ERAP1、ERAP2、RUNX3基因多態(tài)性與強(qiáng)直性脊柱炎和急性前葡萄膜炎遺傳易感性的研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-18 07:43
背景:急性前葡萄膜炎(acute anterior uveitis,AAU)常見的兩種形式為特發(fā)性急性前葡萄膜炎(Idiopathic acute anterior uveitis,IAAU)和強(qiáng)直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)伴發(fā)的急性前葡萄膜炎(AS+AAU+)。隨著AS病程的延長,AAU的病發(fā)率出現(xiàn)持續(xù)增加。全基因組關(guān)聯(lián)分析(genome-wide association study,GWAS)研究顯示ERAP1、ERAP2和RUNX3基因多態(tài)性與歐洲高加索人的AS及AAU易感性相關(guān),而且ERAP1和HLA-B27的聯(lián)合風(fēng)險(xiǎn)在人群中高達(dá)70%。RUNX3和ERAP1、ERAP2在T細(xì)胞的發(fā)育、分化和功能中發(fā)揮著重要的作用,AS和AAU均被認(rèn)為是由T細(xì)胞介導(dǎo)的自身免疫性疾病。國際上關(guān)于ERAP1基因?qū)S的易感性研究較為深入。然而,關(guān)于ERAP1、ERAP2和RUNX3基因多態(tài)性與中國漢族人的AAU和AS的相關(guān)性研究很少而且結(jié)果并不一致。目的:本項(xiàng)研究目的在于通過大樣本再次評(píng)估ERAP1、ERAP2和RUNX3 單核苷酸多態(tài)性(Single nucl...
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁數(shù)】:116 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1?Sequenom?Mass?ARRAY?SNP分型質(zhì)控?紅色表示質(zhì)譜儀無法識(shí)別的樣本,綠色代表??能夠識(shí)別的樣本,顏色越深表示識(shí)別率越高
rs7551188、rs9438876)。本實(shí)驗(yàn)采用了大樣本來驗(yàn)證這些位點(diǎn)與中國漢族人AS的??患病分險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性。實(shí)驗(yàn)所選定的17個(gè)SNP均成功分型。17個(gè)SNP總體質(zhì)量控??制結(jié)果如圖1.1。單個(gè)SNP質(zhì)譜法分型結(jié)果均良好,以rs30187位點(diǎn)的基因分型為??例見圖1.2。??1丨2:3|4|5|6|7丨8|9.?|10丨11|12|13|14|15|16丨17|18丨19丨船1?22:23丨24??籲??????????????參?????????參???參參參????????????C???????????攀參肇?參??參????D?????????肇參?參⑩???????????????????????參參???¥參參?■???參肇?.。????I?參??參???⑩?????????!?????丄??????參??籲?參參??????參??\?參拳??拳攀參_??????參參_??拳??丄?參?參?⑩肇???■?參???M??????參?肇??肇參????_?????????參?參??肇?J?參《???0??????⑩??參■籲鐮參??肇??上|蟓《**?##參》???攀參參???》_??參???圖1.1?Sequenom?Mass?ARRAY?SNP分型質(zhì)控?紅色表示質(zhì)譜儀無法識(shí)別的樣本,綠色代表??能夠識(shí)別的樣本,顏色越深表示識(shí)別率越高。??Figl.l?Quality?control?of?Sequnom?Mass?ARRAY?SNP.?Red?indicates?sample?that?cannot?be??recognized
基因較近的連鎖現(xiàn)象。這是發(fā)現(xiàn)致病基因的一種手段。本次實(shí)驗(yàn)我們分析了??ERAP1、ERAP2基因區(qū)及附近11個(gè)SNP位點(diǎn),因此,進(jìn)一步分析了這11個(gè)位點(diǎn)??可能的單倍型及可能的致病性的單倍型。圖1.3顯示了?11個(gè)SNP位點(diǎn)中有多個(gè)基??因位點(diǎn)存在完全連鎖現(xiàn)象(rs27037/rs27980/rs27582,rs30187/rs27434,??rs2549782/2248374?),也即形成了?rs27037/rs27980/rs27582,rs30187/rs27434?和??rs2549782/2248374三個(gè)單倍型。單倍型分析我們采用HaploView4.2軟件進(jìn)行分析。??結(jié)果顯示未發(fā)現(xiàn)有單倍型與AS的疾病易感性相關(guān)聯(lián),結(jié)果見表1.5。??.卜?O?(M?1?S??S?ft?Si?°?ts?°?m?S?S3?53????xwwmvtmtfixxwm??I?Block?1?(3?kb)?|?日lock?2?t5?kb)?I?Block?3?(4?kb)??L?1?8?11?J?51?77?93?L?127?158?丄?682?720?J?1121??i?65?▼?59?B8?7EI?▼??67?^?73?59?79??▼?靄、B???2s?'?73??;v:?50?29?83??51?50??^?65?51?60??65?:_6:2.??74??圖1.3ERAP1、ERAP2基因位置示意圖。強(qiáng)烈的連鎖不平衡(rs27037/rs27980/rs27S82,??33??
