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早期鼻咽癌基因甲基化譜的初步構(gòu)建

發(fā)布時間:2018-06-05 06:35

  本文選題:早期鼻咽癌 + 基因芯片。 參考:《中山大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)科學(xué)版)》2014年06期


【摘要】:【目的】分析早期鼻咽癌的基因甲基化狀態(tài),初步構(gòu)建早期鼻咽癌的基因甲基化譜!痉椒ā渴占疘期(T1N0M0)鼻咽癌石蠟標(biāo)本及炎性增生性鼻咽組織各4例,分別提取DNA,富集兩組樣品基因組甲基化片段后采用甲基化芯片(Nimble Gen)對兩組標(biāo)本進行高通量測序分析,對雜交信號進行掃描及初步數(shù)據(jù)處理,分析并篩選出兩組標(biāo)本的差異甲基化基因。【結(jié)果】4例鼻咽癌石蠟標(biāo)本中均出現(xiàn)甲基化的基因數(shù)目為1 134個,而4例炎性增生性鼻咽組織中均出現(xiàn)甲基化的基因有2 091個,4例鼻咽癌標(biāo)本全部發(fā)生甲基化但4例炎性增生性鼻咽組織全未發(fā)生甲基化的基因有218個,提示此218個基因可能為早期鼻咽癌患者的甲基化基因譜。另外,4例鼻咽癌標(biāo)本全未發(fā)生甲基化而4例炎性增生性鼻咽組織全部發(fā)生甲基化的基因數(shù)目為1 558個。【結(jié)論】本研究初步構(gòu)建了早期鼻咽癌的基因甲基化譜,為進一步建立更為精確的甲基化譜奠定了基礎(chǔ),同時也為尋找鼻咽癌新的分子標(biāo)志物提供了可能。
[Abstract]:[Objective] to analyze the methylation status of early nasopharyngeal carcinoma gene and construct the gene methylation spectrum of early nasopharyngeal carcinoma. [Methods] 4 cases of I (T1N0M0) nasopharyngeal carcinoma and 4 cases of inflammatory hyperplastic nasopharynx were collected, and DNA were extracted respectively, and the methylation chips (Nimble Gen) were used in the two groups after the enrichment of two groups of genomic methylation fragments. High flux sequencing analysis, scanning and preliminary data processing of hybrid signals, analysis and screening of two groups of differential methylation genes. [results] 4 cases of nasopharyngeal carcinoma paraffin specimens were 1134 of the number of methylated genes, and 4 cases of inflammatory hyperplastic nasopharyngeal tissues were methylated in 2091 genes. 4 cases of nasopharyngeal carcinoma were all methylated but 218 genes were not methylated in 4 cases of inflammatory hyperplastic nasopharynx, which suggested that the 218 genes might be the methylation gene spectrum of early nasopharyngeal carcinoma. In addition, 4 cases of nasopharyngeal carcinoma were methylation and 4 cases of inflammatory hypertrophic nasopharyngeal tissue were all methylation genes. The number is 1558. [Conclusion] this study has preliminarily constructed the gene methylation spectrum of early nasopharyngeal carcinoma, which lays the foundation for the further establishment of more accurate methylation spectrum, and also provides a possibility for finding new molecular markers of nasopharyngeal carcinoma.
【作者單位】: 南方醫(yī)科大學(xué)研究生學(xué)院;廣東省人民醫(yī)院∥廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院耳鼻咽喉頭頸外科;
【基金】:廣州市科技計劃項目(2011J4300067)
【分類號】:R739.63

【參考文獻】

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【共引文獻】

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【二級參考文獻】

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本文編號:1980999

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