本文選題：單核苷酸多態(tài)性 + 限制性擴增片段長度多態(tài)性��； 參考：《新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院》2016年碩士論文

【摘要】：背景慢性充血性心力衰竭(chronic heart failure,CHF)是一種嚴重影響人類健康的一種疾病�，F(xiàn)在人們正在深入探索該疾病發(fā)生的分子機制�；|(zhì)金屬蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)活性的增強與表達的改變,對脈管系統(tǒng)及心臟組織的重構(gòu)產(chǎn)生嚴重的影響,造成心血管系統(tǒng)的損害,結(jié)果將會造成心功能惡化甚至心衰。目的研究MMPs基因啟動子區(qū)5個單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)與河南漢族群體慢性充血性心力衰竭的關(guān)系,以探討河南漢族群體慢性充血性心力衰竭發(fā)病的分子機制。方法1、樣本收集與基因組DNA提取:根據(jù)知情同意的原則,收集CHF患者160例,正常對照186例,酚/氯仿方法提取基因組DNA。2、SNPs位點檢測及分型方法:采用限制性擴增片段長度多態(tài)性(polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)的方法檢測MMPs基因rs2285053,rs243865,rs11568818,rs11225395及rs225207共5個單核苷酸多態(tài)性。3、統(tǒng)計學(xué)原理分析:將不同的每組基因型及等位基因制成Excle表格,采用病例-對照分析,運用SHEsis軟件,將病例組與對照組間頻數(shù)及頻率分布進行比較分析、Hardy-Weinberg平衡檢驗、單體型推斷、比值比(odd ratio,OR)及95%置信區(qū)間(confidence interval,CI)計算;并分析3個多態(tài)連鎖不平衡(linkage d isequilibrium,LD)緊密程度。所有統(tǒng)計檢驗均為雙側(cè)檢驗,檢驗水準α=0.05。如果計算結(jié)果不符合統(tǒng)計學(xué)中的正態(tài)分布,通過平方根轉(zhuǎn)換后,進行t檢驗。結(jié)果1、MMPs基因型分布Hardy-Weinberg平衡檢驗:rs2285053、rs11225395及rs225207 3個SNPs位點的基因及基因型頻率在兩組人群中符合Hardy-Weinberg平衡(P0.05)。rs243865位點基因型全部為CC,rs11568818位點基因型全部為AA,有可能rs243865及rs11568818在河南漢族人群中沒有多態(tài)性,因此不予分析。2、MMPs基因3個SNPs與CHF之間的相關(guān)性:心衰組rs2285053位點的T等位基因頻率降低(P=0.043);心衰組rs11225395位點的T等位基因的頻率顯著降低(P=0.004),OR=1.966[95%CI(1.236-3.129)],TT基因型頻率與對照組相比也顯著降低(P=0.009);rs225207的G等位基因頻率顯著增加(P=0.002),OR=0.499[95%CI(0.320-3.779)],GG基因型頻率與對照組相比也顯著增加(P=0.007)。3、MMPs基因啟動區(qū)3個SNPs單體型分析:CCG單體型的頻率在病例組顯著高于對照組(P0.01),OR=3.436[95%CI(1.888~6.253)]。結(jié)論1、與對照組相比,心衰組rs2285053及rs11225395位點的T等位基因頻率降低,rs225207位點的G等位基因及單體型CCG的頻率升高;2、rs2285053及rs11225395位點的T等位基因可能會降低個體慢性充血性心力衰竭的患病風(fēng)險,rs225207位點的G等位基因及單體型CCG可能會增加個體慢性充血性心力衰竭的患病風(fēng)險。
[Abstract]:Background chronic congestive heart failure (chronic heart) is a serious disease affecting human health. The molecular mechanism of the disease is now being explored in depth. The enhancement and expression of matrix metalloproteinases (MMPs) have a serious effect on the remodeling of vascular system and heart tissue, resulting in the damage of cardiovascular system, resulting in the deterioration of cardiac function and even heart failure. Objective to study the relationship between five single nucleotide polymorphisms (single nucleotide polymorphismsns) of MMPs gene promoter region and chronic congestive heart failure (CHF) in Henan Han population, and to explore the molecular mechanism of CHF in Henan Han population. Methods 1. Sample collection and genomic DNA extraction: 160 CHF patients and 186 normal controls were collected according to the principle of informed consent. Detection and typing of genomic DNA.2SNPs by phenol / chloroform method: restriction amplified fragment length polymorphism (polymerase chain reaction) was used to detect 5 single nucleotide polymorphisms (s2285053rs243865rs11568818rs11225395 and rs225207). Analysis: make different groups of genotypes and alleles into an Excle table, The frequency and frequency distribution between the case group and the control group were compared and analyzed by case-control analysis and SHEsis software. The Hardy-Weinberg equilibrium test, haplotype inference, odd ratioor and 95% confidence interval (confidence intervalval CI) were calculated. The tightness of three polymorphic linkage disequilibrium (linkage d isequilibrium LD) was analyzed. All the statistical tests were bilateral, and the test level was 0. 05. If the calculated results do not conform to the normal distribution in statistics, the t-test is carried out after the square root conversion. Results 1. Hardy-Weinberg equilibrium test showed that the gene and genotype frequencies of the three SNPs loci in the two groups were in accordance with the Hardy-Weinberg equilibrium (P0.05) .rs243865 alleles were all CCRs11568818 alleles. It may be that rs243865 and rs11568818 are all AAs in Han Han, Henan Province. There is no polymorphism in the ethnic group, Therefore, the correlation between three SNPs of MMPs gene and CHF was not analyzed: the frequency of T allele at rs2285053 locus in heart failure group was decreased (P0.043), and the frequency of T allele at rs11225395 locus in heart failure group was significantly lower than that in control group (P0. 004), and the frequency of TT genotype was also significantly lower than that in control group (P0. 004). The G allele frequency of Rs225207 decreased significantly (P0. 002) ORO 0.499 [95CI (0.320-3.779)] GG genotype frequency was also significantly increased compared with the control group (P0. 007). 3 SNPs haplotype analysis of three SNPs haplotypes of MMPs gene promoter region in the case group was significantly higher than that in the control group (P0.01) OR3.436 [95CI (1. 888m6.253)]. Conclusion 1.Compared with the control group, Lower T allele frequency at rs2285053 and rs11225395 loci in heart failure group A decrease in G allele at rs225207 locus and an increase in haplotype CCG allele T alleles at rs2285053 and rs11225395 locus may reduce the risk of chronic congestive heart failure (CHF) in individuals with chronic congestive heart failure (CHF). G allele and haplotype CCG may increase the risk of chronic congestive heart failure.
【學(xué)位授予單位】：新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R541.6

