本文關(guān)鍵詞： 冠心病 支架內(nèi)再狹窄 miRNA 靶基因 生物信息學(xué)　出處：《青島大學(xué)》2016年博士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：背景Micro RNA(mi RNA)是一類在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因表達(dá)的非編碼RNA,目前發(fā)現(xiàn)它廣泛參與了心血管疾病各個(gè)過程。支架內(nèi)再狹窄(ISR)目前已經(jīng)成為冠脈介入治療術(shù)后有待解決的重大難題,現(xiàn)推測mi RNA可能在ISR中發(fā)揮重要作用。本研究將對mi RNA在ISR發(fā)病機(jī)制中的作用進(jìn)行初步探討。目的篩選出ISR患者特異性表達(dá)的mi RNA,分析其相對表達(dá)量與臨床的相關(guān)性,初步探討mi RNA及其靶基因在ISR中可能的作用機(jī)制。方法通過mi RNA基因芯片技術(shù)篩選ISR患者血漿mi RNA的表達(dá)譜差異,以篩選出與ISR相關(guān)的mi RNA;通過Real-time PCR對mi RNA的相對表達(dá)量與ISR進(jìn)行相關(guān)性分析及驗(yàn)證,最終將篩選出特異性的mi RNA用作ISR高危人群的標(biāo)記物;通過生物信息學(xué)技術(shù)對mi RNA靶基因進(jìn)行預(yù)測,并對mi RNA的下游靶基因網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘,構(gòu)建ISR相關(guān)mi RNA-Gene-Network網(wǎng)絡(luò),探討其在ISR中可能的作用機(jī)制。結(jié)果通過高通量mi RNA芯片檢測,篩選獲得了一批在ISR患者中差異表達(dá)的mi RNA,其中43個(gè)基因表達(dá)下調(diào),10個(gè)基因表達(dá)上調(diào)。通過生物信息學(xué)方法及Real-time PCR對基因芯片結(jié)果進(jìn)行了分析及驗(yàn)證,通過比較及ROC曲線分析,發(fā)現(xiàn)hsa-mi R-126可以作為冠心病患者ISR早期診斷的潛在分子標(biāo)志物,血漿hsa-mi R-126水平下降傾向于發(fā)生ISR。通過生物信息學(xué)方法,預(yù)測了mi R-126的靶基因,構(gòu)建了mi R-126及其靶基因的信號通路,并發(fā)現(xiàn)了16個(gè)潛在Gene靶點(diǎn)和24個(gè)潛在mi RNA靶點(diǎn)可能也參與了該信號網(wǎng)絡(luò),而這些潛在的靶點(diǎn)中也可能存在ISR的關(guān)鍵基因。結(jié)論本研究表明mi RNA在ISR發(fā)病中起重要作用,hsa-mi R-126下降可以作為冠心病患者支架術(shù)后容易發(fā)生ISR的早期診斷標(biāo)志物。但hsa-mi R-126在ISR中的作用機(jī)制復(fù)雜,它可能通過調(diào)控多個(gè)途徑中的靶基因來參與ISR的發(fā)生和發(fā)展過程。
[Abstract]:Background Micro RNA(mi is a kind of non-coding RNAs that regulate gene expression at post-transcriptional level. It has been found that it is widely involved in various processes of cardiovascular disease. Restenosis in stent has become a major problem to be solved after coronary intervention. It is speculated that mi RNA may play an important role in ISR. This study will explore the role of mi RNA in the pathogenesis of ISR. To explore the possible mechanism of mi RNA and its target gene in ISR. Methods the difference of expression profiles of mi RNA in plasma of ISR patients was screened by mi RNA gene chip technique. The relative expression of mi RNA and ISR were analyzed and verified by Real-time PCR. Finally, the specific mi RNA was used as marker of ISR high risk population. The target gene of mi RNA was predicted by bioinformatics, and the downstream target gene network of mi RNA was mined to construct the ISR related mi RNA-Gene-Network network. The possible mechanism of its role in ISR was discussed. The results were detected by high throughput mi RNA chip. A batch of differentially expressed miRNAs were obtained in patients with ISR. Among them, 43 genes were down-regulated and 10 genes were up-regulated. The microarray results were analyzed and verified by bioinformatics and Real-time PCR, and the results were analyzed by comparison and ROC curve analysis. It was found that hsa-mi R-126 could be used as a potential molecular marker for early diagnosis of ISR in patients with coronary heart disease, and that the decrease of plasma hsa-mi R-126 level tended to cause ISR.The target gene of miR-126 was predicted by bioinformatics, and the signal pathway of miR-126 and its target gene was constructed. 16 potential Gene targets and 24 potential mi RNA targets may also be involved in the signaling network. The key genes of ISR may also exist in these potential targets. Conclusion this study suggests that the decrease of mi RNA may play an important role in the pathogenesis of ISR. The decrease of hsa-mi R-126 may be used as an early diagnostic marker of ISR in patients with coronary heart disease. But the mechanism of hsa-mi R-126 in ISR is complicated. It may be involved in the genesis and development of ISR by regulating the target genes in multiple pathways.
【學(xué)位授予單位】：青島大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R541.4

