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中國(guó)西南地區(qū)漢族人群BAG3基因單核苷酸多態(tài)性與擴(kuò)張型心肌病的相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2017-09-13 06:30

  本文關(guān)鍵詞:中國(guó)西南地區(qū)漢族人群BAG3基因單核苷酸多態(tài)性與擴(kuò)張型心肌病的相關(guān)性研究


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【摘要】:目的:研究表明20%-35%的擴(kuò)張型心肌病(Dilated Cardiomyopathy,DCM)有明顯的家族遺傳史,目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的同DCM發(fā)病相關(guān)的基因有30余種,大多數(shù)都是編碼細(xì)胞骨架和肌纖維節(jié)相關(guān)的蛋白質(zhì),例如TNNT2、DES、MYH7、ACTN2、ACTC、TTN等。近期發(fā)現(xiàn)位于肌小節(jié)的Z盤結(jié)構(gòu)上并在該結(jié)構(gòu)上呈現(xiàn)高表達(dá)水平的Bcl-2相關(guān)抗凋亡蛋白3(Bcl-2 associated athanogene 3,BAG3)的基因變異同DCM相關(guān)。2011年,Villard E首次報(bào)道了BAG3基因上的rs2234962多態(tài)位點(diǎn)與DCM導(dǎo)致的心衰有關(guān),提示BAG3基因可能是導(dǎo)致DCM發(fā)病的候選基因,隨后在日本家族性DCM患者中也發(fā)現(xiàn)BAG3基因突變點(diǎn)Arg218Trp和Leu462Pro以及相關(guān)的多態(tài)點(diǎn)(rs3858339、rs196295、rs117671123、rs78439745、rs3858340)與DCM有關(guān)。但是在中國(guó)西南地區(qū)漢族人群中是否也存在BAG3基因的變異,以及其變異是否與DCM發(fā)病相關(guān),目前尚無(wú)相關(guān)研究證實(shí)。故本實(shí)驗(yàn)通過(guò)研究BAG3基因的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)與中國(guó)西南地區(qū)漢族人群擴(kuò)張型心肌病的相關(guān)性,來(lái)探討擴(kuò)張型心肌病的遺傳學(xué)發(fā)病機(jī)制。方法:研究對(duì)象選取中國(guó)西南地區(qū)的漢族人群,采用病例對(duì)照研究,將BAG3基因的4個(gè)外顯子作為擴(kuò)增的目的序列。從144例DCM患者(DCM組)和156例健康對(duì)照者(對(duì)照組)外周血中提取DNA作為擴(kuò)增的模板,設(shè)計(jì)引物后采用聚合酶鏈擴(kuò)增反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增DCM組和對(duì)照組的目的序列,運(yùn)用雙脫氧核糖核酸鏈末端終止測(cè)序的方法(Sanger測(cè)序法)測(cè)定兩組擴(kuò)增產(chǎn)物的堿基序列,分析所得的序列圖,并將測(cè)得的堿基序列同數(shù)據(jù)庫(kù)中BAG3基因4個(gè)外顯子的堿基序列進(jìn)行比對(duì),得出與DCM相關(guān)的SNPs或突變點(diǎn),再統(tǒng)計(jì)出兩組相關(guān)SNPs的基因型和等位基因頻率,用卡方檢驗(yàn)比較DCM組和對(duì)照組之間多態(tài)位點(diǎn)的基因型頻率和等位基因頻率的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。結(jié)果:1.本研究未在中國(guó)西南地區(qū)漢族人群中發(fā)現(xiàn)曾在日本人群中報(bào)道過(guò)的與DCM發(fā)病相關(guān)的Arg218Trp(c.652CT,rs397514506)和Leu462Pro(c.1385TC,rs397514507)兩個(gè)突變位點(diǎn),這兩個(gè)基因突變分別位于BAG3基因的第3和第4外顯子上,同時(shí)也未在該基因上發(fā)現(xiàn)同DCM相關(guān)的其他突變位點(diǎn)。2.在中國(guó)西南地區(qū)漢族人群中發(fā)現(xiàn)了6個(gè)同DCM相關(guān)的BAG3基因多態(tài)位點(diǎn),主要位于第3、4外顯子上,而未在第1、2外顯子上發(fā)現(xiàn)相關(guān)的多態(tài)點(diǎn)。發(fā)現(xiàn)的相關(guān)多態(tài)點(diǎn)分別是rs117671123(位于第3外顯子c.772CT,Arg258Arg)、rs3858339(位于第4外顯子c.1002TG,Pro334Pro)、rs3858340(位于第4外顯子c.1220CT,Pro407Leu)、rs196295(位于第4外顯子c.1296AG,Val432Val)、rs374858685(位于第4外顯子c.1299AG,Gln433Gln)、rs149358702(位于第4外顯子c.1587CT,Ala529Ala),其中rs117671123、rs196295、rs3858339、rs3858340等位點(diǎn)也在日本人群中報(bào)道過(guò)。