【摘要】：目的:應(yīng)用基因芯片技術(shù),研究喉鱗狀細(xì)胞癌中miRNA的表達(dá)譜,篩選喉鱗癌和癌旁正常中組織差異表達(dá)的miRNA,尋找可能的分子生物學(xué)指標(biāo)。方法:選取2008-06-01-2009-04-30中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院8例喉鱗癌及其配對的癌旁正常組織(距腫瘤組織1cm),Trizol法提取總RNA,經(jīng)Cy3熒光標(biāo)記后與含有人723條miRNA探針的芯片進(jìn)行雜交,篩選在喉鱗癌和癌旁正常組織中差異表達(dá)的miRNA。結(jié)果:喉鱗癌及癌旁組織中提取的總RNA均符合芯片雜交要求,RNA完整性評分1.8~2.1;共有132個(gè)miRNA在8例喉鱗癌患者中均有表達(dá)。喉鱗癌和癌旁正常組織中差異表達(dá)的miRNA有53個(gè),其中22個(gè)出現(xiàn)上調(diào),31個(gè)出現(xiàn)下調(diào),差異表達(dá)≥5倍的miRNA共有8個(gè),上調(diào)的有miR-196b、miR-196a、miR-7和miR-183,下調(diào)的有miR-375、miR-139-5p、miR-338-3p和miR-370,其中miR-196b、miR-196a和miR-375差異表達(dá)≥8倍。采用TargetScan、Pictar、miRanda和MirTarget2等4種算法數(shù)據(jù)庫預(yù)測這8種差異表達(dá)的miRNA的靶基因,4種數(shù)據(jù)庫中均預(yù)測到的靶基因共183個(gè)。結(jié)論:通過基因芯片的方法,篩選到喉鱗癌和癌旁組織中差異表達(dá)的miRNA,對其中明顯差異表達(dá)的miRNA及其靶基因的深入研究有可能找到新的喉鱗癌分子腫瘤學(xué)標(biāo)志,為進(jìn)一步研究喉鱗癌發(fā)病機(jī)制打下基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective: to study the expression of miRNA in laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC) by using gene chip technique, and to screen the differentially expressed miRNA, in laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC) and adjacent normal tissues to find possible molecular biological markers. Methods: eight patients with laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC) and their matched adjacent normal tissues were selected from Cancer Hospital of the Chinese Academy of Medical Sciences from January 2008-01-2009-04-30. Total RNA, was extracted by 1cm), Trizol method from tumor tissues. Cy3 labeled microarray containing 723 human miRNA probes was used to screen differentially expressed miRNA. in laryngeal squamous cell carcinoma and adjacent normal tissues. Results: the total RNA extracted from laryngeal squamous cell carcinoma and adjacent tissues met the requirement of chip hybridization, and the RNA integrity score was 1.8m2.1.A total of 132 miRNA were expressed in 8 cases of laryngeal squamous cell carcinoma. There were 53 miRNA differentially expressed in laryngeal squamous cell carcinoma and adjacent normal tissues, of which 22 were up-regulated and 31 down-regulated. There were 8 miRNA whose differential expression was more than 5 times, and miR-196b,miR-196a,miR-7 and miR-183, were up-regulated. The expression of miR-196b,miR-196a and miR-375 was more than 8 times lower than that of miR-375,miR-139-5p,miR-338-3p and miR-370,. The target genes of the eight differentially expressed miRNA were predicted by TargetScan,Pictar,miRanda and MirTarget2, and 183 target genes were predicted in each of the four databases. Conclusion: the differential expression of miRNA, in laryngeal squamous cell carcinoma and paracancerous tissues was screened by the method of gene microarray. The further study of miRNA and its target gene in laryngeal squamous cell carcinoma may find a new molecular oncology marker of laryngeal squamous cell carcinoma. To lay a foundation for further study of the pathogenesis of laryngeal squamous cell carcinoma.
【作者單位】： 深圳市第二人民醫(yī)院;深圳大學(xué)第一附院耳鼻喉科;中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院頭頸外科;中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤研究所病因與癌變研究室;
【分類號(hào)】：R739.65

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2416499