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β-654地中海貧血小鼠骨髓紅系終末分化的階段特異性轉(zhuǎn)錄組特征

發(fā)布時(shí)間:2021-11-03 16:31
  目的探索β-654地中海貧血小鼠骨髓紅系終末分化的階段特異性轉(zhuǎn)錄組特點(diǎn)。方法對β-654地中海貧血小鼠及同窩野生對照小鼠進(jìn)行基因型鑒定及外周血涂片染色分析,而后對其骨髓細(xì)胞做流式細(xì)胞分選,收集原始紅、早幼紅、中幼紅和晚幼紅細(xì)胞用于轉(zhuǎn)錄組測序;測序數(shù)據(jù)過濾后進(jìn)行基因差異表達(dá)分析,進(jìn)一步對差異基因做GO富集分析并通過STRING數(shù)據(jù)庫和Cytoscape軟件對其中的上調(diào)基因進(jìn)行蛋白質(zhì)間相互作用網(wǎng)絡(luò)和關(guān)鍵基因分析。結(jié)果β-654地中海貧血小鼠骨髓紅系細(xì)胞與同期正常對照間的差異基因隨分化進(jìn)程逐漸增多;GO分析顯示地中海貧血早幼紅-晚幼紅細(xì)胞分化過程中分子伴侶介導(dǎo)的蛋白質(zhì)折疊過程被逐漸激活,早幼紅-中幼紅時(shí)期氧化還原酶活性上調(diào),中幼紅-晚幼紅時(shí)期泛素蛋白連接酶結(jié)合增強(qiáng);蛋白質(zhì)間相互作用分析發(fā)現(xiàn)分子伴侶中的熱休克蛋白(Hsp)家族成員位于地中海貧血紅系調(diào)控網(wǎng)絡(luò)核心,且隨貧血細(xì)胞向晚期分化該家族核心網(wǎng)絡(luò)成員逐漸增多。結(jié)論β-654地中海貧血小鼠骨髓紅系細(xì)胞終末分化具有階段特異性轉(zhuǎn)錄組變化,Hsp家族介導(dǎo)的蛋白質(zhì)折疊過程隨貧血細(xì)胞分化逐漸增強(qiáng),早中幼紅時(shí)期激活氧化還原反應(yīng),而中晚幼紅時(shí)期以泛素化介導(dǎo)的... 

【文章來源】:基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床. 2020,40(09)CSCD

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

β-654地中海貧血小鼠骨髓紅系終末分化的階段特異性轉(zhuǎn)錄組特征


小鼠骨髓不同成熟階段紅系前體細(xì)胞流式分選圖

涂片,基因型,骨髓,紅細(xì)胞


首先鑒定了地貧小鼠和野生型小鼠的基因型(圖2A);尾靜脈取血進(jìn)行血涂片,可見野生型小鼠外周血紅細(xì)胞呈雙凹圓盤狀(圖2B);而β-654地貧小鼠的紅細(xì)胞大小不一,形狀不規(guī)則,出現(xiàn)球形或口紅形紅細(xì)胞,并可見細(xì)胞碎片(圖2C)。骨髓細(xì)胞流式分析結(jié)果(表1)顯示,地貧小鼠的紅系前體細(xì)胞數(shù)量明顯增多,而網(wǎng)織紅和成熟紅細(xì)胞顯著減少,骨髓呈無效造血狀態(tài)。表1 β-654地貧及對照小鼠骨髓紅系分化各時(shí)期細(xì)胞比例分析Table 1 Proportion of erythroblasts at distinct maturation stages in bone marrow of β-654 thalassemia and control mice ( x ˉ ±s,n=3) stagepercentage(in bonemarrow TER119+cells)genotype ProE BasoE PolyE OrthoE Ret RBC WT 1.0±0.1 2.0±0.2 4.2±0.3 8.8±0.8 35.6±7.6 33.3±0.8 β-654 2.4±0.1** 5.7±0.8* 10.3±1.0* 28.6±0.5** 24.3±3.2 8.6±0.2** ProE.proerythroblasts; BasoE.basophilic erythroblasts; PolyE.polychromatic erythroblasts; OrthoE.orthochromatic erythroblasts; Ret.reticulocytes; RBC.red blood cells; *P<0.01, **P<0.001 compared with WT group.

骨髓,基因圖譜,基因,網(wǎng)絡(luò)分析


2.4 β-654地貧小鼠骨髓紅系差異表達(dá)基因的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析圖4 β-654地貧小鼠骨髓紅系終末分化各時(shí)期相比同期對照細(xì)胞下調(diào)(A)和上調(diào)(B)基因的GO富集分析


本文編號:3474002

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