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人類珠蛋白相關(guān)基因上游開放閱讀框的變異分析

發(fā)布時(shí)間:2018-04-17 02:39

  本文選題:β-地中海貧血 + 突變 ; 參考:《遺傳》2017年03期


【摘要】:β-地中海貧血癥是一種珠蛋白生成障礙的常染色體隱性遺傳病。而γ珠蛋白基因的開放表達(dá)和胎兒血紅蛋白的合成,是緩解β地中海貧血病人臨床表型的一個(gè)重要因素。本研究針對(duì)202個(gè)血紅蛋白相關(guān)調(diào)控基因或mi RNA,對(duì)1802個(gè)β-地中海貧血癥患者進(jìn)行了目標(biāo)區(qū)域捕獲測(cè)序。通過生物信息學(xué)的分析,檢測(cè)出了所有捕獲區(qū)域內(nèi)的突變。進(jìn)一步對(duì)位于5′端非編碼區(qū)(5′untranslated region,5′UTR)的突變進(jìn)行系統(tǒng)掃描,共計(jì)尋找到41個(gè)影響u ORF(upstream open reading frame,u ORF)有或無的功能性突變。從中選取了CHTOP基因(chr1:153606541 CT)和TGFB1基因(chr19:41859418 GA)的兩個(gè)突變,通過定點(diǎn)誘變和雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn),在體外證實(shí)這兩個(gè)突變均可顯著地改變下游基因的表達(dá)。該研究結(jié)果為β-地中海貧血癥臨床表型的精確診斷提供了潛在的篩查靶點(diǎn)。
[Abstract]:尾-thalassemia is an autosomal recessive disorder of globin formation.The open expression of 緯 -globin gene and the synthesis of fetal hemoglobin are important factors to alleviate the clinical phenotype of 尾 -thalassemia patients.In this study, 182 尾-thalassemia patients were sequenced by targeting 202 hemoglobin related regulatory genes or mi RNAs.The mutations in all capture regions were detected by bioinformatics analysis.Furthermore, the mutations located in the 5'untranslated region (5'untranslated region) were systematically scanned. A total of 41 functional mutations affecting u ORF(upstream open reading frame ORF(upstream were found.Two mutations of CHTOP gene chr1: 153606541) and TGFB1 gene chr19: 41859418) were selected. By site-directed mutagenesis and double-luciferase report experiment, it was proved that the two mutations could significantly alter the expression of downstream genes in vitro.The results provide a potential screening target for the accurate diagnosis of the clinical phenotype of 尾-thalassemia.
【作者單位】: 南方醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教研室;
【基金】:教育部博士點(diǎn)基金優(yōu)先資助領(lǐng)域重點(diǎn)項(xiàng)目(編號(hào):20134433130001) 國家自然科學(xué)基金委員會(huì)-廣東省人民政府聯(lián)合基金課題(編號(hào):U1201222)資助~~
【分類號(hào)】:R556.61

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本文編號(hào):1761733

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