本文關(guān)鍵詞：基于調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析篩選急性冠狀動(dòng)脈綜合征的miRNA標(biāo)志物

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【摘要】：急性冠狀動(dòng)脈綜合征(ACS)是一個(gè)高發(fā)病率、高死亡率的疾病,該病主要分為兩個(gè)亞型:急性心肌梗死(AMI)和不穩(wěn)定型心絞痛(UA)。臨床上,很多患者會(huì)由于診斷的不及時(shí)或者診斷的依據(jù)不全面而錯(cuò)過(guò)了寶貴治療時(shí)間。Micro RNA(mi RNA)是在真核生物中廣泛存在的非編碼RNA,通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則與目標(biāo)信使核糖核酸(m RNA)結(jié)合,調(diào)控基因表達(dá),是理想的生物標(biāo)志物。本課題基于mi RNA-m RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)篩選ACS兩個(gè)亞型相關(guān)的潛在mi RNA標(biāo)志物。從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中分別收集與兩個(gè)亞型相關(guān)的mi RNA表達(dá)數(shù)據(jù),將具有差異表達(dá)現(xiàn)象的mi RNA映射到已構(gòu)建的mi RNA-m RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中。重點(diǎn)關(guān)注每個(gè)具有差異表達(dá)現(xiàn)象的mi RNA在網(wǎng)絡(luò)中獨(dú)立調(diào)控基因的能力并使用新的出度指標(biāo)NOD量化表示。最終在AMI和UA中分別找到了27個(gè)和26個(gè)潛在的mi RNA生物標(biāo)志物,其中8個(gè)mi RNA是兩亞型共有的,每種亞型中分別有5個(gè)在文獻(xiàn)中被報(bào)道。通過(guò)對(duì)結(jié)果mi RNA的靶基因進(jìn)行富集分析,在AMI和UA中分別找到35條和18條相關(guān)的信號(hào)通路。通過(guò)文獻(xiàn)驗(yàn)證,在AMI中發(fā)現(xiàn)其中的28條通路是已被報(bào)道與疾病相關(guān)的。在UA富集的結(jié)果中,也找到了12條已被報(bào)道和疾病相關(guān)的通路。本課題基于創(chuàng)新的理論篩選了ACS兩個(gè)亞型的潛在mi RNA生物標(biāo)志物并比較了它們的異同。在此基礎(chǔ)上,更深層次地分析了兩種亞型mi RNA靶基因所富集的生物信號(hào)通路。對(duì)于該病的臨床診斷和治療具有重要的指導(dǎo)意義。
【關(guān)鍵詞】：急性冠脈綜合征 急性心肌梗死 不穩(wěn)定型心絞痛 mi RNA 生物標(biāo)志物 富集分析
【學(xué)位授予單位】：蘇州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R541.4;R440
【目錄】：

• 中文摘要4-5
• Abstract5-8
• 第1章 引言8-12
• 1.1 課題研究背景8-10
• 1.1.1 急性冠狀動(dòng)脈綜合癥研究現(xiàn)狀、背景及其意義8-10
• 1.1.2 研究miRNA作為生物標(biāo)志物和其網(wǎng)絡(luò)特征的意義10
• 1.2 本文的研究結(jié)構(gòu)和目的10-12
• 第2章 網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建及其篩選指標(biāo)12-13
• 2.1 miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建12
• 2.2 NOD(novel out degree)值的定義和作用12-13
• 第3章 數(shù)據(jù)收集和數(shù)據(jù)篩選13-16
• 3.1 數(shù)據(jù)收集13
• 3.2 差異miRNA篩選方法13-14
• 3.3 亞型中miRNA生物標(biāo)志物的篩選結(jié)果14-16
• 第4章 miRNA層次的分析與驗(yàn)證16-22
• 4.1 文獻(xiàn)報(bào)道的亞型miRNA生物標(biāo)志物16-21
• 4.2 亞型數(shù)據(jù)驗(yàn)證21-22
• 4.2.1 AMI的驗(yàn)證21
• 4.2.2 UA的驗(yàn)證21-22
• 第5章 生物信號(hào)通路層次的分析與驗(yàn)證22-41
• 5.1 亞型的信號(hào)通路富集22-29
• 5.1.1 AMI富集通路的概括和分類22-23
• 5.1.2 AMI文獻(xiàn)報(bào)道的通路23-26
• 5.1.3 UA富集通路的概括和分類26-27
• 5.1.4 UA文獻(xiàn)報(bào)道通路27-29
• 5.2 亞型中明確報(bào)道的獨(dú)有通路29-35
• 5.2.1 AMI獨(dú)有通路29-34
• 5.2.2 UA獨(dú)有通路34-35
• 5.3 亞型中明確報(bào)道的共有通路35-41
• 5.3.1 Development_VEGF signaling and activation35-37
• 5.3.2 Development_PEDF signaling and activation37-38
• 5.3.3 NF-kB因子相關(guān)的通路38-39
• 5.3.4 多發(fā)性神經(jīng)纖維瘤�、裥屯�39-41
• 第6章 結(jié)論與展望41-42
• 參考文獻(xiàn)42-55
• 附錄一55-68
• 攻讀碩士學(xué)位期間公開(kāi)發(fā)表的論文68-69
• 致謝69-70

【相似文獻(xiàn)】

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7 程守勤　蔣廷玉;“晨練不當(dāng)”頻頻引發(fā)急性心肌梗死[N];新華日?qǐng)?bào);2006年

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