IL-28B基因多態(tài)性與福建某地丙型肝炎高流行區(qū)人群HCV感染的相關(guān)性研究
發(fā)布時間:2017-09-10 18:16
本文關(guān)鍵詞:IL-28B基因多態(tài)性與福建某地丙型肝炎高流行區(qū)人群HCV感染的相關(guān)性研究
更多相關(guān)文章: IL-28B 細胞因子 單核苷酸多態(tài)性 基因型 HCV感染易感性
【摘要】:目的:探討IL-28B基因多態(tài)性與福建莆田丙型肝炎高發(fā)流行區(qū)漢族人群慢性HCV感染的易感性、病毒載量及HCV自發(fā)清除的相關(guān)性,并為該地區(qū)丙型肝炎的防控提供理論依據(jù)。方法:以中國福建莆田丙型肝炎高發(fā)流行區(qū)慢性HCV感染者(192例)為研究對象,以同一地區(qū)年齡、性別與其相匹配的抗-HCV陰性人群為對照組(186例)。采外周血抽提基因組,應(yīng)用Taq Man-MGB探針分型技術(shù)對IL-28B SNPs位點(rs12979860,rs8099917)進行等位基因檢測,統(tǒng)計分析上述位點等位基因及基因型在病例組和對照組之間的分布差異,并采用Logistic回歸模型計算IL-28B各SNP位點不同基因型人群患丙型肝炎的風(fēng)險(Odds Ratio,OR)及其95%可信區(qū)間(Confidence Interval,CI)。應(yīng)用Haploview軟件對IL-28B各基因位點進行連鎖不平衡及單倍體分析。探討IL-28B基因多態(tài)性與HCV感染易感性及HCV自發(fā)清除的關(guān)系。結(jié)果:⑴Hardy-Weinbery遺傳平衡檢驗:病例組和對照組SNP多態(tài)性位點(rs12979860,rs8099917)等位基因及基因型頻率分布均達到Hardy-Weinbery遺傳平衡(rs12979860:病例組χ2=0.204,P=0.65;對照組χ2=0.212,P=0.645。rs8099917:病例組χ2=0.147,P=0.7;對照組χ2=0.314,P=0.575),說明所選人群具有群體代表性。⑵等位基因分析:IL-28B rs12979860位點的等位基因C/T分布頻率兩組相比無統(tǒng)計學(xué)意義(91.15%vs 94.08%;8.85%vs 5.92%,χ2=2.382,P=0.123);IL-28B rs8099917位點的等位基因T/G分布頻率在兩組間也無明顯差異(91.41%vs 94.35%;8.59%vs 5.65%,χ2=2.477,P=0.116)。⑶IL-28B各位點基因型與HCV感染易感性行l(wèi)ogistic回歸分析未發(fā)現(xiàn)rs12979860、rs8099917位點的基因多態(tài)性與丙型肝炎的易感性存在明顯關(guān)聯(lián)(rs12979860:CCvs CT P=0.129、CCvs TT P=0.842;rs8099917:TTvs GT P=0.135、TTvs GG P=0.844);⑷IL-28B各基因位點的連鎖不平衡分析顯示rs12979860、rs8099917位點存在完全連鎖不平衡(D’=1,r2=0.911)。但rs12979860、rs8099917單體型頻率在病例組和對照組之間的分布無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.12;P=0.98);⑸HCV-RNA載量與IL-28B基因rs12979860、rs8099917位點的基因型均無統(tǒng)計學(xué)關(guān)聯(lián)(rs12979860:χ2=0.593,P=0.744;rs8099917:χ2=0.723,P=0.697);(6)rs12979860、rs8099917的各基因型(rs12979860:χ2=0.142,P=0.932;rs8099917:χ2=0.173,P=0.917)及等位基因(rs12979860:χ2=0.012,P=0.914;rs8099917:χ2=0.027,P=0.869)頻率在自發(fā)清除者與慢性感染者間分布無統(tǒng)計學(xué)差異。結(jié)論:⑴宿主IL-28B rs12979860和rs8099917位點的基因多態(tài)性與福建莆田地區(qū)丙型肝炎高流行區(qū)人群HCV感染的易感性無明確相關(guān)性;⑵宿主IL-28B rs12979860和rs8099917位點的基因多態(tài)性與福建莆田地區(qū)丙型肝炎高流行區(qū)人群HCV RNA載量及病毒自發(fā)清除無明確相關(guān)性;⑶福建莆田地區(qū)丙型肝炎高流行區(qū)人群rs12979860和rs8099917間存在完全連鎖不平衡,但rs12979860和rs8099917不同單體型與HCV感染的易感性無明確相關(guān)性。
【關(guān)鍵詞】:IL-28B 細胞因子 單核苷酸多態(tài)性 基因型 HCV感染易感性
【學(xué)位授予單位】:福建醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R512.63
【目錄】:
- 中英文縮略詞表4-5
- 中文摘要5-7
- 英文摘要7-9
- 前言9-11
- 材料與方法11-19
- 1. 一般資料11-14
- 1.1 研究對象11-12
- 1.2 樣本量的估計12-13
- 1.3 主要試劑13
- 1.4 主要儀器13-14
- 1.5 主要軟件14
- 2. 方法14-19
- 2.1 血樣與資料采集14
- 2.2 全血DNA抽提14-15
- 2.3 DNA質(zhì)量分析15-16
- 2.4 基因位點選擇16
- 2.5 基因型鑒定16-18
- 2.6 抗HCV抗體及HCV RNA檢測18
- 2.7 統(tǒng)計分析18-19
- 結(jié)果19-26
- 討論26-30
- 結(jié)論30-31
- 參考文獻31-33
- 綜述33-41
- 參考文獻39-41
- 致謝41
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前5條
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,本文編號:825870
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