的序列與目前公認的劍橋標準序列進行比對(BLAST),找出mtDNA D-loop區(qū)的高發(fā)突變位點及高頻率的多態(tài)性改變,總結并分析mtDNA D-loop區(qū)突變與喉癌發(fā)生的關系。 結果: 在40例喉癌患者中,有18例發(fā)生突變,突變率是45%,突變多集中在HVⅠ區(qū),突變的類型主要表現(xiàn)為單個堿基的替換或單個堿基的插入和缺失,發(fā)現(xiàn)20個微衛(wèi)星不穩(wěn)定現(xiàn)象,主要集中在D310區(qū),共發(fā)現(xiàn)多態(tài)性改變102個,單個標本最多發(fā)現(xiàn)多態(tài)性改變位點8個。 結論: 喉癌組織mtDNA突變率明顯高于正常組織,喉癌mtDNA D-loop區(qū)具有高度的多態(tài)性和突變性,對mtDNA D-loop區(qū)突變的檢測有望應用于腫瘤的早期診斷。
【關鍵詞】:喉癌 線粒體DNA D-loop 多態(tài)性
【學位授予單位】:吉林大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2013
【分類號】:R739.65
【目錄】:
- 中文摘要4-6
- Abstract6-11
- 第1章 引言11-13
- 第2章 文獻綜述13-19
- 2.1 綜述一線粒體 DNA 及 D-LOOP 區(qū)的概述13-15
- 2.2 綜述二線粒體 DNA D-LOOP 區(qū)突變與腫瘤的關系的研究進展15-17
- 2.3 綜述三線粒體 DNA D-LOOP 區(qū)突變對腫瘤細胞表型的影響17-19
- 第3章 資料與方法19-27
- 3.1 材料19-20
- 3.1.1 喉癌組織及癌旁組織標本19
- 3.1.2 試劑及來源19
- 3.1.3 實驗所需的主要儀器及設備19-20
- 3.2 實驗方法20-22
- 3.2.1 喉癌組織線粒體 DNA 的提取20-21
- 3.2.2 引物的設計與合成21
- 3.2.3 PCR 反應21
- 3.2.4 PCR 產(chǎn)物的電泳21
- 3.2.5 基因測序21-22
- 3.3 結果22-27
- 3.3.1 mtDNA PCR 產(chǎn)物擴增結果22
- 3.3.2 測序結果及分析22-27
- 第4章 討論27-30
- 第5章 結論30-31
- 參考文獻31-36
- 作者簡介及在學期間所取得的科研成果36-37
- 致謝37
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 陳道楨,薛文群,楊幼易,耿金花,陸以農(nóng),陸肖瑋,王峻峰,印永祥,孟西娜;宮頸癌線粒體DNA D-Loop區(qū)基因突變的研究[J];腫瘤;2005年04期
本文編號:926143
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