研究背景:慢性心力衰竭是心血管疾病的終末階段,具有高發(fā)病率、高死亡率的臨床特點(diǎn),心力衰竭誘發(fā)的器官缺血、淤血癥狀在血供分布豐富的腸道表現(xiàn)尤為顯著,因此引起的腸道菌群改變、腸道屏障功能障礙、腸道菌群代謝產(chǎn)物短鏈脂肪酸及三甲胺N-氧化物的含量失衡等都可能和心力衰竭的發(fā)生發(fā)展相關(guān)。研究目的:本研究旨在通過(guò)16SRNA擴(kuò)增子測(cè)序法初步研究心力衰竭患者腸道菌群變化特征。研究方法:27名受試者來(lái)自陜西省人民醫(yī)院2017年10月至2019年12月的門(mén)診體檢人群和心內(nèi)一科的住院患者,分為缺血性心肌病心衰組10例,擴(kuò)張性心肌病心衰組11例及健康對(duì)照組6例。健康對(duì)照組均經(jīng)檢查明確排除高血壓、冠心病、心力衰竭等心血管疾病;不同病因的心力衰竭患者腸道診斷均符合中國(guó)心力衰竭指南2018診斷標(biāo)準(zhǔn)。留取受試者糞便5g用于糞便DNA的提取,利用16S RNA擴(kuò)增子技術(shù)獲得基因序列,Illumina Miseq測(cè)序平臺(tái)分析α多樣性、β多樣性、菌種差異分析等獲取生物學(xué)信息,基于α多樣性指數(shù)及β多樣性指數(shù)利用Wilcoxon秩和檢驗(yàn)對(duì)于三組中兩兩之間進(jìn)行比較并繪制箱式圖,分別反映三組中兩兩之間物種多樣性、豐度及組間菌群結(jié)構(gòu)... 

【文章來(lái)源】：西安醫(yī)學(xué)院陜西省

【文章頁(yè)數(shù)】：64 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

數(shù)據(jù)拆分序列數(shù)目統(tǒng)計(jì)

西安醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)碩士專(zhuān)業(yè)學(xué)位論文33多少個(gè)樣品。圖2各樣本不同分類(lèi)水平OTU數(shù)目說(shuō)明：X軸為各樣本名稱(chēng)，Y軸為各級(jí)OTU數(shù)目。遵循生物學(xué)細(xì)菌分類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)，將細(xì)菌劃分為界、門(mén)、綱、目、科、屬、種水平進(jìn)行注釋。下圖可直觀反映各分組在不同分類(lèi)等級(jí)上的注釋程度。99%OTU均已注釋到目水平，繼續(xù)深度注釋正常人組在科水平可達(dá)97%，而缺血性心肌病心衰組及擴(kuò)張性心肌病心衰組在仍有99%OTU可被注釋到科分級(jí)水平。圖3各組OTU注釋程度說(shuō)明：X軸(SampleName)是分組名，C代表健康對(duì)照組、T1代表缺血性心肌病心衰組、T2代表擴(kuò)張性心肌病心衰組。Y軸(SequenceNumberPercent)表示注釋到該水平的序列數(shù)目占總注釋序列的百分比，柱狀圖中不同區(qū)段的顏色對(duì)應(yīng)于右側(cè)的圖例顏色所代表的注釋水平。3.3稀釋曲線(xiàn)

西安醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)碩士專(zhuān)業(yè)學(xué)位論文33多少個(gè)樣品。圖2各樣本不同分類(lèi)水平OTU數(shù)目說(shuō)明：X軸為各樣本名稱(chēng)，Y軸為各級(jí)OTU數(shù)目。遵循生物學(xué)細(xì)菌分類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)，將細(xì)菌劃分為界、門(mén)、綱、目、科、屬、種水平進(jìn)行注釋。下圖可直觀反映各分組在不同分類(lèi)等級(jí)上的注釋程度。99%OTU均已注釋到目水平，繼續(xù)深度注釋正常人組在科水平可達(dá)97%，而缺血性心肌病心衰組及擴(kuò)張性心肌病心衰組在仍有99%OTU可被注釋到科分級(jí)水平。圖3各組OTU注釋程度說(shuō)明：X軸(SampleName)是分組名，C代表健康對(duì)照組、T1代表缺血性心肌病心衰組、T2代表擴(kuò)張性心肌病心衰組。Y軸(SequenceNumberPercent)表示注釋到該水平的序列數(shù)目占總注釋序列的百分比，柱狀圖中不同區(qū)段的顏色對(duì)應(yīng)于右側(cè)的圖例顏色所代表的注釋水平。3.3稀釋曲線(xiàn)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Eubiotic properties of rifaximin: Disruption of the traditional concepts in gut microbiota modulation[J]. Francesca Romana Ponziani,Maria Assunta Zocco,Francesca D’Aversa,Maurizio Pompili,Antonio Gasbarrini.  World Journal of Gastroenterology. 2017(25)



本文編號(hào)：3538819