冠心病相關(guān)SLC22A3基因中新發(fā)現(xiàn)負(fù)性調(diào)控序列的性質(zhì)與功能鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-03-08 21:31
目的:擬對(duì)課題組前期發(fā)現(xiàn)的冠心病相關(guān)SLC22A3基因intron7區(qū)域中的2段DNA負(fù)性調(diào)控序列的性質(zhì)及功能進(jìn)行研究,以明確其為沉默子還是絕緣子。方法:利用生物信息學(xué)分析兩段負(fù)性調(diào)控序列在所培養(yǎng)細(xì)胞系中的脫氧核糖核酸酶I(DNaseI)敏感性,并以包含人SLC22A3基因全長(zhǎng)序列的細(xì)菌人工染色體(bacterial artificial chromosome,BAC)為模板,PCR擴(kuò)增兩負(fù)性調(diào)控序列,以pGL3-Control質(zhì)粒作為工具載體,將兩段序列克隆入報(bào)告基因Luciferase(LUC)的啟動(dòng)子與增強(qiáng)子之間以及增強(qiáng)子的下游,構(gòu)建4組重組質(zhì)粒,并以pGL3-Control質(zhì)粒作為空白對(duì)照,與內(nèi)參質(zhì)粒pRL-SV40共轉(zhuǎn)染人胚腎細(xì)胞HEK293T,24h后檢測(cè)熒光素酶活性。結(jié)果:兩段負(fù)性調(diào)控序列均位于DNaseⅠ超敏位點(diǎn),明確了其為順式調(diào)控元件的性質(zhì)。4組重組質(zhì)粒pGL3-con-SLCi7-447X、pGL3-con-SLCi7-447S、pGL3-con-SLCi7-460X以及pG L3-conSLCi7-460S熒光素酶活性分別為(2.353±0.323)、(3.046...
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁數(shù)】:44 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
重組質(zhì)粒構(gòu)建示意圖
學(xué)分析使用統(tǒng)計(jì)軟件 SPSS 25.0 來分析數(shù)據(jù),熒光素酶活性用 3準(zhǔn)差(x±s)表示,采用單因素方差分析(ANOVA),組當(dāng) P﹤0.05 時(shí),認(rèn)為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。性調(diào)控序列的 DNaseI 敏感性分析相關(guān) SLC22A3 基因 intron7 區(qū)域的兩段負(fù)性調(diào)控序列如圖 2、3 所示,均位于 DNaseⅠ超敏位點(diǎn)。明確了其順式調(diào)控元件中,具備負(fù)性調(diào)控作用的有絕緣子及沉默子,因的功能鑒定試驗(yàn)。DNa
注:X 軸表示 NO10.22 上下游各延伸 100bp 的基因片段(填充區(qū)域?yàn)?NO10.22 片段),Y 軸表示 DNase I-seq 信號(hào)強(qiáng)度圖 3 NO10.22 的 DNA 酶Ⅰ敏感性分析Fig.3 DNaseⅠhypersensitivity of NO10.22質(zhì)粒的構(gòu)建增兩目的序列所得產(chǎn)物 SLCi7-447-X、SLCi7-447-S、SLC-S 通過 1%瓊脂糖凝膠電泳后得到 447bp、447bp、460bp、純化回收后,分別克隆入 pGL3-Control 質(zhì)粒以構(gòu)建重組質(zhì)入啟 動(dòng)子 與增 強(qiáng)子之 間獲 得重組質(zhì)粒 pGL3-con-SLSLCi7-460X,插入增強(qiáng)子下游獲得重組質(zhì)粒 pGL3-con-SLSLCi7-460S;重組質(zhì)粒 pGL3-con-SLCi7-447X、pGL3-con-
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]急性冠脈綜合征優(yōu)化救治策略的研究[J]. 麻樂樂,雷鎮(zhèn)海,蘭衛(wèi)明,柳東杰,何承滿,徐興偉. 中西醫(yī)結(jié)合心血管病電子雜志. 2018(14)
[2]系統(tǒng)性紅斑狼瘡的診斷標(biāo)準(zhǔn)及治療研究進(jìn)展[J]. 董玉梅. 臨床醫(yī)藥文獻(xiàn)電子雜志. 2017(44)
[3]SLC22A3基因負(fù)性調(diào)控元件的定位[J]. 黃博,柳青,雷家儼,丁艷輝,封雪,雷寒. 重慶醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(09)
[4]染色質(zhì)DNaseⅠ超敏感位點(diǎn)的定位及其轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能的研究進(jìn)展[J]. 于文琪,王雅梅. 醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào). 2015(06)
[5]基于表觀基因組學(xué)的DNA元件鑒定方法研究進(jìn)展[J]. 盧一鳴,屈武斌,張成崗. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2014(07)
[6]中國(guó)心血管病報(bào)告2013概要[J]. 陳偉偉,高潤(rùn)霖,劉力生,朱曼璐,王文,王擁軍,吳兆蘇,胡盛壽. 中國(guó)循環(huán)雜志. 2014(07)
[7]高糖刺激INS-1細(xì)胞DNase I表達(dá)升高對(duì)細(xì)胞凋亡的影響[J]. 朱斌,李平,嚴(yán)美花,趙婷婷,王華. 中日友好醫(yī)院學(xué)報(bào). 2014(03)
[8]SLC22A3基因intron7對(duì)基因轉(zhuǎn)錄的負(fù)性調(diào)控作用研究[J]. 封雪,柳青,雷寒,丁艷輝. 重慶醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(05)
