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IL-28B基因多態(tài)性與福建某地丙型肝炎高流行區(qū)人群HCV感染的相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2017-09-10 18:16

  本文關(guān)鍵詞:IL-28B基因多態(tài)性與福建某地丙型肝炎高流行區(qū)人群HCV感染的相關(guān)性研究


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【摘要】:目的:探討IL-28B基因多態(tài)性與福建莆田丙型肝炎高發(fā)流行區(qū)漢族人群慢性HCV感染的易感性、病毒載量及HCV自發(fā)清除的相關(guān)性,并為該地區(qū)丙型肝炎的防控提供理論依據(jù)。方法:以中國(guó)福建莆田丙型肝炎高發(fā)流行區(qū)慢性HCV感染者(192例)為研究對(duì)象,以同一地區(qū)年齡、性別與其相匹配的抗-HCV陰性人群為對(duì)照組(186例)。采外周血抽提基因組,應(yīng)用Taq Man-MGB探針?lè)中图夹g(shù)對(duì)IL-28B SNPs位點(diǎn)(rs12979860,rs8099917)進(jìn)行等位基因檢測(cè),統(tǒng)計(jì)分析上述位點(diǎn)等位基因及基因型在病例組和對(duì)照組之間的分布差異,并采用Logistic回歸模型計(jì)算IL-28B各SNP位點(diǎn)不同基因型人群患丙型肝炎的風(fēng)險(xiǎn)(Odds Ratio,OR)及其95%可信區(qū)間(Confidence Interval,CI)。應(yīng)用Haploview軟件對(duì)IL-28B各基因位點(diǎn)進(jìn)行連鎖不平衡及單倍體分析。探討IL-28B基因多態(tài)性與HCV感染易感性及HCV自發(fā)清除的關(guān)系。結(jié)果:⑴Hardy-Weinbery遺傳平衡檢驗(yàn):病例組和對(duì)照組SNP多態(tài)性位點(diǎn)(rs12979860,rs8099917)等位基因及基因型頻率分布均達(dá)到Hardy-Weinbery遺傳平衡(rs12979860:病例組χ2=0.204,P=0.65;對(duì)照組χ2=0.212,P=0.645。rs8099917:病例組χ2=0.147,P=0.7;對(duì)照組χ2=0.314,P=0.575),說(shuō)明所選人群具有群體代表性。⑵等位基因分析:IL-28B rs12979860位點(diǎn)的等位基因C/T分布頻率兩組相比無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(91.15%vs 94.08%;8.85%vs 5.92%,χ2=2.382,P=0.123);IL-28B rs8099917位點(diǎn)的等位基因T/G分布頻率在兩組間也無(wú)明顯差異(91.41%vs 94.35%;8.59%vs 5.65%,χ2=2.477,P=0.116)。⑶IL-28B各位點(diǎn)基因型與HCV感染易感性行l(wèi)ogistic回歸分析未發(fā)現(xiàn)rs12979860、rs8099917位點(diǎn)的基因多態(tài)性與丙型肝炎的易感性存在明顯關(guān)聯(lián)(rs12979860:CCvs CT P=0.129、CCvs TT P=0.842;rs8099917:TTvs GT P=0.135、TTvs GG P=0.844);⑷IL-28B各基因位點(diǎn)的連鎖不平衡分析顯示rs12979860、rs8099917位點(diǎn)存在完全連鎖不平衡(D’=1,r2=0.911)。但rs12979860、rs8099917單體型頻率在病例組和對(duì)照組之間的分布無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.12;P=0.98);⑸HCV-RNA載量與IL-28B基因rs12979860、rs8099917位點(diǎn)的基因型均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(rs12979860:χ2=0.593,P=0.744;rs8099917:χ2=0.723,P=0.697);(6)rs12979860、rs8099917的各基因型(rs12979860:χ2=0.142,P=0.932;rs8099917:χ2=0.173,P=0.917)及等位基因(rs12979860:χ2=0.012,P=0.914;rs8099917:χ2=0.027,P=0.869)頻率在自發(fā)清除者與慢性感染者間分布無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。結(jié)論:⑴宿主IL-28B rs12979860和rs8099917位點(diǎn)的基因多態(tài)性與福建莆田地區(qū)丙型肝炎高流行區(qū)人群HCV感染的易感性無(wú)明確相關(guān)性;⑵宿主IL-28B rs12979860和rs8099917位點(diǎn)的基因多態(tài)性與福建莆田地區(qū)丙型肝炎高流行區(qū)人群HCV RNA載量及病毒自發(fā)清除無(wú)明確相關(guān)性;⑶福建莆田地區(qū)丙型肝炎高流行區(qū)人群rs12979860和rs8099917間存在完全連鎖不平衡,但rs12979860和rs8099917不同單體型與HCV感染的易感性無(wú)明確相關(guān)性。
【關(guān)鍵詞】:IL-28B 細(xì)胞因子 單核苷酸多態(tài)性 基因型 HCV感染易感性
【學(xué)位授予單位】:福建醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R512.63
【目錄】:
  • 中英文縮略詞表4-5
  • 中文摘要5-7
  • 英文摘要7-9
  • 前言9-11
  • 材料與方法11-19
  • 1. 一般資料11-14
  • 1.1 研究對(duì)象11-12
  • 1.2 樣本量的估計(jì)12-13
  • 1.3 主要試劑13
  • 1.4 主要儀器13-14
  • 1.5 主要軟件14
  • 2. 方法14-19
  • 2.1 血樣與資料采集14
  • 2.2 全血DNA抽提14-15
  • 2.3 DNA質(zhì)量分析15-16
  • 2.4 基因位點(diǎn)選擇16
  • 2.5 基因型鑒定16-18
  • 2.6 抗HCV抗體及HCV RNA檢測(cè)18
  • 2.7 統(tǒng)計(jì)分析18-19
  • 結(jié)果19-26
  • 討論26-30
  • 結(jié)論30-31
  • 參考文獻(xiàn)31-33
  • 綜述33-41
  • 參考文獻(xiàn)39-41
  • 致謝41

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

1 叢瑞;佟小非;劉三都;謝勇;尤紅;;白細(xì)胞介素28B(IL-28B)基因多態(tài)性與丙型肝炎病毒(HCV)感染者自發(fā)清除的相關(guān)性[J];首都醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2012年03期

2 林國(guó)賢;黃慶華;劉福星;涂海健;石爽;陳攸濤;陳秀云;王桂芝市;謝志勇;林玉英;邱榮仙;吳智宏;;莆田市某村莊丙型肝炎高發(fā)流行病學(xué)調(diào)查[J];中華實(shí)驗(yàn)和臨床感染病雜志(電子版);2009年04期

3 王琳;徐東平;張玲霞;;丙型肝炎病毒基因型分型及臨床意義[J];肝臟;2006年06期

4 米寅;高英堂;焦曉磊;杜智;;IL-28B基因多態(tài)性與丙型肝炎易感性的關(guān)系[J];世界華人消化雜志;2013年02期

5 許秀華;向曉星;;肝細(xì)胞癌的病因及發(fā)病機(jī)制研究進(jìn)展[J];醫(yī)學(xué)綜述;2013年05期

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本文編號(hào):825870

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