LAMP2基因啟動(dòng)子在心肌梗死病人中遺傳和功能變異研究
發(fā)布時(shí)間:2020-05-28 23:18
【摘要】:背景:心肌梗死(myocardial infarction,MI)是冠心病(Coronary a rtery disease,CAD)中最常見且主要的一類疾病,其發(fā)病趨勢(shì)呈逐年增長(zhǎng),且發(fā)病年齡也漸趨年輕化,已然對(duì)人類健康構(gòu)成了不可估量的影響。吸煙、高血壓、高血脂和遺傳等危險(xiǎn)因素對(duì)CAD的影響已成為國內(nèi)外學(xué)者的共識(shí)。近年來,對(duì)遺傳學(xué)逐漸深入認(rèn)知,全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-wide association study,GWAS)發(fā)現(xiàn):有200多個(gè)與C AD有關(guān)聯(lián)的染色體基因位點(diǎn)存在。II型溶酶體相關(guān)膜蛋白(Lysosome-associated membrane protein-2,LAMP2)屬于新發(fā)現(xiàn)的抗中性粒細(xì)胞胞漿抗體中的一種,其位于性染色體Xq24~Xq25上,編碼LAMP2蛋白,該蛋白在細(xì)胞自噬的過程中有著關(guān)鍵作用。在LAMP2缺乏的成纖維細(xì)胞中,膽固醇的酯化出現(xiàn)障礙,大部分未進(jìn)行酯化的膽固醇聚集在晚期的內(nèi)體和溶酶體中,引起了膽固醇聚集的現(xiàn)象,誘發(fā)動(dòng)脈粥樣硬化斑塊的形成。在CAD患者的外周粒細(xì)胞中,LAMP2基因的表達(dá)水平升高明顯,引起膽固醇代謝異常,引起動(dòng)脈粥樣硬化,促使CAD的發(fā)生與發(fā)展。目的:通過研究AMI組病人與健康對(duì)照組中LAMP2基因啟動(dòng)子的序列變異情況,將有變異的基因序列構(gòu)建成pGL3-basic表達(dá)載體,通過對(duì)熒光素酶的活性進(jìn)行檢測(cè),分析LAMP2基因表達(dá)水平的情況,從而探討LAMP2基因在心肌梗死的發(fā)生發(fā)展中的作用。方法:1本研究納入324例AMI患者、310例同期健康對(duì)照者,分別對(duì)兩組人群的臨床基線資料進(jìn)行統(tǒng)計(jì),并提取其DNA。2參考NCBI基因數(shù)據(jù)庫上提供的人LAMP2基因啟動(dòng)子序列,設(shè)計(jì)并合成引物。運(yùn)用PCR方法,擴(kuò)增LAMP2基因啟動(dòng)子的目的片段,測(cè)序擴(kuò)增后序列,參照測(cè)序結(jié)果統(tǒng)計(jì)分析LAMP2基因序列的變異情況。3根據(jù)野生型、變異型LAMP2基因啟動(dòng)子序列,通過克隆技術(shù)構(gòu)建pGL3-basic基因重組質(zhì)粒,設(shè)pRL-TK為內(nèi)參,將重組質(zhì)粒、p GL3-basic空載體及pRL-TK通過體外脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染人胚腎細(xì)胞與大鼠心肌細(xì)胞系中。運(yùn)用Promega基因分析儀,檢測(cè)螢火蟲熒光素酶活性、海腎熒光素酶活性,計(jì)算兩者比值,探討遺傳變異對(duì)LAMP2基因啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄活性所帶來的影響。結(jié)果:1經(jīng)過測(cè)序看圖后總共發(fā)現(xiàn)8個(gè)DSVs,其中包含了6個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SNPs)。在AMI組人群中,3個(gè)SNPs,分別是:g.120469493GT(Rs868454097)、g.120469262TC(Rs1044167843)、g.120469507insG(Rs1192960118),1個(gè)雜合DSV:g.120469510AG。在對(duì)照組人群中,發(fā)現(xiàn)1個(gè)雜合插入的DSV:g.120469183insCTGCCGC CG,1個(gè)SNP:g.120469730TC(Rs1395931999)。在AMI組及對(duì)照組人群中同時(shí)發(fā)現(xiàn)了2個(gè)SNPs,分別是:g.120469779AC(Rs42900)、g.120469590TG(Rs28603270)。對(duì)比兩組數(shù)據(jù)頻率值,發(fā)現(xiàn)g.120469590TG(Rs28603270)兩組頻率間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),而g.120469779AC(Rs42900)的兩組頻率間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。2對(duì)LAMP2基因啟動(dòng)子的pGL3-basic基因載體進(jìn)行構(gòu)建,分別如下:pGL3-basic(陰性對(duì)照)、pGL3-WT(野生型)、pGL3-120469730C、pGL3-120469493T、pGL3-120469510G、pGL3-120469262T、pGL3-120469183insCTGCCGCCG。