iTRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)對乙肝肝硬化失代償血清差異蛋白的鑒定及分析
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【摘要】:背景:乙肝相關(guān)性肝硬化失代償(HBV-DLC)是一個全球性的衛(wèi)生問題,現(xiàn)在預(yù)測HBV-DLC患者預(yù)后的主要方法是Child評分和MELD評分。然而,這兩種評分標(biāo)準(zhǔn)都有明顯的局限性。為了尋找更加準(zhǔn)確、可靠的HBV-DLC預(yù)后標(biāo)志物,我們開展了本研究。方法:采用基于同位素標(biāo)記相對定量和絕對定量技術(shù)(iTRAQ)的蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,分析正常、慢性乙型肝炎(CHB)、乙肝肝硬化代償期(HBV-CLC)、乙肝肝硬化失代償期(HBV-DLC)四組樣本的血清蛋白表達譜,找出在HBV-DLC患者中異常表達的蛋白。采用ELISA、Western blot技術(shù)對質(zhì)譜結(jié)果進行驗證,并從中篩選更有價值的候選蛋白,對其進行后續(xù)的臨床分析。結(jié)果:共有437個蛋白被鑒定出來。以Non-HBV-DLC組為對照,有21個蛋白在HBV-DLC患者中是異常表達的,其中包括18個下調(diào)蛋白,3個上調(diào)蛋白。通過生物信息學(xué)分析和文獻檢索,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)鐵蛋白和SERPINA1蛋白跟HBV-DLC患者預(yù)后的關(guān)系可能更密切。選取新的血清標(biāo)本,用ELISA技術(shù)對這兩個候選蛋白進行驗證,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)鐵蛋白和SERPINA1蛋白在血清中的含量均是隨著疾病的進展逐漸下降的,這和質(zhì)譜檢測的結(jié)果相一致。ROC分析發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)鐵蛋白對HBV-DLC患者的診斷較能要高于SERPINA1 (AUC:0.86 vs 0.76, p0.01),提示轉(zhuǎn)鐵蛋白可能跟HBV-DLC患者預(yù)后的關(guān)系更大。因此,選擇轉(zhuǎn)鐵蛋白用于后續(xù)的研究與驗證。Western blot和免疫組化也發(fā)現(xiàn)了血清轉(zhuǎn)鐵蛋白的水平隨著疾病的進展逐漸下降。對新的]HBV-DLC隊列進行研究發(fā)現(xiàn),血清轉(zhuǎn)鐵蛋白在HBV-DLC死亡組的水平要顯著低于HBV-DLC存活組(p 0.01)。ROC分析提示轉(zhuǎn)鐵蛋白對HBV-DLC死亡患者的預(yù)測較能和MELD評分相似(AUC:0.80 vs 0.72, p=0.13)。結(jié)論:HBV-DLC患者的死亡或和血清轉(zhuǎn)鐵蛋白的下降有關(guān)。本研究提示基于iTRAQ標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在HBV-DLC預(yù)后標(biāo)志物的研究中有較好的效果。
【關(guān)鍵詞】:iTRAQ 定量蛋白質(zhì)組學(xué) 乙肝肝硬化失代償
【學(xué)位授予單位】:重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R512.62;R575.2
【目錄】:
- 英漢縮略語名詞對照5-6
- 中文摘要6-8
- 英文摘要8-10
- 前言10-11
- 1 材料與方法11-21
- 1.1 材料11-13
- 1.2 方法13-21
- 1.3 統(tǒng)計方法21
- 2 結(jié)果21-29
- 2.1 蛋白質(zhì)鑒定及相對定量21-25
- 2.2 ELISA檢測候選蛋白在血清中的表達水平25-27
- 2.3 Western Blot驗證轉(zhuǎn)鐵蛋白在血清中的表達27
- 2.4 轉(zhuǎn)鐵蛋白在CHB、HBV-LC患者肝組織中的表達27-28
- 2.5 ELISA檢測轉(zhuǎn)鐵蛋白在HBV-DLC亞群中的表達水平28-29
- 3 討論29-32
- 參考文獻32-35
- 文獻綜述35-41
- 參考文獻39-41
- 致謝41-42
- 碩士期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及參加學(xué)術(shù)活動42
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本文編號:819987
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