腹瀉型腸易激綜合征肝郁脾虛證候特點與腦腸神經(jīng)遞質(zhì)基因多態(tài)性的相關(guān)性研究
發(fā)布時間:2022-11-10 22:13
[目的]通過全外顯子高通量測序技術(shù)對腹瀉型腸易激綜合征(IBS-D)肝郁脾虛證患者進行全外顯子測序,初步篩選出與神經(jīng)遞質(zhì)相關(guān)的易感基因,為下一步基因多態(tài)性研究奠定基礎(chǔ);分析非共有基因多態(tài)性與本病癥狀的相關(guān)性,了解IBS-D分子水平的發(fā)病機制。[方法]納入肝郁脾虛證IBS-D患者,填寫臨床資料,提取外周血DNA。采用全外顯子捕獲技術(shù)進行高通量測序,測序結(jié)果與人類參考基因組序列(UCSC hg19)、avsnp147進行比對過濾。運用ANNOVAR軟件對結(jié)果進行注釋,篩選與神經(jīng)遞質(zhì)相關(guān)的基因,進一步參考1000 Genomes Project、ExAC數(shù)據(jù)庫基因頻率注釋篩選SNP,整合外顯子區(qū)域的非同義變異基因,分析本病患者的易感基因,同時探討非共有基因多態(tài)性與本病癥狀的相關(guān)性。[結(jié)果]本研究共納入10例肝郁脾虛證IBS-D患者,測序后每位患者共獲得10 G的數(shù)據(jù)。反復(fù)比對過濾測序結(jié)果,得到與神經(jīng)遞質(zhì)相關(guān)的基因共5 507個,符合SNP的有5 117個,其中外顯子區(qū)域非同義變異基因有94個,整合后得到18個共有基因及76個非共有基因。[結(jié)論]①rs12437941、rs2402073、rs...
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 資料與方法
1.1 病例來源
1.2 納入與排除標(biāo)準(zhǔn)
1.2.1 納入標(biāo)準(zhǔn)
1.2.2 排除標(biāo)準(zhǔn)
1.3 診斷標(biāo)準(zhǔn)
1.3.1 西醫(yī)診斷標(biāo)準(zhǔn)
1.3.2 疾病診斷標(biāo)準(zhǔn)
1.3.3 IBS-D亞型診斷標(biāo)準(zhǔn)
1.3.4 中醫(yī)證候診斷標(biāo)準(zhǔn)
1.4 方法
1.4.1 資料收集
1.4.2 標(biāo)本的采集
1.4.3 DNA提取
1.4.4 DNA質(zhì)量檢測
1.4.5 外顯子捕獲和測序
1.4.6 數(shù)據(jù)分析流程
2 結(jié)果
2.1 一般情況
2.2 測序結(jié)果
2.2.1 神經(jīng)遞質(zhì)相關(guān)基因篩選結(jié)果
2.2.2 神經(jīng)遞質(zhì)相關(guān)SNP篩選結(jié)果
2.2.3 外顯子區(qū)不同變異類型分布
2.2.4 非同義突變基因統(tǒng)計結(jié)果
2.3 非同義變異的非共有基因多態(tài)性與IBS-D肝郁脾虛證癥狀的相關(guān)性分析
2.3.1 與病程的相關(guān)性分析
2.3.2 與BMI的相關(guān)性分析
2.3.3 與排便癥狀的相關(guān)性分析
2.3.4 與IBS-SSS評分、IBS-QOL總積分的相關(guān)性分析
2.3.5 與IBS-QOL量表各維度的相關(guān)性分析
2.3.6 與HAMA及HAMD評分的相關(guān)性分析
2.3.7 與IBS-D肝郁脾虛證患者癥狀無線性相關(guān)的基因
3 結(jié)論
3.1 IBS-D肝郁脾虛證的易感基因
3.2 IBS-D肝郁脾虛證癥狀與神經(jīng)遞質(zhì)基因多態(tài)性的相關(guān)性分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]腸易激綜合征腸道菌群失調(diào)與腦-腸軸調(diào)節(jié)紊亂的相關(guān)性[J]. 尹曉嵐,王鳳云,田亞欣,段園志,唐旭東. 胃腸病學(xué). 2017(01)
[2]易感基因多態(tài)性與腸易激綜合征[J]. 成璇,吳戰(zhàn)軍. 國際消化病雜志. 2015(03)
[3]腹瀉型腸易激綜合征證型及證候要素的文獻研究[J]. 沈淑華,黃宣,呂賓,連建偉,王坤根. 中華中醫(yī)藥雜志. 2013(05)
[4]肝脾失調(diào)在IBS內(nèi)臟高敏感性發(fā)生中的作用及其機制[J]. 黃紹剛. 中國中醫(yī)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)雜志. 2008(07)
