本文關(guān)鍵詞：DNA微陣列篩查預(yù)測(cè)鼻咽癌患者預(yù)后基因的研究

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【摘要】：目的：研究使用DNA微陣列對(duì)不同預(yù)后的鼻咽癌組織的差異表達(dá)基因進(jìn)行篩查,尋找預(yù)測(cè)鼻咽癌預(yù)后相關(guān)的標(biāo)志基因群,對(duì)鼻咽癌預(yù)后的準(zhǔn)確預(yù)測(cè)及個(gè)體化治療提供幫助。 方法：利用能夠檢測(cè)14112個(gè)人類基因的cDNA微陣列,對(duì)20例預(yù)后不同的鼻咽癌患者組織樣本進(jìn)行表達(dá)譜分析,將生存超過(guò)3年與5年作為判斷預(yù)后的兩個(gè)時(shí)間窗口,其中將存活期小于等于3年者8例,存活期大于3年者12例作為A組進(jìn)行對(duì)比分析,將存活期小于等于5年者9例,存活期大于5年者11例作為B組進(jìn)行對(duì)比分析。使用ScanArray4000對(duì)微陣列進(jìn)行掃描,GenePix Pro3.0軟件被用于微陣列信號(hào)強(qiáng)度的分析和篩選。在完成微陣列數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化處理之后,進(jìn)行T-test和two-class unpaired SAM多重統(tǒng)計(jì)分析,利用SAM及Cluster軟件對(duì)A組與B組進(jìn)行差異基因的聚類分析。 結(jié)果：1、對(duì)2組不同預(yù)后的樣本進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn)不同預(yù)后的鼻咽癌患者腫瘤組織存在著基因表達(dá)的差異。在A組中當(dāng)P0.05,差異表達(dá)基因412個(gè),P0.01；差異表達(dá)基因85個(gè)；P0.001,差異表達(dá)基因5個(gè)。在B組中當(dāng)P0.05,差異表達(dá)基因364個(gè)；P0.01,差異表達(dá)基因65個(gè)；P0.001,發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因4個(gè)。 2、通過(guò)利用two-class unpaired SAM與T-test多重生物信息分析法,對(duì)A組與B組不同預(yù)后鼻咽癌患者的鼻咽癌組織中差異表達(dá)基因進(jìn)行非監(jiān)督聚類分析,A組發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因10個(gè),包括J2SURP(XM_031553),RINT1(NM_021930), RFX4(NM_002920), AZIN1(NM_015878),FAM21C(NM_015262),RAB25(NM_020387),EIF1B(NM_005875),KRT31(NM_002277), BRD7(NM_013263), NRD1(NM_002525)等基因,B組發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因4個(gè),包括U2SURP (XM_031553), RINT1(NM_021930), NRD1(NM_002525),NEK6(NM_014397)。其中NRD1(NM_002525)、U2SURP (XM_031553、RINT1(NM_021930)等3個(gè)基因在兩組的分析中均有獲得。 3、初步確定11個(gè)基因作為預(yù)測(cè)鼻咽癌預(yù)后的基因群。能很好的把鼻咽癌患者分為預(yù)后良好組與預(yù)后不良組。包括U2SURP (XM_031553)、RINT1(NM_021930)、AZIN1(NM_015878)等5個(gè)基因在預(yù)后差的鼻咽癌患者中表達(dá)水平上調(diào),FAM21C(NM_015262)、RAB25(NM_020387)、EIF1B (NM_005875)等6個(gè)基因在預(yù)后良好的鼻咽癌患者中表達(dá)水平升高。其中基因NM002525(NRD1)的表達(dá)值最為穩(wěn)定,在3年期與5年期不同生存預(yù)后的兩組中均有明顯的差異表達(dá)。其他10個(gè)基因表達(dá)較不穩(wěn)定,出錯(cuò)率較高,需要結(jié)合使用。 結(jié)論：1、發(fā)現(xiàn)預(yù)后不同的鼻咽癌患者腫瘤組織中基因表達(dá)存在明顯差異。2、可以通過(guò)差異基因?qū)Σ煌A(yù)后鼻咽癌患者分為預(yù)后良好與預(yù)后不良兩類。3、初步確定11個(gè)基因作為預(yù)測(cè)鼻咽癌預(yù)后的基因群,這些基因可能通過(guò)細(xì)胞因子及免疫反應(yīng)、體液免疫、細(xì)胞增殖、受體蛋白信號(hào)等多種生物學(xué)通路影響鼻咽癌細(xì)胞增殖、凋亡和分化,進(jìn)而影響鼻咽癌患者的預(yù)后生存。4、NRD1基因可能是預(yù)測(cè)鼻咽癌預(yù)后的關(guān)鍵基因。其預(yù)測(cè)鼻咽癌預(yù)后與臨床分期無(wú)關(guān),可能是與基因的生物特性有關(guān)。
【關(guān)鍵詞】：鼻咽癌 DNA微陣列 預(yù)后 基因表達(dá)
【學(xué)位授予單位】：廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類號(hào)】：R739.63
【目錄】：

• 主要中英文~.略詞4-5
• 摘要5-7
• ABSTRACT7-10
• 前言10-15
• 材料和方法15-25
• 結(jié)果25-38
• 討論38-43
• 參考文獻(xiàn)43-50
• 附錄50-51
• 綜述51-73
• 參考文獻(xiàn)64-73
• 致謝73

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 華貽軍,洪明晃,羅東華,邱枋,郭靈,張國(guó)義;406例鼻咽癌患者預(yù)后多因素分析[J];中國(guó)腫瘤臨床;2005年08期

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本文編號(hào)：803276