鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)是一種起源于鼻咽上皮細(xì)胞的惡性腫瘤,其惡性程度較高,具有極強的轉(zhuǎn)移能力。早期鼻咽癌患者的癥狀往往缺乏或非特異性,顯著降低了診斷和預(yù)測鼻咽癌發(fā)展的準(zhǔn)確性,臨床NPC經(jīng)常在晚期診斷,診斷后存活率相對較低。因此,研究鼻咽癌發(fā)病發(fā)展的分子機制,尋找用于鼻咽癌早期診斷、個體化治療及預(yù)后評估的分子標(biāo)記物有著極其重要的的臨床指導(dǎo)意義。近年來,用于分析基因表達(dá)的高通量平臺,如微陣列技術(shù),廣泛用于獲取腫瘤發(fā)生過程中的主要遺傳突變。根據(jù)文獻(xiàn)報道,鼻咽癌的許多基因表達(dá)分析涉及微陣列技術(shù),并鑒定了許多差異表達(dá)基因的信號通路,分子功能或生物過程。然而,比較分析表明獨立研究中的DEGs(Differentially expressed genes)幾乎沒有重疊,從正常組織中沒有確定鼻咽癌組織的可靠生物標(biāo)志物。盡管取得了這樣的進展,相互作用網(wǎng)絡(luò)中的DEGs與信號通路的相互作用機制仍不清楚。因此,利用大數(shù)據(jù)生物信息學(xué)分析方法,挖掘和整合數(shù)據(jù),獲取鼻咽癌相關(guān)的差異表達(dá)基因和信號通路,預(yù)測主要生物標(biāo)記物來促進鼻咽癌的早期診斷和治療,具有重要的現(xiàn)實意義。生物...

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【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1-1DAVID6.8分析界面

?第一章前言???相互作用網(wǎng)絡(luò)的的改變可能明確調(diào)整了疾病相關(guān)途徑，基于此，在藥物發(fā)現(xiàn)研??宄中，能夠突破傳統(tǒng)的基于單個靶蛋白的簡單抑制和激活功能的藥物篩選方??式，提供了藥物發(fā)現(xiàn)的新途徑。因此，蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)在分子生物學(xué)研宄??中具有極為重要的作用。??１１

圖２－２?ＧＥ０２Ｒ的分析界面圖??Ｆｉｇｕｒｅ?２－２?Ａｎａｌｙｓｉｓ?ｉｎｔｅｒｆａｃｅ?ｏｆ?ＧＥ０２Ｒ??

具體分析步驟如下：??登陸ＤＡＶＩＤ網(wǎng)站首頁ｒｈｔｔｐｓ：／／ｄａｖｉｄ．ｎｃｉｆｃｒｆ．ｇｏｖＡ），點擊頁面左上角??“Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ?Ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ＇１功能選項進入功能注解工具界面，如圖２－３所７Ｋ。通過??頁面左側(cè)藍(lán)色面板區(qū)域“ｕｐｌｏａｄ”上傳基因列表，并按照....

圖2-3FunctionalAnnotation工具分析界面

?第二章鼻咽癌相關(guān)差異表達(dá)基因的生物信息學(xué)技術(shù)分析???Ｓｔｅｐ?４：?Ｓｕｂｍｉｔ?Ｌｉｓｔ，提交列表，頁面會從“Ｕｐｌｏａｄ”自動跳到“Ｌｉｓｔ”面板。用??戶可以看到基因的物種以及對應(yīng)的基因數(shù)，此外，還可以管理列表進行應(yīng)用、??重命名、刪除、合并列表、顯示基因列表等操作。選....

圖２－８ＧＳＥ１２４５２和ＧＳＥ１３５９７?（１００個上調(diào)基因和１００個下調(diào)基因）前２００個差異表達(dá)基??因的熱圖

６?、、…??圖２－７鼻咽癌差異表達(dá)基因的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖??Ｆｉｇｕｒｅ?２－７?Ｐｒｏｔｅｉｎ?Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｎｇ?Ｎｅｔｗｏｒｋ?ｏｆ?Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?Ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?Ｇｅｎｅｓ?ｉｎ?ＮＰＣ??（４）下載差異表達(dá)基因的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖中的蛋白質(zhì)節(jié)點列表，....

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