本文編號(hào):2923637
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁數(shù)】:116 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1?Sequenom?Mass?ARRAY?SNP分型質(zhì)控?紅色表示質(zhì)譜儀無法識(shí)別的樣本,綠色代表??能夠識(shí)別的樣本,顏色越深表示識(shí)別率越高
rs7551188、rs9438876)。本實(shí)驗(yàn)采用了大樣本來驗(yàn)證這些位點(diǎn)與中國漢族人AS的??患病分險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性。實(shí)驗(yàn)所選定的17個(gè)SNP均成功分型。17個(gè)SNP總體質(zhì)量控??制結(jié)果如圖1.1。單個(gè)SNP質(zhì)譜法分型結(jié)果均良好,以rs30187位點(diǎn)的基因分型為??例見圖1.2。??1丨2:3|4|5|6|7丨8|9.?|10丨11|12|13|14|15|16丨17|18丨19丨船1?22:23丨24??籲??????????????參?????????參???參參參????????????C???????????攀參肇?參??參????D?????????肇參?參⑩???????????????????????參參???¥參參?■???參肇?.。????I?參??參???⑩?????????!?????丄??????參??籲?參參??????參??\?參拳??拳攀參_??????參參_??拳??丄?參?參?⑩肇???■?參???M??????參?肇??肇參????_?????????參?參??肇?J?參《???0??????⑩??參■籲鐮參??肇??上|蟓《**?##參》???攀參參???》_??參???圖1.1?Sequenom?Mass?ARRAY?SNP分型質(zhì)控?紅色表示質(zhì)譜儀無法識(shí)別的樣本,綠色代表??能夠識(shí)別的樣本,顏色越深表示識(shí)別率越高。??Figl.l?Quality?control?of?Sequnom?Mass?ARRAY?SNP.?Red?indicates?sample?that?cannot?be??recognized
基因較近的連鎖現(xiàn)象。這是發(fā)現(xiàn)致病基因的一種手段。本次實(shí)驗(yàn)我們分析了??ERAP1、ERAP2基因區(qū)及附近11個(gè)SNP位點(diǎn),因此,進(jìn)一步分析了這11個(gè)位點(diǎn)??可能的單倍型及可能的致病性的單倍型。圖1.3顯示了?11個(gè)SNP位點(diǎn)中有多個(gè)基??因位點(diǎn)存在完全連鎖現(xiàn)象(rs27037/rs27980/rs27582,rs30187/rs27434,??rs2549782/2248374?),也即形成了?rs27037/rs27980/rs27582,rs30187/rs27434?和??rs2549782/2248374三個(gè)單倍型。單倍型分析我們采用HaploView4.2軟件進(jìn)行分析。??結(jié)果顯示未發(fā)現(xiàn)有單倍型與AS的疾病易感性相關(guān)聯(lián),結(jié)果見表1.5。??.卜?O?(M?1?S??S?ft?Si?°?ts?°?m?S?S3?53????xwwmvtmtfixxwm??I?Block?1?(3?kb)?|?日lock?2?t5?kb)?I?Block?3?(4?kb)??L?1?8?11?J?51?77?93?L?127?158?丄?682?720?J?1121??i?65?▼?59?B8?7EI?▼??67?^?73?59?79??▼?靄、B???2s?'?73??;v:?50?29?83??51?50??^?65?51?60??65?:_6:2.??74??圖1.3ERAP1、ERAP2基因位置示意圖。強(qiáng)烈的連鎖不平衡(rs27037/rs27980/rs27S82,??33??
本文編號(hào):2923637
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/yank/2923637.html
最近更新
教材專著