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 魯慧英;Detection of hepatitis C virus RNA sequences in cholangiocarcinomas in Chinese and American patients[J];Chinese Medical Journal;2000年12期

2 ;Detection the HCV RNA by PCR-microplate hybridization method from clinical specimens[J];中國輸血雜志;2001年S1期

3 付漢江,鄭曉飛;類mRNA RNA研究進(jìn)展[J];國外醫(yī)學(xué)(分子生物學(xué)分冊);2002年04期

4 Verheyden B ,徐其武;口服脊髓灰質(zhì)炎疫苗核殼和RNA的穩(wěn)定性[J];國外醫(yī)學(xué).預(yù)防.診斷.治療用生物制品分冊;2002年01期

5 CMBE譯文組;探索小RNA的功能[J];現(xiàn)代臨床醫(yī)學(xué)生物工程學(xué)雜志;2004年03期

6 沈維干;RNA interference and its current application in mammals[J];Chinese Medical Journal;2004年07期

7 ;Potent and specific inhibition of SARS-CoV antigen expression by RNA interference[J];Chinese Medical Journal;2005年09期

8 孫娣;汪洋;張麗娟;閆玉清;;一種簡捷提取植物總RNA的方法[J];黑龍江醫(yī)藥;2005年06期

9 熊慧華;于世英;胡廣原;莊亮;;Effects of Survivin Expression Suppressed by Short Hairpin RNA on MCF-7 Cells[J];華中科技大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)英德文版);2006年03期

10 楊益超;;RNA干擾及其在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用[J];廣西醫(yī)學(xué);2007年10期

相關(guān)會(huì)議論文 前10條

1 金由辛;;面向21世紀(jì)的RNA研究[A];面向21世紀(jì)的科技進(jìn)步與社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展（下冊）[C];1999年

2 ;第四屆RNA全國研討會(huì)大會(huì)報(bào)告日程安排[A];第四屆全國RNA進(jìn)展研討會(huì)論文集[C];2005年

3 ;Function of Transfer RNA Modifications in Plant Development[A];植物分子生物學(xué)與現(xiàn)代農(nóng)業(yè)——全國植物生物學(xué)研討會(huì)論文摘要集[C];2010年

4 王峰;張秋平;陳金湘;;棉花總RNA的快速提取方法[A];中國棉花學(xué)會(huì)2011年年會(huì)論文匯編[C];2011年

5 關(guān)力;陳本iY;iJ云虹;郭培芝;魏重琴;邱蘇吾;苗健;;關(guān)于動(dòng)物}D~T中RNAn,定方法的研究[A];中國生理科學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要匯編（生物化學(xué)）[C];1964年

6 夏海濱;;小RNA在免疫學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用研究進(jìn)展[A];中國免疫學(xué)會(huì)第五屆全國代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要[C];2006年

7 ;The stability of hepatitis C virus RNA in various handling and storage conditions[A];中國輸血協(xié)會(huì)第四屆輸血大會(huì)論文集[C];2006年

8 郭德銀;;RNA干擾在病毒研究和控制中的應(yīng)用[A];2006中國微生物學(xué)會(huì)第九次全國會(huì)員代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2006年

9 甘儀梅;楊業(yè)華;王學(xué)奎;曹燕;楊特武;;棉花總RNA快速提取[A];中國棉花學(xué)會(huì)2007年年會(huì)論文匯編[C];2007年

10 ;Identification and characterization of novel interactive partner proteins for PCBP1 that is a RNA-binding protein[A];中國優(yōu)生優(yōu)育協(xié)會(huì)第四屆全國學(xué)術(shù)論文報(bào)告會(huì)暨基因科學(xué)高峰論壇論文專輯[C];2008年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前10條

