冠心病候選基因的分子遺傳學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2017-07-18 21:10
本文關(guān)鍵詞:冠心病候選基因的分子遺傳學(xué)研究
更多相關(guān)文章: 冠心病 單核苷酸多態(tài)性 薈萃分析
【摘要】:目的:冠心病(coronary heart disease,CHD)已成為危害人類健康的眾多元兇之一。本研究主要通過對(duì)CHD易感基因進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(single nucleotide polymorphism,SNP)薈萃分析以及基因分型檢測(cè)來尋找降低冠心病易感性的生物標(biāo)志物。材料與方法:薈萃分析是將前人的研究整合在一起以減少個(gè)體性研究存在的不確定性的一種分析方法。我們的薈萃分析系統(tǒng)地檢索了包括萬方、中國(guó)知網(wǎng)和PubMed等國(guó)內(nèi)外生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫。運(yùn)用Revman 5.0和Stata 11.0軟件對(duì)APOA5rs662799,GPX1 rs1050450和ALOX15 rs34210653三個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行薈萃分析;收集寧波漢族人群CHD患者病例組及對(duì)照組外周血樣本共1530例,采用MassARRAY分型技術(shù)對(duì)43個(gè)CHD候選基因位點(diǎn)進(jìn)行SNP分型檢測(cè)。結(jié)果:通過薈萃分析發(fā)現(xiàn)GPX1 rs1050450-C(OR=1.61,P=0.0002),ALOX15rs34210653-C(OR=1.42,P=0.02)和APOA5 rs662799-G(OR=1.36,P0.0001)均能夠增加36%以上的CHD患病風(fēng)險(xiǎn)。病例對(duì)照研究發(fā)現(xiàn)在寧波漢族人群中APOE rs7259620-G(P=0.025,OR=1.20)可以使得患CHD的風(fēng)險(xiǎn)增加20%,尤其在男性中該位點(diǎn)的突變能增加26%的患病風(fēng)險(xiǎn)(P=0.023,OR=1.26)。APOA5 rs662799位點(diǎn)的突變?cè)诓±M與對(duì)照組之間存在顯著的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.002,OR=1.28),并且在男性中發(fā)現(xiàn)rs662799的突變使CHD患病風(fēng)險(xiǎn)增加到33%(P=0.005,OR=1.33)。PPAP2B rs72664392位點(diǎn)在女性中與CHD顯著相關(guān)(P=0.007)。PLA2G7 rs9395208-G能夠減少19%的患病風(fēng)險(xiǎn)(P=0.040,OR=0.81)。CD40 rs1800686-G能夠增加20%的CHD患病風(fēng)險(xiǎn)(P=0.020,OR=1.20),在女性中呈現(xiàn)出更高的患病風(fēng)險(xiǎn)(P=0.022,OR=1.35)。FAM5C rs12732361-G在男性中能夠增加27%的患病風(fēng)險(xiǎn)(P=0.031,OR=1.27)。CD36 rs2065666-G在男性中能夠降低19%的患病風(fēng)險(xiǎn)(P=0.046,OR=0.81)。F7 rs510317在男性中與CHD患病相關(guān)聯(lián)(P=0.027)。結(jié)論:1.通過薈萃分析我們發(fā)現(xiàn)GPX1 rs1050450,ALOX15 rs34210653和APOA5rs662799三個(gè)位點(diǎn)均與CHD存在顯著相關(guān)性(發(fā)表在Gene,2013,531(1):71-77;IF=2.2)。2.通過病例對(duì)照研究我們發(fā)現(xiàn)APOE rs7259620,APOA5 rs662799,PLA2G7 rs9395208,CD40 rs1800686,CD36 rs2065666,PPAP2B rs72664392,FAM5C rs12732361和F7 rs510317八個(gè)位點(diǎn)與CHD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)均存在關(guān)聯(lián)性(已被BiomedicinePharmacotherapy接收)。3.APOE rs7259620-G,APOA5 rs662799-G和CD40 rs1800686-G可能是CHD的風(fēng)險(xiǎn)性因素,而PLA2G7 rs9395208-G可能是CHD的保護(hù)性因素。4.CD40 rs1800686-G在女性中可以增加CHD的患病風(fēng)險(xiǎn)。5.APOE rs7259620-G,APOA5 rs662799-G和FAM5C rs12732361-G的突變?cè)谀行灾斜憩F(xiàn)為CHD患病風(fēng)險(xiǎn)因素,而CD36 rs2065666的突變?cè)谀行灾斜憩F(xiàn)為CHD患病保護(hù)因素。