基于GC-MS的冠心病血漿代謝組學(xué)研究
發(fā)布時間:2017-05-16 12:04
本文關(guān)鍵詞:基于GC-MS的冠心病血漿代謝組學(xué)研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:冠心病是一種嚴(yán)重危害全人類身體健康的心血管疾病。冠心病的危險因素錯綜復(fù)雜,研究冠心病的病因和發(fā)病機(jī)制,對于冠心病的早期診斷與治療具有重大意義。代謝組學(xué)作為一門新興的系統(tǒng)生物學(xué)的重要學(xué)科,在疾病診斷與治療、藥物的藥效和毒性評價、基因功能等領(lǐng)域具有獨(dú)特的優(yōu)勢。本論文利用氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用儀(GC-MS),選擇有效的預(yù)處理方法和衍生技術(shù)、結(jié)合化學(xué)計量學(xué)中的多元分辨技術(shù)和模式識別方法,對健康對照組和冠心病患者的血漿代謝譜進(jìn)行了全面、細(xì)致的代謝組學(xué)研究。本論文的主要內(nèi)容包括: 一、本文采用通用的肟化-硅烷化衍生方法、結(jié)合GC-MS色譜聯(lián)用技術(shù),對40例健康對照組和94例冠心病患者血漿進(jìn)行提取和分析,建立了血漿代謝譜。結(jié)合直觀推導(dǎo)式演進(jìn)特征投影法(HELP)等化學(xué)計量學(xué)多元分辨技術(shù)對重疊色譜峰進(jìn)行分辨和解析,并對其中的46種內(nèi)源性代謝物進(jìn)行了定性定量分析。 二、采用主成分分析法(PCA)和偏最小二乘-線性判別分析法(PLS-LDA)等化學(xué)計量學(xué)方法,對健康對照組和冠心病患者進(jìn)行了判別分析,建立了PLS-LDA判別模型,所得模型具有良好的識別和預(yù)測能力;運(yùn)用一種新的變量篩選方法——子窗口隨機(jī)化分析法(SPA)對變量進(jìn)行篩選,篩選出對分類貢獻(xiàn)大的代謝物作為潛在的生物標(biāo)記物。 三、采用PCA和蒙特卡洛樹分析法(MCTree)等化學(xué)計量學(xué)方法對冠狀動脈一支狹窄病變、兩支狹窄病變和三支狹窄病變這三類不同程度冠心病患者進(jìn)行了判別分析,三類患者分類趨勢比較明顯。此外,MCTree方法還被用來篩選重要變量,作為冠心病病變發(fā)展過程中可能的潛在生物標(biāo)記物。同時還初步地解釋了這些生物標(biāo)記物的生物學(xué)意義,為冠心病的早期診斷、預(yù)測和發(fā)病機(jī)制研究提供了有用的參考信息。
【關(guān)鍵詞】:氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用儀 冠心病 代謝組學(xué) 生物標(biāo)記物 化學(xué)計量學(xué)
【學(xué)位授予單位】:中南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2012
【分類號】:R541.4
【目錄】:
- 摘要4-5
- ABSTRACT5-9
- 第一章 緒論9-21
- 1.1 代謝組學(xué)概念9
- 1.2 代謝組學(xué)簡介9-15
- 1.2.1 代謝組學(xué)的發(fā)展9-10
- 1.2.2 代謝組學(xué)的研究方法10-12
- 1.2.3 代謝組學(xué)研究的儀器分析技術(shù)12
- 1.2.4 代謝組學(xué)的應(yīng)用領(lǐng)域12-15
- 1.3 冠心病介紹15-19
- 1.3.1 冠心病癥狀及其類型15-16
- 1.3.2 冠心病的致病因素16-17
- 1.3.3 冠心病的診斷與治療17-19
- 1.4 化學(xué)計量學(xué)在代謝組學(xué)中的應(yīng)用19-20
- 1.5 本文的研究內(nèi)容20-21
- 第二章 人體血漿代謝譜分析21-31
- 2.1 引言21
- 2.2 理論部分21-22
- 2.2.1 直觀推導(dǎo)式演進(jìn)特征投影法(HELP)21-22
- 2.3 實驗部分22-24
- 2.3.1 儀器與試劑22
- 2.3.2 樣品的采集及預(yù)處理22-23
- 2.3.3 GC-MS分析條件23-24
- 2.3.4 數(shù)據(jù)分析24
- 2.4 結(jié)果與討論24-30
- 2.4.1 人體血漿代謝譜的建立24-25
- 2.4.2 HELP法解析重疊色譜峰25-28
- 2.4.3 人體血漿代謝物定性分析28-30
- 2.5 本章小結(jié)30-31
- 第三章 冠心病患者與健康人的判別分析及生物標(biāo)記物31-44
- 3.1 引言31-32
- 3.2 理論部分32-34
- 3.2.1 主成分分析32
- 3.2.2 偏最小二乘法32-33
- 3.2.3 線性判別分析33
- 3.2.4 子窗口隨機(jī)化分析法33
- 3.2.5 交互檢驗法33-34
- 3.3 實驗部分34
- 3.3.1 實驗數(shù)據(jù)34
- 3.3.2 數(shù)據(jù)分析34
- 3.4 結(jié)果與討論34-42
- 3.4.1 健康對照組和冠心病患者血漿代謝譜定量分析34-37
- 3.4.2 健康對照組和冠心病患者血漿代謝圖譜的主成分分析37-38
- 3.4.3 健康對照組和冠心病患者的PLS-LDA判別模型38-39
- 3.4.4 尋找潛在的生物標(biāo)記物39-42
- 3.5 本章小結(jié)42-44
- 第四章 不同嚴(yán)重程度冠心病患者的判別分析及生物標(biāo)記物44-54
- 4.1 引言44-45
- 4.2 理論部分45
- 4.2.1 蒙特卡洛樹分析法45
- 4.3 實驗部分45-47
- 4.3.1 實驗數(shù)據(jù)45-46
- 4.3.2 數(shù)據(jù)分析46-47
- 4.4 結(jié)果與討論47-53
- 4.4.1 不同嚴(yán)重程度冠心病患者血漿代謝譜定量分析47-49
- 4.4.2 不同嚴(yán)重程度冠心病患者血漿代謝圖譜的主成分分析49
- 4.4.3 不同嚴(yán)重程度冠心病患者的MCTree判別模型49-51
- 4.4.4 尋找潛在的生物標(biāo)記物51-53
- 4.5 本章小結(jié)53-54
- 結(jié)論54-55
- 參考文獻(xiàn)55-64
- 致謝64-65
- 攻讀學(xué)位期間主要研究成果65
【參考文獻(xiàn)】
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本文關(guān)鍵詞:基于GC-MS的冠心病血漿代謝組學(xué)研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號:370765
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