【相似文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 張愛平;劉超;劉長暉;;Y染色體SNPs及其在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用[J];刑事技術(shù);2009年05期

2 何瓊;劉長暉;王慧君;劉超;;熒光標記線粒體DNA SNPs檢測體系建立及單倍型頻率調(diào)查[J];中山大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)科學(xué)版);2011年01期

3 劉超;陳麗偉;劉長暉;李越;李健偉;張愛平;葛璐璐;;47個SNPs復(fù)合檢測方法的建立及其法醫(yī)學(xué)應(yīng)用[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2009年04期

4 李忠華;扎拉嘎白乙拉;侯一平;;表型信息SNPs在法醫(yī)學(xué)中的研究進展[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2013年03期

5 ;Identification of a combination of SNPs associated with Graves' disease using swarm intelligence[J];Science China(Life Sciences);2011年02期

6 陳麗偉;劉長暉;劉超;;常用法醫(yī)學(xué)SNPs分型技術(shù)對比及應(yīng)用[J];中山大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)科學(xué)版);2008年S2期

7 崔雄鷹;李麗;;HLA區(qū)域SNPs的檢測及應(yīng)用[J];分子診斷與治療雜志;2010年03期

8 林曉燕;黃代新;翟仙敦;林宇新;李小廷;楊慶恩;;印記基因H19上游高甲基化區(qū)SNPs多態(tài)性研究[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2008年05期

9 孔界;艾山江·亞琛;張孝林;趙大勇;吳兵;張宴;張徐祥;程樹培;;飲用水源致癌風(fēng)險早期預(yù)警SNPs監(jiān)測技術(shù)[J];環(huán)境監(jiān)控與預(yù)警;2010年01期

10 羅良鳴;吳響;;HLA區(qū)域SNPs及其在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用價值[J];刑事技術(shù);2006年05期

相關(guān)會議論文 前10條

1 ;Elevated plasma IL-13 levels in patients with chronic obstructive pulmonary disease[A];中華醫(yī)學(xué)會呼吸病學(xué)年會——2011（第十二次全國呼吸病學(xué)學(xué)術(shù)會議）論文匯編[C];2011年

2 張成孝;;Fluorescent identification of four mutation products of SNPs using a abasic site-containing DNA strand and four fluorescent ligands[A];第六屆海峽兩岸分析化學(xué)會議摘要論文集[C];2010年

3 ;SNPs of GH Gene Characterized by PCR-SSCP Analysis and Search for Their Associations with Milk Yield in Goat[A];第十次全國畜禽遺傳標記研討會論文集[C];2006年

4 Fangge Li;Zhipeng Wang;Hui Li;;Genome-wide SNPs Interaction Analysis of Abdominal Fat Traits in Chicken[A];第五屆全國生物信息學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)學(xué)術(shù)大會論文集[C];2012年

