本文關(guān)鍵詞：布加氏綜合征致病基因的外顯子測(cè)序研究

  更多相關(guān)文章： 布加氏綜合征 全基因組外顯子組測(cè)序 HSPG2 GPR126

【摘要】：背景及目的原發(fā)性布加氏綜合征(primary budd-chiari syndrome,BCS)發(fā)病機(jī)制及病因復(fù)雜,且亞洲國(guó)家與歐美國(guó)家存在明顯的地域差異。在美歐等西方國(guó)家,原發(fā)性BCS病因多與靜脈血栓形成相關(guān),目前研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)JAK2 V617F、FⅤL、FⅡG20210A、MTHFR等多種基因突變與原發(fā)性BCS相關(guān),這些基因均是血栓形成的危險(xiǎn)因素,它們與多種外部因素共同造成了患者血液處于高凝狀態(tài),肝靜脈血栓形成導(dǎo)致肝靜脈阻塞而最終演變?yōu)樵l(fā)性BCS;然而在包括日本、中國(guó)以及印度等亞洲地區(qū),在西方國(guó)家內(nèi)高表達(dá)的相關(guān)基因卻鮮有表達(dá),東方國(guó)家原發(fā)型BCS相關(guān)基因仍然處于未知狀態(tài)。分子生物學(xué)技術(shù)飛速發(fā)展,下一代測(cè)序技術(shù)以其高通量、低成本的獨(dú)特優(yōu)勢(shì),使人類全基因組測(cè)序成為可能,也為原發(fā)性BCS相關(guān)基因的研究帶來(lái)了新的希望。傳統(tǒng)的Sanger測(cè)序廣泛運(yùn)用于基因結(jié)構(gòu)的研究,然而其數(shù)據(jù)產(chǎn)出通量低、成本高、操作復(fù)雜的缺陷使其在更深層次的基因研究受限。相較于Sanger測(cè)序,NGS測(cè)序通量是其數(shù)千倍乃至數(shù)萬(wàn)倍,而其成本僅僅是前者的千分之一,許多學(xué)者已經(jīng)依靠NGS平臺(tái)發(fā)現(xiàn)此前從未發(fā)現(xiàn)的基因突變,顯示其在今后基因研究領(lǐng)域潛力無(wú)限。通過(guò)全基因組外顯子組測(cè)序技術(shù),對(duì)原發(fā)性BCS患者的全部外顯子進(jìn)行篩查,以期發(fā)現(xiàn)特異的基因突變,對(duì)原發(fā)性BCS的病因、發(fā)病機(jī)制等進(jìn)行進(jìn)一步的探討。原發(fā)性BCS是一罕見的臨床綜合征,但在我國(guó)河南、安徽等地區(qū)發(fā)病率明顯高于其他地區(qū),具有明顯的地域以及家族聚集現(xiàn)象。發(fā)現(xiàn)原發(fā)性BCS可能存在的致病基因,可以針對(duì)高危人群進(jìn)行早期的檢測(cè)及預(yù)防。方法1.病例采集本科室長(zhǎng)期隨訪一原發(fā)性BCS家系。家系內(nèi)共8人(5名男性,3名女性),所有人均接受下腔靜脈彩超及CT下腔靜脈成像檢查,確診原發(fā)性BCS患者3名。采集外周靜脈血標(biāo)本。2.外顯子組測(cè)序根據(jù)外顯子組測(cè)序的規(guī)范流程,提取基因組DNA,建立文庫(kù),外顯子測(cè)序,上機(jī)測(cè)序,生物學(xué)信息分析,確定候選基因。3.數(shù)據(jù)分析通過(guò)文獻(xiàn)復(fù)習(xí),蛋白質(zhì)功能預(yù)測(cè),突變頻率等總結(jié)出感興趣的候選基因。4.候選基因驗(yàn)證對(duì)候選基因進(jìn)行PCR/sanger測(cè)序驗(yàn)證。結(jié)果外顯子組測(cè)序結(jié)果生物信息學(xué)分析結(jié)果得出2例患者共有53共有基因突變,從中篩選出2兩個(gè)基因突變:HSPG2 c.C4508T、GPR126 c.T3242G。對(duì)這兩個(gè)突變進(jìn)行驗(yàn)證均得到了陽(yáng)性的驗(yàn)證結(jié)果。結(jié)論HSPG2 c.C4508T和GPR126 c.T3242G兩個(gè)新發(fā)現(xiàn)的基因突變位點(diǎn)可能與下腔靜脈隔膜型布加氏綜合征具有密切的關(guān)系。
【關(guān)鍵詞】：布加氏綜合征 全基因組外顯子組測(cè)序 HSPG2 GPR126
【學(xué)位授予單位】：鄭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：R575
【目錄】：

• 摘要4-6
• Abstract6-10
• 中英文縮略詞表10-11
• 1 前言11-13
• 2 資料與方法13-20
• 3 結(jié)果20-34
• 4 討論34-37
• 5 結(jié)論37-38
• 參考文獻(xiàn)38-40
• 綜述 布加氏綜合征病因?qū)W研究進(jìn)展40-51
• 參考文獻(xiàn)47-51
• 個(gè)人簡(jiǎn)歷及在校期間發(fā)表文章51-52
• 致謝52

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：988597