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豚鼠自身免疫性梅尼埃病相關(guān)抗原相對(duì)分子質(zhì)量68000蛋白的二維電泳和質(zhì)譜分析

發(fā)布時(shí)間:2018-08-09 13:15
【摘要】:目的:探尋導(dǎo)致豚鼠自身免疫性梅尼埃病模型的內(nèi)耳組織抗原成分中相對(duì)分子質(zhì)量為68 000的蛋白質(zhì)成分。方法:雙向凝膠電泳方法分離豚鼠內(nèi)耳組織抗原成分,用ImageMaster圖像分析軟件選擇相對(duì)分子質(zhì)量為68 000的蛋白質(zhì)點(diǎn),對(duì)這些蛋白質(zhì)點(diǎn)進(jìn)行質(zhì)譜分析,通過(guò)Mascot軟件查詢(xún)Swiss-prot數(shù)據(jù)庫(kù),利用PathwayStud io軟件對(duì)查詢(xún)到的蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析并選取蛋白進(jìn)行免疫印跡法驗(yàn)證。結(jié)果:獲得重復(fù)性和分辨率都較好的雙向電泳圖譜,軟件分析相對(duì)分子質(zhì)量為68 000蛋白共獲得22個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn);質(zhì)譜分析后查詢(xún)數(shù)據(jù)庫(kù)鑒定得到13個(gè)蛋白質(zhì)。這些蛋白分別與免疫、凋亡和分化等功能相關(guān),其中波形蛋白從相對(duì)分子質(zhì)量、Mascot評(píng)分和蛋白功能等方面綜合評(píng)估可能為相對(duì)分子質(zhì)量68 000蛋白中引起豚鼠自身免疫性梅尼埃病的主要蛋白。結(jié)論:成功獲得豚鼠自身免疫性梅尼埃病模型主要內(nèi)耳抗原成分中相對(duì)分子質(zhì)量68 000蛋白的雙向凝膠電泳圖譜,并應(yīng)用質(zhì)譜技術(shù)鑒定蛋白質(zhì)點(diǎn)。波形蛋白可能為相對(duì)分子質(zhì)量68 000蛋白中引起豚鼠自身免疫性梅尼埃病的主要蛋白。
[Abstract]:Aim: to explore the relative molecular weight of 68 000 proteins in the inner ear tissue antigen of guinea pig autoimmune Meniere disease model. Methods: the antigen components of guinea pig inner ear were separated by two dimensional gel electrophoresis. The protein spots with relative molecular weight of 68 000 were selected by ImageMaster image analysis software. The protein spots were analyzed by mass spectrometry, and the Swiss-prot database was queried by Mascot software. The protein was analyzed by bioinformatics using PathwayStud io software and the selected protein was verified by Western blotting. Results: two dimensional electrophoretic patterns with good reproducibility and resolution were obtained. The relative molecular weight of 68 000 protein was obtained by software, and 13 proteins were identified by querying the database after mass spectrometry analysis. These proteins are associated with immune, apoptosis and differentiation functions, respectively. Vimentin may be the main protein causing autoimmune Meniere disease in guinea pigs from the aspects of relative molecular weight Mascot score and protein function. Conclusion: Two-dimensional gel electrophoresis of relative molecular weight of 68000 protein in the main inner ear antigen components of guinea pig autoimmune Meniere disease model was successfully obtained, and the protein spots were identified by mass spectrometry. Vimentin may be the main protein of 68 000 relative molecular weight protein causing guinea pig autoimmune Meniere disease.
【作者單位】: 南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院;江蘇省人民醫(yī)院耳鼻咽喉科及耳鼻咽喉研究室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81070789)
【分類(lèi)號(hào)】:R764.33

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2174186

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