3通過體外脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染HEK293與H9c2中,運(yùn)用雙熒光報(bào)告系統(tǒng),檢測(cè)螢火蟲熒光素酶活性、海腎熒光素酶活性,計(jì)算兩者比值。只在AMI組中發(fā)現(xiàn)的DSVs顯著影響LAMP2啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄活性,其中g(shù).120469493GT(Rs868454097)、g.120469262CT(Rs1044167843)(P0.01)顯著降低了LAMP2基因啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄活性;g.120469510AG(P0.01)顯著增加了LAMP2基因啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄活性;只在對(duì)照組中發(fā)現(xiàn)的DSVs(g.120469183insCTGCCGCCG、g.120469730TC(Rs1395931999))并未改變LAMP2基因啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄活性(P0.05);同時(shí)在AMI組和對(duì)照組中DSVs g.120469779AC(Rs42900)、g.120469590TG(Rs28603270)并未改變基因啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄活性。結(jié)論:在心肌梗死的病人中,經(jīng)過研究LAMP2基因啟動(dòng)子的遺傳與變異情況發(fā)現(xiàn):在LAMP2基因啟動(dòng)子上,其變異序列可能影響了其啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄活性,進(jìn)而影響了基因的表達(dá)。因此,其可能在心肌梗死的發(fā)病過程中起著重要作用,為心肌梗死的發(fā)病機(jī)制、診斷、治療及預(yù)防提供了新方向。
【圖文】:
圖 1-b LAMP2 基因啟動(dòng)子擴(kuò)增片段 2(604bp)。泳道 1-10 為 LAMP2 基因啟動(dòng)子片段 2 擴(kuò)增產(chǎn)物,泳道 11 為 D2000 Plus marker。圖-2 AMI 組和正常對(duì)照組的 LAMP2 基因(Genebank 收錄號(hào):NG_000023.11)啟動(dòng)子的 DSVs位置。TSS 位于第一外顯子起始位點(diǎn) 120469169(+1)。-200Exon1-400-600-800g.120469183 insCTGCCGCCGg.120469262T>Cg.120469493G>Tg.120469507insGg.120469510A>Gg.120469590T>Gg.120469730T>Cg.120469779A>C
濟(jì)寧醫(yī)學(xué)院碩士專業(yè)學(xué)位論文61圖-3:AMI 組中發(fā)現(xiàn)的 DSVs 反向測(cè)序圖,DSVs g.120469493G>T 、g.120469507insG 和g.120469262T>C,上為野生型,下為雜合型,下為克隆后測(cè)序圖譜。箭頭標(biāo)示為變異位點(diǎn)。
【學(xué)位授予單位】:濟(jì)寧醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R542.22
本文編號(hào):2685988
【圖文】:
圖 1-b LAMP2 基因啟動(dòng)子擴(kuò)增片段 2(604bp)。泳道 1-10 為 LAMP2 基因啟動(dòng)子片段 2 擴(kuò)增產(chǎn)物,泳道 11 為 D2000 Plus marker。圖-2 AMI 組和正常對(duì)照組的 LAMP2 基因(Genebank 收錄號(hào):NG_000023.11)啟動(dòng)子的 DSVs位置。TSS 位于第一外顯子起始位點(diǎn) 120469169(+1)。-200Exon1-400-600-800g.120469183 insCTGCCGCCGg.120469262T>Cg.120469493G>Tg.120469507insGg.120469510A>Gg.120469590T>Gg.120469730T>Cg.120469779A>C
濟(jì)寧醫(yī)學(xué)院碩士專業(yè)學(xué)位論文61圖-3:AMI 組中發(fā)現(xiàn)的 DSVs 反向測(cè)序圖,DSVs g.120469493G>T 、g.120469507insG 和g.120469262T>C,上為野生型,下為雜合型,下為克隆后測(cè)序圖譜。箭頭標(biāo)示為變異位點(diǎn)。
【學(xué)位授予單位】:濟(jì)寧醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R542.22
【參考文獻(xiàn)】
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2 李婷婷;抗LAMP2單克隆抗體的制備及初步鑒定[D];延安大學(xué);2013年
,本文編號(hào):2685988
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