本文關(guān)鍵詞：炎癥性腸病血清蛋白指紋圖譜技術(shù)分析及臨床應用研究

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【摘要】：背景：炎癥性腸病(Inflammatory Bowel Disease, IBD),包括克羅恩病(Crohn's Disease, CD)和潰瘍性結(jié)腸炎(Ulcerative Colitis, UC),是一類病因和發(fā)病機制尚不明確的腸道慢性炎癥性疾病。其診斷缺乏金標準,臨床上存在漏診或誤診的情況。此外,IBD亞型,即CD和UC之間,IBD與腸結(jié)核(Intestinal Tuberculosis, ITB)之間的鑒別診斷仍是難題。血清蛋白指紋圖譜是近些年發(fā)展起來的一種新型的蛋白質(zhì)組學技術(shù),旨在尋找和疾病相關(guān)的蛋白質(zhì),研究引致某種疾病的蛋白質(zhì)表達或修飾后變化,尋找診斷標記,建立診斷模型。本研究利用弱陽離子磁珠聯(lián)合基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(Matrix-Assisted Laser Desorption/ Ionization Time Of Flight Mass Spectrometry, MALDI-TOF-MS)技術(shù)分析IBD(包括CD和UC)、ITB患者和正常對照者的血清蛋白質(zhì)組學特征,依據(jù)遺傳算法結(jié)合支持向量機(Support Vector Machine, SVM)的方法篩選出最佳診斷模型,并以留一法驗證,以期在血清蛋白質(zhì)層面為IBD的早期診斷,CD和UC, CD和ITB的鑒別診斷提供新的思路。目的：探索IBD血清蛋白質(zhì)譜的診斷模型,CD和UC, CD與ITB血清蛋白質(zhì)譜的鑒別診斷模型及它們的臨床應用價值。方法：第一部分：應用弱陽離子磁珠聯(lián)合MALDI-TOF-MS技術(shù)對108例IBD患者(59例CD患者,49例UC患者)和48例正常對照者的血清蛋白質(zhì)譜進行分析,分別將CD組與正常對照組,UC組與正常對照組,CD組與UC組這三組兩兩進行比較,采用Wilcoxon秩和檢驗篩選出血清中最有差異的蛋白質(zhì)荷比峰(P0.05),通過遺傳算法結(jié)合SVM的方法篩選出IBD的最佳診斷模型,CD和UC之間的最佳鑒別診斷模型,用留一法交叉驗證評估模型的預測效果。第二部分：應用弱陽離子磁珠聯(lián)合MALDI-TOF-MS技術(shù)對30例CD患者,21例ITB患者和30例正常對照者的血清蛋白質(zhì)譜進行分析,分別將CD組與正常對照組,ITB組與正常對照組,CD組與ITB組這三組兩兩進行比較,采用Wilconxon秩和檢驗篩選出血清中最有差異的蛋白質(zhì)荷比峰(P0.05),通過遺傳算法結(jié)合SVM的方法篩選出CD、ITB的最佳診斷模型,CD和ITB之間的最佳鑒別診斷模型,用留一法交叉驗證評估模型的預測效果。對第一部分的CD診斷模型(M/Z為4964,2272,2126,2900這4個蛋白質(zhì)峰組合)行盲法驗證,評估該模型的診斷效果。結(jié)果：(1)第一部分：CD組與正常對照組比較,差異表達(P0.05)的蛋白質(zhì)荷比峰有282個。UC組與正常對照組比較,差異表達的蛋白質(zhì)荷比峰有302個。CD組與UC組比較,差異表達的蛋白質(zhì)荷比峰有306個。在三組中分別選出表達差異最大的10個蛋白質(zhì)荷比峰來建立并篩選診斷模型。發(fā)現(xiàn)質(zhì)荷比(M/Z)為4964,2272,2126, 2900這4個蛋白質(zhì)峰組合建立的診斷模型能很好地區(qū)分CD組與正常對照組,其診斷CD的特異性為93.8%,敏感性為81.4%。M/Z為3030, 5065,2360,3275,1945, 3957這6個蛋白質(zhì)峰組合建立的診斷模型能很好地區(qū)分UC組與正常對照組,其診斷UC的特異性為89.6%,敏感性為98.0%。M/Z為2900, 5338, 2122,1897這4個蛋白質(zhì)峰組合建立的診斷模型能較好地區(qū)分CD組與UC組,其診斷CD的特異性為81.4%,敏感性為71.4%。