ABCA1基因啟動(dòng)子區(qū)突變鑒定及其對(duì)豬血漿高密度脂蛋白水平的影響
本文關(guān)鍵詞:ABCA1基因啟動(dòng)子區(qū)突變鑒定及其對(duì)豬血漿高密度脂蛋白水平的影響
更多相關(guān)文章: HDL ABCA1 啟動(dòng)子 SNP
【摘要】:高密度脂蛋白(high density lipoprotein,HDL)在調(diào)節(jié)機(jī)體內(nèi)血漿膽固醇水平的動(dòng)態(tài)平衡起到了關(guān)鍵性的作用。血漿中的膽固醇過(guò)量的累積會(huì)導(dǎo)致動(dòng)脈粥樣硬化。大量的實(shí)驗(yàn)研究證實(shí)了 ATP 結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白 A1(ATP-binding cassette transporter A1,ABCA1)介導(dǎo)了血漿HDL生成,將體內(nèi)過(guò)量的膽固醇和各類(lèi)脂蛋白轉(zhuǎn)化為磷脂從而形成HDL。血漿中高密度脂蛋白水平越高,一些心血管疾病的發(fā)生概率就越低。在大量的人類(lèi)疾病和動(dòng)物模型的研究中已經(jīng)證實(shí)了提高肝臟ABCA1的活性能夠增加血漿高密度脂蛋白的水平。本實(shí)驗(yàn)以ABCA1作為候選基因,挖掘ABCA1基因啟動(dòng)子區(qū)域的單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位點(diǎn),分析其與ABCA1基因表達(dá)水平及血漿HDL水平的關(guān)系。本實(shí)驗(yàn)取高低組HDL樣品各30個(gè)進(jìn)行DNA混池測(cè)序,將ABCA1啟動(dòng)子全部區(qū)域測(cè)序,進(jìn)行高低組之間比較。得到了在HDL高組和低組中等位基因分布模式存在差異的兩個(gè)SNP位點(diǎn),分別為c.-608AG和c.-418TA。采用等位基因特異性PCR技術(shù)對(duì)這兩個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,通過(guò)對(duì)526個(gè)四元雜交豬的大群分型驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)位點(diǎn)是完全連鎖的,并且只形成了 G-A和A-T兩種單倍型。結(jié)果顯示,G-A/G-A基因型比A-T/A-T基因型擁有更高的血漿HDL水平。對(duì)兩組各12個(gè)不同基因型個(gè)體的ABCA1表達(dá)水平分析,結(jié)果表明G-A/G-A基因型表達(dá)水平顯著高于A-T/A-T基因型(p0.05)。通過(guò)雙熒光素酶活性報(bào)告實(shí)驗(yàn)檢驗(yàn)兩種單倍型啟動(dòng)子的活性,結(jié)果表明G-A啟動(dòng)子比A-T啟動(dòng)子具有更高的活性,二者差異顯著(P0.05)。點(diǎn)突變實(shí)驗(yàn)顯示,c.-418 TA是引起ABCA1轉(zhuǎn)錄活性發(fā)生變化的關(guān)鍵位點(diǎn),堿基T突變?yōu)锳能夠引起ABCA1基因啟動(dòng)子活性升高,并且促進(jìn)了 ABCA1基因表達(dá)水平升高,從而提高了血漿HDL水平。本研究通過(guò)鑒定ABCA1基因啟動(dòng)子區(qū)與血漿HDL水平相關(guān)的功能性變異,進(jìn)一步豐富了血漿HDL水平變異的遺傳學(xué)機(jī)制和理論,為預(yù)防動(dòng)脈粥樣硬化(Atherosclerosis,As)和冠心病的治療提供了新的思路。
【關(guān)鍵詞】:HDL ABCA1 啟動(dòng)子 SNP
【學(xué)位授予單位】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類(lèi)號(hào)】:R54
【目錄】:
- 摘要6-8
- ABSTRACT8-10
- 縮略詞10-12
- 引言12-13
- 第一章 文獻(xiàn)綜述13-25
- 1 高密度脂蛋白研究概況13-20
- 1.1 高密度脂蛋白的分級(jí)13-15
- 1.2 高密度脂蛋白的蛋白組15-16
- 1.3 高密度脂蛋白的生成與代謝16-18
- 1.4 高密度脂蛋白的作用18-20
- 2 ABCA1的研究概括20-25
- 2.1 ABCA1的結(jié)構(gòu)20-21
- 2.2 ABCA1的功能21-22
- 2.3 ABCA1介導(dǎo)RCT22-23
- 2.4 ABCA1的調(diào)控23-25
- 第二章 ABCA1基因調(diào)控區(qū)多態(tài)性篩選25-39
- 1 實(shí)驗(yàn)材料25-27
- 1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物25
- 1.2 主要實(shí)驗(yàn)試劑25-26
- 1.3 主要實(shí)驗(yàn)溶劑配方26
- 1.4 主要儀器及實(shí)驗(yàn)器械26-27
- 1.5 網(wǎng)絡(luò)資源與生物信息學(xué)軟件27
- 2 實(shí)驗(yàn)方法27-31
- 2.1 豬高密度脂蛋白的測(cè)定27
- 2.2 ABCA1基因表達(dá)量與豬高密度脂蛋白的相關(guān)性27-29
- 2.3 ABCA1基因啟動(dòng)子區(qū)SNP的篩選29-30
- 2.4 突變位點(diǎn)基因分型30-31
- 3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果31-36
- 3.1 豬ABCA1基因啟動(dòng)子的獲取31
- 3.2 ABCA1基因表達(dá)量與HDL的相關(guān)性31-33
- 3.3 ABCA1基因啟動(dòng)子區(qū)SNP位點(diǎn)的篩選33-34
- 3.4 SNP位點(diǎn)基因分型34-36
- 4 討論36-39
- 第三章 ABCA1基因調(diào)控區(qū)SNP位點(diǎn)對(duì)啟動(dòng)子活性的影響39-57
- 1 實(shí)驗(yàn)材料39-40
- 1.1 實(shí)驗(yàn)樣品39
- 1.2 主要實(shí)驗(yàn)試劑39
- 1.3 主要儀器及實(shí)驗(yàn)器械39-40
- 1.4 網(wǎng)絡(luò)資源與生物信息學(xué)軟件40
- 2 實(shí)驗(yàn)方法40-50
- 2.1 構(gòu)建pGL3-GA/AT兩種雙熒光素酶報(bào)告載體40-45
- 2.2 構(gòu)建點(diǎn)突變雙熒光素酶報(bào)告載體45-47
- 2.3 雙熒光素酶報(bào)告載體的啟動(dòng)子活性分析47-50
- 3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果50-55
- 3.1 菌液PCR鑒定構(gòu)建載體50-51
- 3.2 雙酶切鑒定構(gòu)建載體51
- 3.3 測(cè)序驗(yàn)證點(diǎn)突變重組載體51-52
- 3.4 ABCA1不同單倍型啟動(dòng)子活性分析52-54
- 3.5 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè)54-55
- 4 討論55-57
- 全文結(jié)論57-59
- 參考文獻(xiàn)59-71
- 致謝71-73
- 碩士期間發(fā)表的論文73
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