1 記者 馮衛(wèi)東;研究人員發(fā)現(xiàn)可破壞腫瘤抑制基因的小RNA[N];科技日報(bào);2009年

2 記者 儲笑抒 通訊員 盛偉;人體微小RNA有望提前發(fā)出癌癥預(yù)警[N];南京日報(bào);2011年

3 瀘州醫(yī)學(xué)院副教授、科普作家 周志遠(yuǎn);“大頭兒子”與環(huán)狀RNA[N];第一財(cái)經(jīng)日報(bào);2014年

4 麥迪信;小分子RNA可能有大作用[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2003年

5 董映璧;美發(fā)現(xiàn)基因調(diào)控可回應(yīng)“RNA世界”[N];科技日報(bào);2006年

6 張忠霞;特制RNA輕推一下,就能“喚醒”基因[N];新華每日電訊;2007年

7 聶翠蓉;RNA：縱是配角也精彩[N];科技日報(bào);2009年

8 馮衛(wèi)東;RNA干擾機(jī)制首次在人體中獲得證實(shí)[N];科技日報(bào);2010年

9 馮衛(wèi)東　王小龍;英在地球早期環(huán)境模擬條件下合成類RNA[N];科技日報(bào);2009年

10 記者 常麗君;新技術(shù)讓研究進(jìn)入單細(xì)胞內(nèi)RNA的世界[N];科技日報(bào);2011年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 王趙瑋;昆蟲RNA病毒復(fù)制及昆蟲抗病毒天然免疫機(jī)制研究[D];武漢大學(xué);2014年

2 包純;一類新非編碼RNA的發(fā)現(xiàn)以及產(chǎn)生和功能的初探[D];華中師范大學(xué);2015年

3 李語麗;基于MeRIP-seq的水稻RNA m6A甲基化修飾的研究[D];中國科學(xué)院北京基因組研究所;2015年

4 熊瑜琳;miR-122靶位基因STAT3調(diào)控長鏈非編碼 RNA Lethe促進(jìn)HCV復(fù)制的機(jī)制研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2015年

5 范春節(jié);高通量測序鑒定毛竹小RNA及其功能分析[D];中國林業(yè)科學(xué)研究院;2012年

6 王加強(qiáng);小鼠著床前胚胎特異ERV相關(guān)長非編碼RNA的定向篩選及功能研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

7 王業(yè)偉;非編碼RNA SPIU的結(jié)構(gòu)和功能研究和p19INK4D在APL發(fā)病中的作用[D];上海交通大學(xué);2013年

8 鄒艷芬;子癇前期中非編碼RNA對滋養(yǎng)細(xì)胞功能的調(diào)控及機(jī)制探索[D];南京醫(yī)科大學(xué);2015年

9 朱喬;miR-10b在人肝細(xì)胞肝癌發(fā)生中的作用及其機(jī)制的初步探索[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2015年

10 蔣俊鋒;長鏈非編碼RNA BACE1-AS促進(jìn)Aβ聚集及其調(diào)節(jié)BACE1和SERF1a的ceRNA機(jī)制研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2015年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 全弘揚(yáng);長鏈非編碼RNA在細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)中的相關(guān)作用及機(jī)制研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2015年

2 胡亮;DDX19A識別PRRSV基因組RNA并激活NLRP3炎癥小體[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

3 雷文婕;小菜蛾不同發(fā)育時(shí)期RNA編輯位點(diǎn)的識別與驗(yàn)證[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

4 周燕;RNA干擾對大鯢蛙病毒（CGSRV）主要功能基因表達(dá)與增殖影響的研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

5 石新新;改進(jìn)的RNA-Seq數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)錄組表達(dá)分析研究[D];南京航空航天大學(xué);2015年

6 陳金梅;利用植物表達(dá)藥用干擾小RNA的研究[D];南京大學(xué);2014年

7 郭維超;miR-17家族在腫瘤生長和遷移中的作用及機(jī)制[D];杭州師范大學(xué);2016年

8 沈曉彤;RNA“一步法”檢測的酶學(xué)基礎(chǔ)及凝血酶等溫?cái)U(kuò)增檢測方法的研究[D];青島科技大學(xué);2016年

9 孫文陽;豬miR-15b前體單堿基突變對其生物加工過程的影響[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

10 郅淑引;微小RNA25在肺癌血清中的表達(dá)量與臨床意義的研究[D];山西醫(yī)科大學(xué);2016年

，

本文編號：1548632