(2)第二部分：CD組與ITB組比較,差異表達(P0.05)的蛋白質(zhì)荷比峰有236個。ITB組與正常對照組比較,差異表達的蛋白質(zhì)荷比峰有305個。CD組與ITB組比較,差異表達的蛋白質(zhì)荷比峰有332個。在三組中分別選出表達差異最大的10個蛋白質(zhì)荷比峰來建立并篩選診斷模型。發(fā)現(xiàn)M/Z為4964, 3029, 2833, 2900這4個蛋白質(zhì)峰組合建立的診斷模型能很好地區(qū)分CD組與正常對照組,其診斷CD的特異性為96.7%,敏感性為96.7%。M/Z為3030, 2105, 2545, 4210這4個蛋白質(zhì)峰組合建立的診斷模型能很好地區(qū)分ITB組和正常對照組,其診斷ITB的特異性為93.3%,敏感性為95.2%。M/Z為4267, 4223, 1541這3個蛋白質(zhì)峰組合建立的診斷模型能較好地區(qū)分CD組與ITB組,其診斷UC的特異性為76.2%,敏感性為80.0%。(3)CD診斷模型(M/Z為4964, 2272, 2126, 2900這4個蛋白質(zhì)峰組合)盲法測試的敏感性為83.3%,特異性為96.7%,準確率為90%。結(jié)論：(1)第一部分：弱陽離子磁珠聯(lián)合MALDI-TOF-MS技術(shù)分析IBD患者和正常對照組的血清蛋白質(zhì)組學特征,發(fā)現(xiàn)差異表達的蛋白質(zhì)荷比峰能有效地區(qū)分IBD組和正常對照組,CD組與UC組。遺傳算法結(jié)合SVM建立的CD組與正常對照組的血清差異蛋白質(zhì)荷比峰診斷模型(M/Z為4964, 2272, 2126, 2900這4個蛋白質(zhì)峰組合),UC組與正常對照組的血清差異蛋白質(zhì)荷比峰診斷模型(M/Z為3030,5065, 2360, 3275,1945, 3957這6個蛋白質(zhì)峰組合)及CD組與UC組的血清差異蛋白質(zhì)荷比峰鑒別診斷模型(M/Z為2900, 5338, 2122, 1897這4個蛋白質(zhì)峰組合)的特異性及敏感性均較高,可輔助IBD的診斷及其亞型之間的鑒別診斷。(2)第二部分：弱陽離子磁珠聯(lián)合MALDI-TOF-MS技術(shù)分析CD、ITB患者和正常對照組的血清蛋白質(zhì)組學特征,發(fā)現(xiàn)差異表達的蛋白質(zhì)荷比峰能有效地區(qū)分CD組和正常對照組,ITB組和正常對照組,CD組和ITB組。遺傳算法結(jié)合SVM建立的CD組與正常對照組的血清差異蛋白質(zhì)荷比峰診斷模型(M/Z為4964, 3029,2833,2900這4個蛋白質(zhì)峰組合),ITB組與正常對照的血清差異蛋白質(zhì)荷比峰診斷模型(M/Z為3030, 2105, 2545, 4210這4個蛋白質(zhì)峰組合)及CD組與ITB組的血清差異蛋白質(zhì)荷比峰鑒別診斷模型(M/Z為4267, 4223, 1541這3個蛋白質(zhì)峰組合)的特異性及敏感性均較高,可輔助CD、ITB的診斷及CD與ITB的鑒別診斷。(3)M/Z為4964, 2272, 2126, 2900這4個蛋白質(zhì)峰組合的診斷模型對于CD的診斷具有較大的優(yōu)越性。
【關(guān)鍵詞】：炎癥性腸病 克羅恩病 潰瘍性結(jié)腸炎 腸結(jié)核 蛋白質(zhì)譜 MALDL-TOF-MS技術(shù)
【學位授予單位】：浙江大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R574
【目錄】：

• 致謝4-5
• 中文摘要5-9
• 英文摘要9-14
• 縮略語表14-17
• 1 引言17-19
• 2 資料與方法19-26
• 3 結(jié)果26-38
• 4 討論38-46
• 5 結(jié)論46-47
• 參考文獻47-54
• 綜述54-74
• 參考文獻66-74
• 作者簡歷及在學期間所取得的科研成果74

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1 章粉明;炎癥性腸病血清蛋白指紋圖譜技術(shù)分析及臨床應用研究[D];浙江大學;2016年

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本文編號：992832