3.發(fā)現(xiàn)位于第4外顯子上的rs196295多態(tài)位點(diǎn)與對(duì)照組相比有顯著差異,rs196295多態(tài)位點(diǎn)的AG+GG基因型頻率和G等位基因頻率在DCM組明顯增加,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(分別為75%和51.3%、45.8%和29.5%,均P0.05)。此外,DCM組的AG+GG基因型和G等位基因與對(duì)照組相比OR值分別為2.85、2.02,即攜帶有AG+GG基因型和G等位基因者發(fā)生DCM的危險(xiǎn)性是健康者的2.85、2.02倍。兩組基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05)。4.發(fā)現(xiàn)位于第4外顯子上的rs3858339多態(tài)點(diǎn)的TG基因型頻率及G等位基因頻率與第4外顯子上的rs3858340多態(tài)點(diǎn)的CT基因型頻率及T等位基因頻率相同,在DCM組分別為42.4%、21.2%,在對(duì)照組分別為39.7%、19.9%,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。5.發(fā)現(xiàn)位于第3外顯子上的rs117671123多態(tài)點(diǎn)和位于第4外顯子上的rs374858685、rs149358702多態(tài)點(diǎn)在對(duì)照組中無(wú)基因變異,在DCM組中雖未發(fā)現(xiàn)純合子改變,但發(fā)現(xiàn)有雜合子改變,其中rs117671123多態(tài)點(diǎn)CT基因型頻率為1.4%,rs 374858685多態(tài)位點(diǎn)AG基因型頻率為0.7%,rs149358702多態(tài)位點(diǎn)CT基因型頻率為0.7%;而位于rs117671123上的T等位基因頻率、rs374858685上的G等位基因頻率、rs149358702上的T等位基因頻率分別為0.7%、0.3%、0.3%,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。結(jié)論:1.中國(guó)西南地區(qū)漢族人群DCM患者中不存在日本人群中報(bào)道的與DCM發(fā)病相關(guān)的突變點(diǎn)Arg218Trp(c.652CT)和Leu462Pro(c.1385TC),該突變點(diǎn)的致病可能同遺傳背景的差異及環(huán)境因素的影響有關(guān)。2.中國(guó)西南地區(qū)漢族人群在BAG3基因的4個(gè)外顯子上都不存在與DCM相關(guān)的基因突變位點(diǎn)。3.位于BAG3基因第4外顯子上的rs196295單核苷酸多態(tài)性可能與中國(guó)西南地區(qū)漢族人群DCM相關(guān),攜帶有該位點(diǎn)AG+GG基因型和G等位基因者可能使DCM的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增高,這可能是DCM發(fā)生的遺傳易感因素。4.位于BAG3基因第4外顯子上的rs3858339和rs3858340多態(tài)性與中國(guó)西南地區(qū)漢族人群DCM無(wú)相關(guān)性。5.多態(tài)位點(diǎn)rs117671123、rs374858685、rs149358702可能與中國(guó)西南地區(qū)漢族人群DCM無(wú)相關(guān)性。
【關(guān)鍵詞】:擴(kuò)張型心肌病 Bcl-2相關(guān)抗凋亡蛋白3(BAG3) 等位基因頻率 基因型頻率 單核苷酸多態(tài)性(SNP)
【學(xué)位授予單位】:四川醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R542.2
【目錄】:
  • 中文摘要3-7
  • 英文摘要7-12
  • 前言12-14
  • 材料與方法14-23
  • 結(jié)果23-36
  • 討論36-46
  • 結(jié)論46-47
  • 參考文獻(xiàn)47-52
  • 英漢縮略詞對(duì)照表52-54
  • 致謝54-55
  • 遺傳性心血管疾病的研究進(jìn)展(綜述)55-66
  • 參考文獻(xiàn)62-66

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 胡軍;;擴(kuò)張型心肌病的病因分析[J];中國(guó)煤炭工業(yè)醫(yī)學(xué)雜志;2013年04期

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本文編號(hào):842078

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