DVT患者外周血差異表達(dá)circRNA的篩選驗(yàn)證及互作網(wǎng)絡(luò)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-11-09 23:09
[目的]深靜脈血栓形成(DVT)是骨科大手術(shù)后較常見的并發(fā)癥,尤其是髖膝關(guān)節(jié)置換術(shù)后,由于患者腿部靜脈血流瘀滯、內(nèi)皮損傷以及凝血級聯(lián)異常激活,沒有抗凝治療的情況下,DVT發(fā)病率明顯提高。針對DVT分子生物學(xué)水平的調(diào)控機(jī)制,國內(nèi)外進(jìn)行了許多研究,發(fā)現(xiàn)一些微小RNA(miRNA)與DVT發(fā)生發(fā)展相關(guān),但其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)需進(jìn)一步發(fā)掘完善。隨著對非編碼RNA(ncRNA)深入研究,發(fā)現(xiàn)環(huán)狀RNA(circRNA)在血栓性疾病領(lǐng)域具有較強(qiáng)的創(chuàng)新意義,為臨床診療提供了新的研究方向。本項(xiàng)研究通過circRNA芯片技術(shù)檢測DVT患者與對照組外周血中circRNA的表達(dá),篩選出差異表達(dá)的circRNA。采用實(shí)時(shí)定量逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)選定circRNA對芯片結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。通過生物信息學(xué)(Bioin-formatics)手段,包含基因本體(GO)分析和基因與基因組百科全書(KEGG)通路分析預(yù)測差異表達(dá)circRNA的功能。為候選circRNA構(gòu)建circRNA-miRNA-mRNA預(yù)測網(wǎng)絡(luò),豐富miRNA數(shù)據(jù)。為尋找特異性強(qiáng)、靈敏度高的分子標(biāo)志物 以預(yù)測DVT發(fā)生、監(jiān)測DVT進(jìn)程、評估病情及預(yù)...
【文章來源】:昆明醫(yī)科大學(xué)云南省
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?circRNA生物發(fā)生模型??Jeck等也認(rèn)為外顯子型circRNA形成的機(jī)制有套索驅(qū)動(dòng)的環(huán)化和內(nèi)含子配??對驅(qū)動(dòng)的環(huán)化[19]
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圖3?DVT組與對照組差異表達(dá)circRNA箱形圖??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]深靜脈血栓形成炎癥信號通路研究進(jìn)展[J]. 顧燕妮,謝春毅. 中國免疫學(xué)雜志. 2020(01)
[2]創(chuàng)傷后深靜脈血栓形成中的黏著斑激酶信號通路[J]. 莫建文,胡海瀾,白波,李穎,張姝江,陳藝,鄧晉京. 中國組織工程研究與臨床康復(fù). 2011(15)
本文編號:3486080
【文章來源】:昆明醫(yī)科大學(xué)云南省
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?circRNA生物發(fā)生模型??Jeck等也認(rèn)為外顯子型circRNA形成的機(jī)制有套索驅(qū)動(dòng)的環(huán)化和內(nèi)含子配??對驅(qū)動(dòng)的環(huán)化[19]
18?|?,?>?1?1?,?,???16?-??£??14?-??受???書?12?-??Q??"§?10?-??.N??"to??g?8??M?f?l?i?I?H??4?A?B?N1?N3?N4?C??samples??圖3?DVT組與對照組差異表達(dá)circRNA箱形圖??對篩查的circRNA進(jìn)行層次聚類分析,繪制差異表達(dá)circRNA的分層聚類??圖(圖4),以顯示6個(gè)樣本(即3個(gè)DVT患者和3個(gè)對照志愿者)中可區(qū)分的??circRNA表達(dá)譜。紅色表示相對高表達(dá),綠色表示相對低表達(dá)。表達(dá)程度相近的??樣品更易聚類,據(jù)此分析不同樣品之間的關(guān)系。??Color?Key??and?Histogram??imm?I??6?7?8?9?j??j??Value??j??—…??531?^?5=*?^?^??¥?8?在?|?|?|??〇?<?m?〇?o?o??co"?^??圖4?DVT組與對照組差異表達(dá)circRNA分層聚類圖??22??
圖3?DVT組與對照組差異表達(dá)circRNA箱形圖??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]深靜脈血栓形成炎癥信號通路研究進(jìn)展[J]. 顧燕妮,謝春毅. 中國免疫學(xué)雜志. 2020(01)
[2]創(chuàng)傷后深靜脈血栓形成中的黏著斑激酶信號通路[J]. 莫建文,胡海瀾,白波,李穎,張姝江,陳藝,鄧晉京. 中國組織工程研究與臨床康復(fù). 2011(15)
本文編號:3486080
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