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風濕性心臟病腸道菌群宏基因組學分析

發(fā)布時間:2021-11-25 11:56
  [背景與目的]風濕性心臟病是一類嚴重危及人類健康和生命的自身免疫性心臟疾病,云南省處于我國的西南高海拔地區(qū),衛(wèi)生條件落后,其發(fā)病率仍較高,且交通不方便,給予就診造成了巨大的困難。而腸道菌群的變化已經被證實與人體許多自身免疫性疾病有關,基于此,我們通過采用宏基因組學高通量測序技術對風濕性心臟病患者的腸道菌群進行分析,尋找其中起關鍵作用的細菌成分,找到腸道菌群參與風濕性心臟病病理變化過程的證據,鑒定出抗生素的耐藥基因,以便更全面地了解風濕性心臟病患病期間腸道微生物的變化,為臨床選藥和治療提供幫助。[方法]我們收集了 10例風濕性心臟病患者和5例健康對照組的糞便樣本作為研究對象,對15例糞便樣本進行高通量測序,對測序結果進行高級生物信息學分析,包括腸道菌群結構和豐度的分析、KEGG數(shù)據庫注釋分析、COG數(shù)據庫注釋分析、CAZy數(shù)據庫和ARDB注釋。[結果]1.風濕性心臟病患者和健康對照人群的腸道菌群在門水平上主要集中于擬桿菌門(Bacteroidetes)、硬壁菌門(Firmicutes)、變形菌門(Proteobacteria);2.風濕性心臟病患者腸道中擬桿菌科(Bacteroidace... 

【文章來源】:昆明醫(yī)科大學云南省

【文章頁數(shù)】:75 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

風濕性心臟病腸道菌群宏基因組學分析


圖1-3瓊脂糖凝膠電泳結果??1.?10質控結果??

柱狀圖,細菌,豐度,平均豐度


圖1-7門水平物種平均豐度柱狀圖??在種水平上注釋到71種細菌,取平均豐度較高的前9種細菌進行繪圖比較,??其他合并為others,如圖1-8。與對照組相比,??實驗組中?Bacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes?等細菌的豐度下降,??Bamesiella、Odoribacter、Parabacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes、??Clostridium、Eubacterium、Roseburia、Faecalibacterium、Ruminococcus、Dialister、??Megamonas、Escherichia等細菌的豐度上升。??25??

柱狀圖,物種,平均豐度,柱狀圖


——.??圖1-7門水平物種平均豐度柱狀圖??在種水平上注釋到71種細菌,取平均豐度較高的前9種細菌進行繪圖比較,??其他合并為others,如圖1-8。與對照組相比,??實驗組中?Bacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes?等細菌的豐度下降,??Bamesiella、Odoribacter、Parabacteroides、Paraprevotella、Prevotella、Alistipes、??Clostridium、Eubacterium、Roseburia、Faecalibacterium、Ruminococcus、Dialister、??Megamonas、Escherichia等細菌的豐度上升。??25??


本文編號:3518090

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