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WES篩查RP致病基因PRPF31新位點(diǎn)及RP候選基因EMC9的功能研究

發(fā)布時(shí)間:2021-08-20 19:51
  視網(wǎng)膜色素變性(retinitis pigmentosa,RP)是一種遺傳性眼部疾病,它最終會(huì)導(dǎo)致失明。目前已鑒定了超過70個(gè)RP基因,但仍有35%45%的RP病人無法用已知基因解釋,根據(jù)該疾病的相關(guān)研究提示還有很多未知RP基因等待鑒定;谖覀儗(duì)RP復(fù)雜發(fā)病機(jī)制的認(rèn)識(shí)不清晰,目前尚缺乏并且公認(rèn)有效的干預(yù)手段來防治RP。對(duì)RP致病基因新突變及新型候選基因的發(fā)現(xiàn)是首要目的,對(duì)RP分子診斷、治療方向和分子遺傳學(xué)研究具有重要意義。然而傳統(tǒng)Sanger測(cè)序已經(jīng)無法滿足需求,其費(fèi)用高額、耗時(shí)巨大、且無法獲取未知致病基因,隨著二代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,全外顯子測(cè)序(whole exome sequencing,WES)運(yùn)用在疾病研究中成功案例越來越多,它們逐漸成為疾病研究中極為常用的篩查手段,它們具有高的靈敏度,低成本投入等優(yōu)點(diǎn),值得一提的是WES可以檢測(cè)到未知致病基因。在此研究中,我們利用WES對(duì)收集到的家系及散發(fā)患者篩查,得到RP已知致病基因的一個(gè)新致病突變位點(diǎn)、一個(gè)候選致病突變位點(diǎn)和一個(gè)常染色體隱性遺傳(arRP)候選基因:(1)在中國(guó)人群中,我們檢測(cè)到常染色體顯性遺傳(ad... 

【文章來源】:電子科技大學(xué)四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 緒論
    1.1 視網(wǎng)膜色素變性的臨床研究
        1.1.1 視網(wǎng)膜與視網(wǎng)膜色素變性
        1.1.2 典型RP的臨床特征及鑒定
    1.2 視網(wǎng)膜色素變性的治療方向
    1.3 視網(wǎng)膜色素變性的遺傳異質(zhì)性
        1.3.1 遺傳方式多樣化
        1.3.2 致病基因多樣化
        1.3.3 基因突變多樣化
    1.4 視網(wǎng)膜色素變性相關(guān)疾病
    1.5 NGS和WES
    1.6 本論文的主要工作
    1.7 本論文的結(jié)構(gòu)安排
第二章 實(shí)驗(yàn)與方法
    2.1 WES篩查RP致病基因PRPF31新位點(diǎn)
        2.1.1 研究對(duì)象
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.3 主要的實(shí)驗(yàn)方法與步驟
    2.2 RP候選基因EMC9的功能研究
        2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.2.2 實(shí)驗(yàn)方法和步驟
    2.3 本章小結(jié)
第三章 結(jié)果
    3.1 WES篩查RP致病基因PRPF31新位點(diǎn)
        3.1.1 WES測(cè)序及Sanger測(cè)序驗(yàn)證
        3.1.2 突變位點(diǎn)的生物信息學(xué)分析
    3.2 RP候選基因EMC9的功能研究
        3.2.1 EMC9基因及其致病位點(diǎn)生物信息學(xué)分析
        3.2.2 EMC9基因突變型表達(dá)載體的構(gòu)建
        3.2.3 EMC9基因突變型蛋白表達(dá)和定位的檢測(cè)
        3.2.4 EMC9基因在人和小鼠各組織中的表達(dá)情況
    3.3 本章小結(jié)
第四章 討論
    4.1 WES篩查RP致病基因PRPF31新位點(diǎn)
    4.2 RP候選基因EMC9的功能研究
    4.3 本章小結(jié)
第五章 結(jié)論與展望
    5.1 WES篩查RP致病基因PRPF31新位點(diǎn)
        5.1.1 本文的主要貢獻(xiàn)
        5.1.2 展望
    5.2 RP候選基因EMC9的功能研究
        5.2.1 本文的主要貢獻(xiàn)
        5.2.2 展望
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間取得的成果


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]A novel mutation in PRPF31, causative of autosomal dominant retinitis pigmentosa, using the BGISEQ-500 sequencer[J]. Yu Zheng,Hai-Lin Wang,Jian-Kang Li,Li Xu,Laurent Tellier,Xiao-Lin Li,Xiao-Yan Huang,Wei Li,Tong-Tong Niu,Huan-Ming Yang,Jian-Guo Zhang,Dong-Ning Liu.  International Journal of Ophthalmology. 2018(01)
[2]A COMPLETE SCREEN FOR MUTATIONS OF THE RHODOPSIN GENE IN A PANEL OF CHINESE PATIENTS WITH AUTOSOMAL DOMINANT RETINITIS PIGMENTOSA[J]. Xiao-li Zhang1,Ming Liu2,Xiao-hong Meng3,Wei-ling Fu1*,Zheng-qin Yin3,Xue Zhang1,and Jun-fu Huang11Clinical Laboratory Center,2Department of Cardio-thoracic Surgery,3Department of Ophthalmology and Visual Sciences,Affiliated South-West Hospital,Third Military Medical University,Chongqing 400038.  Chinese Medical Sciences Journal. 2005(01)
[3]幾種主要眼遺傳病在我國(guó)的發(fā)病情況與遺傳規(guī)律[J]. 胡誕寧.  遺傳學(xué)報(bào). 1988(03)



本文編號(hào):3354123

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