[5]腦-腸互動在腸易激綜合征發(fā)病中的作用[J]. 王敬東. 世界華人消化雜志. 2006(34)
博士論文
[1]端粒調(diào)控關(guān)鍵基因遺傳變異與中國人群結(jié)直腸癌易感性的關(guān)聯(lián)研究[D]. 李嬌元.華中科技大學(xué) 2018
[2]UBE3C在原發(fā)性肝癌中的突變及生物學(xué)特性研究[D]. 蔣家好.復(fù)旦大學(xué) 2013
碩士論文
[1]非同義突變對蛋白質(zhì)翻譯后修飾的影響及其在人類疾病中的意義[D]. 孫博.上海交通大學(xué) 2015
[2]腹瀉型腸易激綜合征中醫(yī)證候分布特點分析[D]. 張長征.北京中醫(yī)藥大學(xué) 2010
本文編號:3705374
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【文章目錄】:
1 資料與方法
1.1 病例來源
1.2 納入與排除標(biāo)準(zhǔn)
1.2.1 納入標(biāo)準(zhǔn)
1.2.2 排除標(biāo)準(zhǔn)
1.3 診斷標(biāo)準(zhǔn)
1.3.1 西醫(yī)診斷標(biāo)準(zhǔn)
1.3.2 疾病診斷標(biāo)準(zhǔn)
1.3.3 IBS-D亞型診斷標(biāo)準(zhǔn)
1.3.4 中醫(yī)證候診斷標(biāo)準(zhǔn)
1.4 方法
1.4.1 資料收集
1.4.2 標(biāo)本的采集
1.4.3 DNA提取
1.4.4 DNA質(zhì)量檢測
1.4.5 外顯子捕獲和測序
1.4.6 數(shù)據(jù)分析流程
2 結(jié)果
2.1 一般情況
2.2 測序結(jié)果
2.2.1 神經(jīng)遞質(zhì)相關(guān)基因篩選結(jié)果
2.2.2 神經(jīng)遞質(zhì)相關(guān)SNP篩選結(jié)果
2.2.3 外顯子區(qū)不同變異類型分布
2.2.4 非同義突變基因統(tǒng)計結(jié)果
2.3 非同義變異的非共有基因多態(tài)性與IBS-D肝郁脾虛證癥狀的相關(guān)性分析
2.3.1 與病程的相關(guān)性分析
2.3.2 與BMI的相關(guān)性分析
2.3.3 與排便癥狀的相關(guān)性分析
2.3.4 與IBS-SSS評分、IBS-QOL總積分的相關(guān)性分析
2.3.5 與IBS-QOL量表各維度的相關(guān)性分析
2.3.6 與HAMA及HAMD評分的相關(guān)性分析
2.3.7 與IBS-D肝郁脾虛證患者癥狀無線性相關(guān)的基因
3 結(jié)論
3.1 IBS-D肝郁脾虛證的易感基因
3.2 IBS-D肝郁脾虛證癥狀與神經(jīng)遞質(zhì)基因多態(tài)性的相關(guān)性分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]腸易激綜合征腸道菌群失調(diào)與腦-腸軸調(diào)節(jié)紊亂的相關(guān)性[J]. 尹曉嵐,王鳳云,田亞欣,段園志,唐旭東. 胃腸病學(xué). 2017(01)
[2]易感基因多態(tài)性與腸易激綜合征[J]. 成璇,吳戰(zhàn)軍. 國際消化病雜志. 2015(03)
[3]腹瀉型腸易激綜合征證型及證候要素的文獻研究[J]. 沈淑華,黃宣,呂賓,連建偉,王坤根. 中華中醫(yī)藥雜志. 2013(05)
[4]肝脾失調(diào)在IBS內(nèi)臟高敏感性發(fā)生中的作用及其機制[J]. 黃紹剛. 中國中醫(yī)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)雜志. 2008(07)
[5]腦-腸互動在腸易激綜合征發(fā)病中的作用[J]. 王敬東. 世界華人消化雜志. 2006(34)
博士論文
[1]端粒調(diào)控關(guān)鍵基因遺傳變異與中國人群結(jié)直腸癌易感性的關(guān)聯(lián)研究[D]. 李嬌元.華中科技大學(xué) 2018
[2]UBE3C在原發(fā)性肝癌中的突變及生物學(xué)特性研究[D]. 蔣家好.復(fù)旦大學(xué) 2013
碩士論文
[1]非同義突變對蛋白質(zhì)翻譯后修飾的影響及其在人類疾病中的意義[D]. 孫博.上海交通大學(xué) 2015
[2]腹瀉型腸易激綜合征中醫(yī)證候分布特點分析[D]. 張長征.北京中醫(yī)藥大學(xué) 2010
本文編號:3705374
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