動脈粥樣硬化易感基因挖掘與生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2018-07-03 13:08
本文選題:動脈粥樣硬化 + 易感基因; 參考:《中國老年學(xué)雜志》2017年24期
【摘要】:目的挖掘動脈粥樣硬化(AS)易感基因,為尋找AS正確的診斷和治療方法提供線索和數(shù)據(jù)支撐。方法從Pub Med、OMIM和GEO數(shù)據(jù)庫檢索AS相關(guān)數(shù)據(jù),利用SMD在線工具對AS易感基因進(jìn)行染色體定位,并通過DAVID和STRING10.0軟件進(jìn)行基因功能注釋和蛋白互作分析。結(jié)果共獲得AS易感基因454個(gè),其染色體定位分布不均勻,以1、11、2和4號分布較多,Y染色體多于X染色體上的分布;AS易感基因富集在24個(gè)生物學(xué)功能注釋單元中,其中44個(gè)編碼蛋白存在互作關(guān)系,涉及多種生物學(xué)過程和分子功能。結(jié)論 AS易感基因的控掘與生物信息分析為AS的分子水平機(jī)制研究提供了數(shù)據(jù)平臺,為多基因復(fù)雜疾病的基因挖掘提供了有效方法。
[Abstract]:Objective to explore the susceptibility gene of atherosclerosis (as) and to provide clues and data support for the correct diagnosis and treatment of as. Methods the AS-related data were retrieved from the database of Pub MedOMIM and GEO, and chromosomal mapping of as susceptibility genes was carried out by using SMD online tool, and gene function annotation and protein interaction analysis were carried out by DAVID and STRING10.0 software. Results A total of 454 AS-susceptible genes were obtained, and their chromosomal location was not uniform. The distribution of AS-susceptible genes on chromosome 1, 11, 2 and 4 was more than that on chromosome X, and was concentrated in 24 biological function annotation units. Among them, 44 encoded proteins are interacted, involving many biological processes and molecular functions. Conclusion the analysis of as susceptibility genes and biological information provides a data platform for the study of molecular mechanism of as and an effective method for gene mining of polygenic complex diseases.
【作者單位】: 河北北方學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)院生物化學(xué)教研室;河北北方學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)影像學(xué)系;
【分類號】:R543.5
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,本文編號:2093755
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