6.CETP rs4783961,APOA5 rs10750097,MLXIPL rs35493868,ADIPOR1 rs7523903,PCSK9 rs2479409,SCARB1 rs59358115,PRKAG1 rs2293446,PON3 rs11770903,LEP rs13228377,ANGPTL4 rs4076317,LEPR rs6656451,ANGPTL3 rs11207997,PON2rs12704976,VLDLR rs7852409,ADIPOQ rs266729,SELP rs3917655,SAA1 rs1829575,CRP rs3093059,SELL rs2205849,TGFB1 rs2317130,IL12RB2 rs12142823,IL1B rs16944,CARD8 rs7248320,TLR2 rs7682814,CXCL12 rs11239027,IL1R2 rs2071008,ACE rs4316,AGTR1 rs275653,CST3 rs3827143,VEGFA rs1005230,THBS4 rs17878919,P2RY12 rs1491974,CYP2C19 rs12773342,ITGA2 rs26680和FGB rs222738935個(gè)位點(diǎn)的多態(tài)性與CHD不存在相關(guān)性。
【關(guān)鍵詞】:冠心病 單核苷酸多態(tài)性 薈萃分析
【學(xué)位授予單位】:寧波大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R541.4
【目錄】:
- 摘要4-6
- Abstract6-10
- 引言10-12
- 第一部分:易感基因多態(tài)性與 CHD 患病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)性的薈萃分析12-26
- 1 薈萃分析的目的12
- 2 材料與方法12-14
- 2.1 檢索文獻(xiàn)12
- 2.2 文獻(xiàn)納入分析標(biāo)準(zhǔn)12-13
- 2.3 納入文獻(xiàn)資料收集13
- 2.4 統(tǒng)計(jì)分析13-14
- 3 結(jié)果14-23
- 3.1 GPX1 rs1050450薈萃分析14-15
- 3.1.1 文獻(xiàn)檢索結(jié)果14
- 3.1.2 薈萃分析結(jié)果14-15
- 3.1.3 偏倚性分析15
- 3.2 ALOX15 rs34210653薈萃分析15-17
- 3.2.1 文獻(xiàn)檢索結(jié)果15-16
- 3.2.2 薈萃分析結(jié)果16-17
- 3.2.3 偏倚性分析17
- 3.3 APOA5 rs662799薈萃分析17-23
- 3.3.1 文獻(xiàn)檢索結(jié)果17-18
- 3.3.2 薈萃分析結(jié)果18-21
- 3.3.3 偏倚性分析21-23
- 4 討論23-26
- 第二部分:易感基因多態(tài)性與 CHD 相關(guān)性26-47
- 1 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/span>26
- 2 實(shí)驗(yàn)方法26-36
- 2.1 實(shí)驗(yàn)試劑26
- 2.2 實(shí)驗(yàn)主要儀器26-27
- 2.3 研究對(duì)象27
- 2.4 臨床資料收集27
- 2.5 提取血液全基因組DNA(核酸自動(dòng)提取儀 ---磁珠法)27-28
- 2.6 候選基因多態(tài)性位點(diǎn)的選取28-30
- 2.7 MASSARRAY平臺(tái)SNP檢測(cè)30-36
- 2.7.1 分型原理30
- 2.7.2 引物設(shè)計(jì)30-33
- 2.7.3 實(shí)驗(yàn)步驟33-36
- 2.8 統(tǒng)計(jì)分析36
- 3 結(jié)果36-43
- 3.1 基因型Hardy-Weinberg平衡分析36
- 3.2 病例對(duì)照組基因型和等位基因的比較及相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)性分析36-43
- 3.2.1 脂類相關(guān)基因SNP分型結(jié)果36-39
- 3.2.2 炎癥相關(guān)基因SNP分型結(jié)果39-41
- 3.2.3 血管生成相關(guān)基因SNP分型結(jié)果41-42
- 3.2.4 血栓形成相關(guān)基因SNP分型結(jié)果42-43
- 4 討論43-47
- 結(jié)論47-48
- 參考文獻(xiàn)48-57
- 附錄A 中英文對(duì)照表57-58
- 附錄B 文獻(xiàn)綜述58-73
- 參考文獻(xiàn)67-73
- 在學(xué)研究成果73-75
- 致謝75
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):559764
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