【摘要】：目的利用目標(biāo)序列捕獲(Targeted sequence capture)、生物編碼(Barcode)及大規(guī)模平行測序(Massivelyparallel sequencing,MPS)技術(shù),對遺傳性耳聾患者進(jìn)行分子病因?qū)W研究,探索低成本、多基因、多樣本的耳聾基因檢測在臨床應(yīng)用的可行性。方法利用Illumina測序平臺對來自解放軍總醫(yī)院聾病分子診斷中心88例(來自61個(gè)家系)具有明確家族史且常見耳聾基因檢測陰性的耳聾患者,以及8例陽性對照患者進(jìn)行42種基因的目標(biāo)序列捕獲、Barcode和MPS,并對測序結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果利用上述方法在88個(gè)個(gè)體中大于一人入組家系中發(fā)現(xiàn)了10個(gè)家系8個(gè)基因(TECTA、DFNA5、CDH23、USH1C、MYO7A、POU3F4、SLC26A4、EYA4)14個(gè)位點(diǎn)的致病性突變。準(zhǔn)確驗(yàn)證了8個(gè)陽性對照。大于一人入組家系的致病基因檢出率明顯高于單人入組家系。結(jié)論高通量測序的發(fā)展為遺傳性耳聾的診斷帶來了巨大的機(jī)遇。目標(biāo)序列捕獲、Barcode、MPS的結(jié)合進(jìn)一步提高了測序的準(zhǔn)確性、降低了測序成本,同時(shí)生物信息學(xué)的進(jìn)步,將促進(jìn)低成本、多基因、多樣本的臨床耳聾基因檢測成為可能。
[Abstract]:Objective to study the molecular etiology of hereditary deafness patients by using target sequence capture (Targeted sequence capture), biocoding (Barcode) and large-scale parallel sequencing (Massivelyparallel sequencing,MPS) to explore low cost and multiple genes. The feasibility of multisample deafness gene detection in clinical application. Methods 88 deafness patients from the molecular diagnosis center of deafness in PLA General Hospital (61 families) with a clear family history and negative detection of common deafness genes were studied by Illumina sequencing platform. The target sequences of 42 genes were captured, Barcode and MPS, were analyzed by bioinformatics. Results the pathogenicity mutations at 14 loci of 8 genes (TECTA,DFNA5,CDH23,USH1C,MYO7A,POU3F4,SLC26A4,EYA4) in 10 families were found in more than one of 88 individuals. Eight positive controls were accurately verified. The detection rate of pathogenicity genes was significantly higher in families with more than one person. Conclusion the development of high-throughput sequencing presents great opportunities for the diagnosis of hereditary deafness. The combination of target sequence acquisition and Barcode,MPS further improves the accuracy of sequencing and reduces the cost of sequencing. At the same time, advances in bioinformatics will promote the detection of low cost, multi-gene and multi-sample clinical deafness genes.
【作者單位】： 解放軍總醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科;解放軍總醫(yī)院海南分院耳鼻咽喉頭頸外科;美國Emory大學(xué)耳鼻咽喉科;解放軍總醫(yī)院第一附屬醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科;解放軍二炮總醫(yī)院耳鼻咽喉科;
【基金】：十二五國家科技支撐計(jì)劃重點(diǎn)項(xiàng)目(No.2012BAI12B00/2012BAI12B01) 中國博士后基金及特別資助(No.20120481482&201104779) 北京市自然科學(xué)基金(No.7122172)
【分類號】：R764.43

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【共引文獻(xiàn)】

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相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

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本文編號：2276958