永久性心房顫動(dòng)的基因組DNA甲基化分析
發(fā)布時(shí)間:2022-01-13 23:45
背景與目的心房顫動(dòng)(atrial fibrillation,AF)是一種最常見的持續(xù)性心律失常,目前房顫是導(dǎo)致各種心血管疾病發(fā)病及死亡的主要原因之一。已有研究發(fā)現(xiàn),房顫是一種遺傳異質(zhì)性疾病,與多種遺傳因素密切相關(guān),已知多種染色體異常及基因突變可以導(dǎo)致房顫發(fā)作。盡管通過對特異性基因以及全基因組關(guān)聯(lián)研究發(fā)現(xiàn)了一些房顫的相關(guān)基因變異并且闡明房顫的遺傳性,但是大部分房顫仍然無法單純用基因突變來解釋。表觀遺傳調(diào)控是控制基因表達(dá)方面的重要機(jī)制,它在一種潛在的遺傳途徑中發(fā)揮作用。DNA甲基化被認(rèn)為是影響表觀遺傳學(xué)的重要驅(qū)動(dòng)因素之一,目前已有眾多研究指出DNA甲基化在許多細(xì)胞生物過程中扮演著重要且不斷發(fā)展的角色,這些進(jìn)程包括細(xì)胞發(fā)展、細(xì)胞分化和DNA-蛋白質(zhì)的相互作用等等。越來越多的證據(jù)表明,外部刺激包括環(huán)境和生活方式可能通過表達(dá)異常的DNA甲基化模式影響基因表達(dá)狀態(tài)。這種“外部刺激-DNA甲基化-基因表達(dá)"模式很大程度上有助于解釋很多疾病的發(fā)生機(jī)制。本研究旨在使用高密度全基因組CpG甲基化芯片篩選了永久性房顫病人左心房組織的DNA甲基化并與健康正常竇性心律(SR)患者的左心房組織進(jìn)行比較;诓煌...
【文章來源】:首都醫(yī)科大學(xué)北京市
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
HybridizationControls雜交質(zhì)控圖
首都醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文中橫軸是 log2(信號值),縱軸是樣本名稱 。紅色熒光表示未甲基化號值),綠色熒光表示甲基化位點(diǎn)的 log2(信號值)。論:紅色熒光和綠色熒光的差值一般是 2 個(gè)數(shù)量級。陽性參照中綠色og2(信號值) >12,標(biāo)記實(shí)驗(yàn)成功。脫實(shí)驗(yàn)的質(zhì)量控制質(zhì)控檢測未標(biāo)記的探針產(chǎn)生的信號值(背景值)。此探針存在于 RA中,探針在單堿基延伸反應(yīng)中不會(huì)延伸標(biāo)記,可視為實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)中的陰n(見圖 2)。
首都醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文圖中橫軸是 log2(信號值),縱軸是樣本名稱 。紅色熒光表示未甲基化位點(diǎn)的標(biāo)記的 log2(背景值),綠色熒光表示甲基化位點(diǎn)的未標(biāo)記 log2(背景值)結(jié)論:陰性參照探針中綠色熒光 log2(背景值)和上圖的陽性參照的 log2(信值)的差值在 2 個(gè)數(shù)量級以上,洗脫實(shí)驗(yàn)成功。3.2 預(yù)處理后的質(zhì)量控制3.2.1 樣本的質(zhì)控樣本的質(zhì)量控制通過檢測樣本整體的甲基化化程度來進(jìn)行,甲基化程度如下(圖 3)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]PCDH10基因在前列腺癌組織中的甲基化測定及臨床意義[J]. 劉紹祖,佟明,張騫,張蓮,徐奔,李自智,黃偉超,金艷陽. 解放軍醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2014(04)
[2]風(fēng)濕性心臟病患者外周血調(diào)節(jié)性T細(xì)胞與IL-10、TGF-β1的關(guān)系及意義[J]. 莫莉,許禮發(fā). 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2012(10)
[3]Implications of discoveries from genome-wide association studies in current cardiovascular practice[J]. Panniyammakal Jeemon,Kerry Pettigrew,Christopher Sainsbury,Dorairaj Prabhakaran,Sandosh Padmanabhan. World Journal of Cardiology. 2011(07)
[4]阿爾茨海默病患者體內(nèi)端粒甲基化分析[J]. 管靜芝,管維平,朱文華. 軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院學(xué)報(bào). 2011(02)
