乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)感染是當前嚴重威脅人類健康的病毒性疾病之一。我國正處于乙型肝炎的高發(fā)地區(qū),是乙肝患者大國。microRNA (miRNA)是一種廣泛存在于真核生物中的的內源性單鏈小分子RNA,它可以與靶基因序列進行特異性地結合,在轉錄或翻譯水平實現負調控。近年來,miRNA在乙肝研究中逐漸成為熱點,許多研究證實microRNA (miRNA)可以介導宿主與病毒之間的相互作用,闡明miRNA在HBV感染中的作用有助于新型治療策略的提出。然而,miRNA的多靶點特性限制了其功能研究。為了研究miRNA對HBV的調節(jié)機制,本文在靶基因水平上比較了HBV相關miRNA和HBV蛋白的功能譜,采用半定量手段進行功能分析并從網絡層面挖掘其潛在的作用模式。結果表明,在靶基因水平上,miRNA功能較為集中,HBV蛋白的作用效應可能更為廣泛；在網絡拓撲結構上,miRNA主要通過直接作用于HBV蛋白的靶基因及其鄰居節(jié)點達到其調節(jié)作用；在生理效應上,miRNA在凋亡、細胞周期以及體液免疫的調節(jié)上呈現出拮抗HBV蛋白效應的趨勢。本研究不僅為miRNA的靶點功能研究提供...

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【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 乙型肝炎病毒
        1.1.1 HBV病毒顆粒特征
        1.1.2 HBV的流行病學
        1.1.3 HBV相關疾病的病程發(fā)展和治療
        1.1.4 HBV研究現狀
    1.2 MicroRNA參與調控多種生物過程
        1.2.1 MicroRNA的產生和作用機制
        1.2.2 MicroRNA與疾病
        1.2.3 MicroRNA研究現狀
    1.3 研究miRNA對HBV調節(jié)機制的必要性及可行性
    1.4 課題研究的目的與意義
第2章 實驗材料與方法
    2.1 數據的收集和預處理
        2.1.1 HBV蛋白靶點數據收集
        2.1.2 HBV相關的miRNA靶點數據收集
        2.1.3 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA表達水平的確定
    2.2 GO分析
        2.2.1 GO富集分析
        2.2.2 GO譜相似性分析
        2.2.3 靶點作用模式的判定
    2.3 網絡分析
        2.3.1 構建蛋白-蛋白相互作用網絡
        2.3.2 構建最小子網絡
        2.3.3 構建核心網絡
        2.3.4 網絡參數的計算
        2.3.5 網絡分解
    2.4 圖形展示
        2.4.1 Cytoscape軟件
        2.4.2 Microsoft office visio軟件
        2.4.3 MEGA軟件
    2.5 工作流程
第3章 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因的數據收集和統(tǒng)計
    3.1 HBV蛋白靶基因
    3.2 HBV-miRNA靶基因
    3.3 本章小結
第4章 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因的GO功能譜分析
    4.1 GO富集分析
    4.2 GO譜的相似性
    4.3 GO功能分區(qū)
    4.4 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因對GO生理過程的作用模式統(tǒng)計
    4.5 本章小結
第5章 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因的網絡特征
    5.1 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因的網絡特征
    5.2 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因的子網絡構建
    5.3 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因的核心網絡構建
        5.3.1 兩組靶基因對凋亡過程的調節(jié)
        5.3.2 兩組靶基因對免疫的調節(jié)
        5.3.3 兩組靶基因對細胞周期的調節(jié)
        5.3.4 HBV蛋白靶基因和HBV-miRNA靶基因呈拮抗模式
    5.4 本章小結
第6章 結論與展望
    6.1 結論
    6.2 展望
參考文獻
致謝
科研成果



本文編號：3911481