5 高雪;吳慧光;許尚忠;陳金寶;任紅艷;;基于生物信息學(xué)對牛CAPN1基因的SNPs篩查與驗證[A];中國動物遺傳育種研究進展——第十五次全國動物遺傳育種學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2009年

6 ;Development and application of rice whole genome single nucleotide polymorphisms (SNPs) detection platforms[A];第十一屆全國植物基因組學(xué)大會摘要集[C];2010年

7 鄒喻蘋;葛頌;;新一代分子標記——SNPs及其應(yīng)用[A];中國植物學(xué)會七十周年年會論文摘要匯編（1933—2003）[C];2003年

8 王鳳麗;曾翠平;楚原夢冉;劉榜;;豬FKTN基因的SNPs掃描及其與經(jīng)濟性狀的關(guān)聯(lián)分析[A];第十二次全國畜禽遺傳標記研討會論文集[C];2010年

9 Y. L. Jiang;N. Li;G.Plastow;Z. L. Liu;X. X. Hu;C. X. Wu;;IDENTIFICATION OF THREE SNPs IN THE PORCINE MYOSTATIN GENE(MSTN)[A];第六屆動物遺傳學(xué)討論會論文集[C];2002年

10 于子輝;劉小芳;;SNPs分型檢測方法綜述[A];中國法醫(yī)學(xué)理論與實踐創(chuàng)新成果精選——全國第九次法醫(yī)學(xué)術(shù)交流會論文集[C];2013年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 李莉;細胞色素P450酶SNPs以及蛋白質(zhì)—小分子相互作用的研究[D];上海交通大學(xué);2013年

2 婁春光;44個SNPs位點復(fù)合分型體系的構(gòu)建及其法醫(yī)學(xué)應(yīng)用[D];河北醫(yī)科大學(xué);2010年

3 王茜;55-SNPs個體識別復(fù)合分型體系的構(gòu)建及法醫(yī)學(xué)應(yīng)用研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2015年

4 郭宏;牛12個基因的分離、定位、表達特征、SNPs檢測及其與部分性狀的關(guān)聯(lián)分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2006年

5 孫繼亞;基于腦部轉(zhuǎn)錄組和GWAS數(shù)據(jù)的阿爾茲海默病致病機理和基因內(nèi)SNPs相互作用的分析[D];中國科學(xué)院北京基因組研究所;2014年

6 劉榜;15個豬品種MHCⅡ類區(qū)4個基因的SNPs分析及與免疫性狀的關(guān)聯(lián)[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2003年

7 唐敏;多個心血管疾病易感基因SNPs與中國漢族人群血壓和血脂的相關(guān)性探討[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2007年

8 岳炫燁;染色體9p21區(qū)SNPs與中國漢族人腦梗死的關(guān)聯(lián)研究[D];南京大學(xué);2011年

9 張小輝;牛9個繁殖性狀相關(guān)基因cDNA克隆，，SNPs及組織表達研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2007年

10 高汝飛;西方人群中蛋白質(zhì)酪氨酸激酶JAK2~(V617F)突變體與鄰近SNPs之間相關(guān)性的分析及JAK2~(V617F)檢測新方法的建立[D];吉林大學(xué);2011年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 陶歡;水稻品種CO39及其NILs基因組重測序序列的組裝與SNPs分析[D];福建農(nóng)林大學(xué);2016年

2 張琪;廣西漢族、壯族和侗族omentin基因啟動子區(qū)和信號肽區(qū)SNPs鑒定及遺傳學(xué)分析[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2016年

3 李鵬舉;單核苷酸多態(tài)性北京杭州廣州三地中國人群前列腺癌相關(guān)性研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2016年

4 韓宜成;基于JAVA WEB的SNPs分析網(wǎng)站的設(shè)計[D];天津理工大學(xué);2016年

5 劉亞靜;MMPs基因啟動子區(qū)5個SNPs與河南漢族群體CHF遺傳易感性的關(guān)聯(lián)研究[D];新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院;2016年

6 王玲燕;影響多聚腺苷化效能的全基因組SNPs的提取方法[D];廈門大學(xué);2014年

7 楊棟;中國漢族人群CYP2D6，CYP3A4 SNPs位點基因多態(tài)性分析[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2013年

8 陳月嬋;豬TLR3基因的SNPs功能分析[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

9 高小勁;中國漢族原發(fā)性閉角型青光眼患者候選基因的SNPs位點與疾病的相關(guān)性分析[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2012年

10 何瓊;MtDNA SNPs復(fù)合檢測體系建立及法醫(yī)學(xué)應(yīng)用研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2010年

本文編號：2091724