[9]ENCODE計(jì)劃和功能基因組研究[J]. 丁楠,渠鴻竹,方向東. 遺傳. 2014(03)
[10]脫氧核糖核酸酶Ⅰ在急性冠狀動(dòng)脈綜合征診斷中的應(yīng)用[J]. 何旋芳,卞金陵. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2011(15)
博士論文
[1]DNaseⅠ與2型糖尿病胰腺損傷關(guān)系探討:從Bcl-2/Caspase-3通路探討高血糖環(huán)境中DNaseⅠ增高與胰腺損傷的關(guān)系[D]. 朱斌.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2014
本文編號(hào):3071704
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁數(shù)】:44 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
重組質(zhì)粒構(gòu)建示意圖
學(xué)分析使用統(tǒng)計(jì)軟件 SPSS 25.0 來分析數(shù)據(jù),熒光素酶活性用 3準(zhǔn)差(x±s)表示,采用單因素方差分析(ANOVA),組當(dāng) P﹤0.05 時(shí),認(rèn)為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。性調(diào)控序列的 DNaseI 敏感性分析相關(guān) SLC22A3 基因 intron7 區(qū)域的兩段負(fù)性調(diào)控序列如圖 2、3 所示,均位于 DNaseⅠ超敏位點(diǎn)。明確了其順式調(diào)控元件中,具備負(fù)性調(diào)控作用的有絕緣子及沉默子,因的功能鑒定試驗(yàn)。DNa
注:X 軸表示 NO10.22 上下游各延伸 100bp 的基因片段(填充區(qū)域?yàn)?NO10.22 片段),Y 軸表示 DNase I-seq 信號(hào)強(qiáng)度圖 3 NO10.22 的 DNA 酶Ⅰ敏感性分析Fig.3 DNaseⅠhypersensitivity of NO10.22質(zhì)粒的構(gòu)建增兩目的序列所得產(chǎn)物 SLCi7-447-X、SLCi7-447-S、SLC-S 通過 1%瓊脂糖凝膠電泳后得到 447bp、447bp、460bp、純化回收后,分別克隆入 pGL3-Control 質(zhì)粒以構(gòu)建重組質(zhì)入啟 動(dòng)子 與增 強(qiáng)子之 間獲 得重組質(zhì)粒 pGL3-con-SLSLCi7-460X,插入增強(qiáng)子下游獲得重組質(zhì)粒 pGL3-con-SLSLCi7-460S;重組質(zhì)粒 pGL3-con-SLCi7-447X、pGL3-con-
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]急性冠脈綜合征優(yōu)化救治策略的研究[J]. 麻樂樂,雷鎮(zhèn)海,蘭衛(wèi)明,柳東杰,何承滿,徐興偉. 中西醫(yī)結(jié)合心血管病電子雜志. 2018(14)
[2]系統(tǒng)性紅斑狼瘡的診斷標(biāo)準(zhǔn)及治療研究進(jìn)展[J]. 董玉梅. 臨床醫(yī)藥文獻(xiàn)電子雜志. 2017(44)
[3]SLC22A3基因負(fù)性調(diào)控元件的定位[J]. 黃博,柳青,雷家儼,丁艷輝,封雪,雷寒. 重慶醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(09)
[4]染色質(zhì)DNaseⅠ超敏感位點(diǎn)的定位及其轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能的研究進(jìn)展[J]. 于文琪,王雅梅. 醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào). 2015(06)
[5]基于表觀基因組學(xué)的DNA元件鑒定方法研究進(jìn)展[J]. 盧一鳴,屈武斌,張成崗. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2014(07)
[6]中國(guó)心血管病報(bào)告2013概要[J]. 陳偉偉,高潤(rùn)霖,劉力生,朱曼璐,王文,王擁軍,吳兆蘇,胡盛壽. 中國(guó)循環(huán)雜志. 2014(07)
[7]高糖刺激INS-1細(xì)胞DNase I表達(dá)升高對(duì)細(xì)胞凋亡的影響[J]. 朱斌,李平,嚴(yán)美花,趙婷婷,王華. 中日友好醫(yī)院學(xué)報(bào). 2014(03)
[8]SLC22A3基因intron7對(duì)基因轉(zhuǎn)錄的負(fù)性調(diào)控作用研究[J]. 封雪,柳青,雷寒,丁艷輝. 重慶醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(05)
[9]ENCODE計(jì)劃和功能基因組研究[J]. 丁楠,渠鴻竹,方向東. 遺傳. 2014(03)
[10]脫氧核糖核酸酶Ⅰ在急性冠狀動(dòng)脈綜合征診斷中的應(yīng)用[J]. 何旋芳,卞金陵. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2011(15)
博士論文
[1]DNaseⅠ與2型糖尿病胰腺損傷關(guān)系探討:從Bcl-2/Caspase-3通路探討高血糖環(huán)境中DNaseⅠ增高與胰腺損傷的關(guān)系[D]. 朱斌.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2014
本文編號(hào):3071704
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