同源不同輻射抗拒NPC細(xì)胞間總甲基化水平及基因甲基化表達(dá)差異的探討
本文關(guān)鍵詞:同源不同輻射抗拒NPC細(xì)胞間總甲基化水平及基因甲基化表達(dá)差異的探討 出處:《中國病理生理雜志》2015年07期 論文類型:期刊論文
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【摘要】:目的:比較同源不同輻射抗拒能力的鼻咽癌細(xì)胞CNE2R/CNE2間總甲基化水平及其區(qū)域的差異。方法:采用趙存友博士改良的基于甲基化敏感酶全基因組甲基化法檢測CNE2R/CNE2細(xì)胞全基因組甲基化水平;同時采用Me DIP-Seq測序法對CNE2R/CNE2細(xì)胞進(jìn)行測序,分析比較DNA甲基化區(qū)域(主要包括6個基因功能元件即CDS、intron、downstream2k、upstream2k、3’UTR及5’UTR)的差異。結(jié)果:CNE2R細(xì)胞全基因組甲基化水平比CNE2細(xì)胞低約30%;在CNE2R和CNE2細(xì)胞中,雖然分布在6個基因功能元件上的峰值個數(shù)和峰值在各基因元件上的覆蓋度均無明顯差異,但2種細(xì)胞的6個基因功能元件上基因甲基化存在差異。結(jié)論:同源不同輻射抗拒能力的鼻咽癌細(xì)胞間總甲基化水平及基因甲基化存在差異,推測DNA甲基化的差異可能與鼻咽癌輻射抗拒相關(guān)。
[Abstract]:Objective: To compare the total methylation level and regional difference between CNE2R/CNE2 in nasopharyngeal carcinoma cells with different homologous radiation resistance. Methods: Dr. Zhao Cunyou improved methyl detection of CNE2R/CNE2 cell genomic DNA methylation levels of genomic DNA methylation sensitive enzyme method based on the sequence of CNE2R/CNE2 cells; at the same time using Me DIP-Seq sequencing method, a comparative analysis of DNA methylation (including 6 genes: CDS, intron, functional elements downstream2k, upstream2k, 3 'UTR and 5' UTR) difference. Results: the CNE2R cell genome methylation level about 30% lower than CNE2 cells; in CNE2R and CNE2 cells, while the peak number and peak distribution in the 6 gene functional elements covered in each element of the gene had no significant difference, but the 6 gene functional elements of 2 kinds of cells on gene methylation the existence of differences. Conclusion: there is difference in the total methylation level and gene methylation between nasopharyngeal carcinoma cells with different radiation resistance. It is speculated that the difference of DNA methylation may be related to radiative resistance of nasopharyngeal carcinoma.
【作者單位】: 中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院;中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院病理生理學(xué)教研室;南方醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教研室;
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項目(No.81071837;No.81372410) 廣東省自然科學(xué)基金重點項目(No.92510089;No.01000005) 國家大學(xué)生創(chuàng)新訓(xùn)練計劃項目(No.201310558074;No.201210558076) 廣東省大學(xué)生創(chuàng)新訓(xùn)練項目(No.1055813171)
【分類號】:R739.63
【正文快照】: 目前放療仍為鼻咽癌(nasopharyngeal carcino-ma,NPC)的首選療法,但是放療引發(fā)的輻射抗拒嚴(yán)重制約NPC病人5年生存率的提高[1],而NPC輻射抗拒機制至今尚未闡明。近年表觀遺傳調(diào)控特別是DNA甲基化因其作用位點廣泛且調(diào)控結(jié)果可逆等特性而備受關(guān)注,已有研究報道DNA甲基化與腫瘤的
【參考文獻(xiàn)】
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1 曲昌菊;王旭丹;楊惠玲;郭禹標(biāo);梁志慧;趙睿穎;夏云飛;Lee Mong-hong;鄭芹;;相同遺傳背景不同輻射抗拒鼻咽癌細(xì)胞miRNA差異表達(dá)的研究[J];中國病理生理雜志;2009年03期
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1 張曉偉;DNA甲基化在鼻咽癌紫杉醇耐藥形成及逆轉(zhuǎn)耐藥機制中的初步研究[D];中南大學(xué);2012年
【共引文獻(xiàn)】
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2 張菊;關(guān)恒云;張鵬舉;陳蔚文;陳兆波;倪娜娜;朱聞捷;王坤;胡小燕;姜安麗;;前列腺特異的轉(zhuǎn)錄因子NKX3.1上調(diào)Dicer1基因的表達(dá)[J];中國病理生理雜志;2010年09期
3 原玉芬;王杜娟;潘運寶;梁廣;肖健;王蘇美;楊惠玲;;姜黃素類似物B67誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡和G_2/M期阻滯增強對鼻咽癌輻射抗拒細(xì)胞的抑制作用[J];中國病理生理雜志;2011年03期
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【二級參考文獻(xiàn)】
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1 李文歡,崔屹,朱菊人;甲基化寡核苷酸抑制MRP_2表達(dá)逆轉(zhuǎn)人肝癌細(xì)胞HepG2多藥耐藥的研究[J];癌癥;2004年08期
2 黃錦;林菊生;董旭e,
本文編號:1341483
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