[5]先天性心臟病圓錐動(dòng)脈干畸形NKX2-5基因CpG島甲基化狀態(tài)分析[J]. 盛偉,王慧君,馬曉靜,李文燦,陳龍,張進(jìn),黃國英,馬端. 中國產(chǎn)前診斷雜志(電子版). 2010(03)
[6]中國心房顫動(dòng)現(xiàn)狀的流行病學(xué)研究[J]. 周自強(qiáng),胡大一,陳捷,張仁漢,李奎寶,趙秀麗. 中華內(nèi)科雜志. 2004(07)
[7]北京地區(qū)非瓣膜病心房顫動(dòng)患者缺血性腦卒中發(fā)生率及影響因素的隨訪研究[J]. 馬長生,周玉杰,馬煜,鄭知?jiǎng)?顏紅兵,王勇,李霄,柯元南,湯旦林. 中華心血管病雜志. 2002(03)
本文編號:3587368
【文章來源】:首都醫(yī)科大學(xué)北京市
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
HybridizationControls雜交質(zhì)控圖
首都醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文中橫軸是 log2(信號值),縱軸是樣本名稱 。紅色熒光表示未甲基化號值),綠色熒光表示甲基化位點(diǎn)的 log2(信號值)。論:紅色熒光和綠色熒光的差值一般是 2 個(gè)數(shù)量級。陽性參照中綠色og2(信號值) >12,標(biāo)記實(shí)驗(yàn)成功。脫實(shí)驗(yàn)的質(zhì)量控制質(zhì)控檢測未標(biāo)記的探針產(chǎn)生的信號值(背景值)。此探針存在于 RA中,探針在單堿基延伸反應(yīng)中不會(huì)延伸標(biāo)記,可視為實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)中的陰n(見圖 2)。
首都醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文圖中橫軸是 log2(信號值),縱軸是樣本名稱 。紅色熒光表示未甲基化位點(diǎn)的標(biāo)記的 log2(背景值),綠色熒光表示甲基化位點(diǎn)的未標(biāo)記 log2(背景值)結(jié)論:陰性參照探針中綠色熒光 log2(背景值)和上圖的陽性參照的 log2(信值)的差值在 2 個(gè)數(shù)量級以上,洗脫實(shí)驗(yàn)成功。3.2 預(yù)處理后的質(zhì)量控制3.2.1 樣本的質(zhì)控樣本的質(zhì)量控制通過檢測樣本整體的甲基化化程度來進(jìn)行,甲基化程度如下(圖 3)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]PCDH10基因在前列腺癌組織中的甲基化測定及臨床意義[J]. 劉紹祖,佟明,張騫,張蓮,徐奔,李自智,黃偉超,金艷陽. 解放軍醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2014(04)
[2]風(fēng)濕性心臟病患者外周血調(diào)節(jié)性T細(xì)胞與IL-10、TGF-β1的關(guān)系及意義[J]. 莫莉,許禮發(fā). 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2012(10)
[3]Implications of discoveries from genome-wide association studies in current cardiovascular practice[J]. Panniyammakal Jeemon,Kerry Pettigrew,Christopher Sainsbury,Dorairaj Prabhakaran,Sandosh Padmanabhan. World Journal of Cardiology. 2011(07)
[4]阿爾茨海默病患者體內(nèi)端粒甲基化分析[J]. 管靜芝,管維平,朱文華. 軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院學(xué)報(bào). 2011(02)
[5]先天性心臟病圓錐動(dòng)脈干畸形NKX2-5基因CpG島甲基化狀態(tài)分析[J]. 盛偉,王慧君,馬曉靜,李文燦,陳龍,張進(jìn),黃國英,馬端. 中國產(chǎn)前診斷雜志(電子版). 2010(03)
[6]中國心房顫動(dòng)現(xiàn)狀的流行病學(xué)研究[J]. 周自強(qiáng),胡大一,陳捷,張仁漢,李奎寶,趙秀麗. 中華內(nèi)科雜志. 2004(07)
[7]北京地區(qū)非瓣膜病心房顫動(dòng)患者缺血性腦卒中發(fā)生率及影響因素的隨訪研究[J]. 馬長生,周玉杰,馬煜,鄭知?jiǎng)?顏紅兵,王勇,李霄,柯元南,湯旦林. 中華心血管病雜志. 2002(03)
本文編號:3587368
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