【摘要】：[目的] 應(yīng)用候選基因篩查方法對湖北省襄樊市一Bardet-Biedl綜合征家系進(jìn)行致病基因排除定位。 [材料和方法] 1.通過家系調(diào)查收集家系臨床資料。 2.抽取家系成員外周血并提取全血基因組DNA。 3.查閱文獻(xiàn)及網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫,確定已知的發(fā)病率高的BBS致病基因?yàn)楹蜻x基因。 4.對于所選取的候選基因BBS1、BBS2、BBS4、MKKS/BBS6、BBS7、 TTC8/BBS8、B1/BBS9、BBS10、BBS12、MKS1/BBS13基因所有外顯子設(shè)計(jì)引物,將先證者基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增后直接測序,通過與網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,明確有無突變。 [結(jié)果] 家系臨床研究結(jié)果：YFM家系疾病為確診的Bardet-Biedl綜合征,為常染色體隱性遺傳病。 對于先證者BBS1、BBS2、MKKS/BBS6、BBS7、TTC8/BBS8、B1/BBS9、 BBS10、BBS12、MKS1/BBS13基因所有外顯子編碼區(qū)直接測序結(jié)果顯示,未發(fā)現(xiàn)致病性突變。 先證者BBS4基因第13外顯子編碼區(qū)有一雜合性突變導(dǎo)致BBS4蛋白發(fā)生I354T突變,但經(jīng)生物信息學(xué)方法預(yù)測,此突變對于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能影響不大。且該突變不與家系中患者共分離,亦未發(fā)現(xiàn)純合性突變或復(fù)合雜合性突變,故不是YFM家系的致病性突變。 [結(jié)論] YFM家系致病基因可能為罕見基因或一個新的基因。
[Abstract]:[objective] to locate the pathogenicity gene of a Bardet-Biedl syndrome family in Xiangfan, Hubei province by candidate gene screening method. [materials and methods] 1. Family clinical data were collected through family investigation. 2. Extraction of Peripheral Blood from Family members and extraction of Genomic DNA. from whole Blood 3. Literature and web databases were reviewed to identify known BBS pathogenic genes as candidate genes. 4. Primers were designed for all exons of the selected candidate gene BBS1,BBS2,BBS4,MKKS/BBS6,BBS7, TTC8/BBS8,B1/BBS9,BBS10,BBS12,MKS1/BBS13 gene. The proband genomic DNA was amplified by PCR and sequenced directly. By comparing with the network database, it is clear whether there is a mutation. Results: YFM family disease was diagnosed as Bardet-Biedl syndrome and autosomal recessive disease. Direct sequencing of all exons of the probands BBS1,BBS2,MKKS/BBS6,BBS7,TTC8/BBS8,B1/BBS9, BBS10,BBS12,MKS1/BBS13 gene showed that no pathogenicity mutation was found. A heterozygous mutation in the coding region of exon 13 of the proband BBS4 gene led to the I354T mutation of BBS4 protein, but this mutation had little effect on the protein structure and function by bioinformatics method. The mutation was not isolated from the patients in the family, nor was homozygous mutation or compound heterozygosity mutation, so it was not the pathogenicity mutation of YFM pedigree. [conclusion] the pathogenic gene of YFM family may be a rare gene or a new gene.
【學(xué)位授予單位】：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2011
【分類號】：R596;R771.3

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號：2373790