本文關(guān)鍵詞：基于KEGG通路和基因互作網(wǎng)絡(luò)對(duì)潰瘍性結(jié)腸炎藥靶基因的篩選

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【摘要】：目的:篩選與潰瘍性結(jié)腸炎(ulcerative colitis,UC)相關(guān)的藥靶基因,利用DAVID通路數(shù)據(jù)庫(kù)和基因互做網(wǎng)絡(luò)分析目標(biāo)基因的分布和功能,促進(jìn)UC的研究和新藥靶點(diǎn)開發(fā)。方法:以u(píng)lcerative colitis檢索NCBI gene數(shù)據(jù)庫(kù),提取UC相關(guān)基因數(shù)據(jù),用DAVID分析工具提取基因富集的通路數(shù)據(jù)。對(duì)103個(gè)非冗余基因所顯著富集的9條KEGG通路進(jìn)行了分析,同時(shí)對(duì)富集通路中的基因同HPRD人類蛋白互作網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行匹配。建立通路中關(guān)鍵基因的基因互做網(wǎng)絡(luò)。并對(duì)所建立的相關(guān)子網(wǎng)進(jìn)行比較,篩選和UC相關(guān)的藥靶基因。結(jié)果:CD40、FAS、TNF、CD86、HLA-DRA、IL2和IL10等20個(gè)UC相關(guān)基因需要完善研究,AKT1和TNFRSF1A兩個(gè)基因可能是UC治療藥物間接作用的重要靶點(diǎn)。結(jié)論 UC發(fā)病與細(xì)胞因子-受體相互作用通路、Ig A生產(chǎn)腸道免疫網(wǎng)絡(luò)等多個(gè)通路相關(guān)。其中免疫相關(guān)通路是UC發(fā)病機(jī)制中的重要信號(hào)傳導(dǎo)通路。CD40、FAS、TNF、CD86、HLA-DRA、IL2和IL10等20個(gè)UC相關(guān)基因在病理和治療中都占有重要的地位。通過分析疾病相關(guān)基因的代謝通路和互作網(wǎng)絡(luò),有助于了解疾病的分子病理基礎(chǔ),并為新藥設(shè)計(jì)提供可靠靶點(diǎn)。
【作者單位】： 浙江省中醫(yī)藥研究院;浙江省腫瘤醫(yī)院;杭州致遠(yuǎn)醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所有限公司;中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 潰瘍性結(jié)腸炎 基因互做網(wǎng)絡(luò) KEGG通路 藥物靶點(diǎn)
【基金】：浙江省科技計(jì)劃項(xiàng)目(2014C33209)
【分類號(hào)】：R574.62
【正文快照】： 潰瘍性結(jié)腸炎(ulcerative colitis,UC)是一種病因尚不十分清楚的直腸和結(jié)腸慢性非特異性炎癥性疾病[1]。以反復(fù)發(fā)生的腸道潰瘍?yōu)橹饕卣?以腹瀉、血便、腹痛等癥狀為主要特點(diǎn)。UC和大腸癌關(guān)系密切,尤其是全結(jié)腸炎其發(fā)生大腸癌的機(jī)會(huì)比正常人高上數(shù)倍,成為我國(guó)消化道慢性病的，

本文編號(hào)：698107