基于SNP-MaP慢性乙型肝炎不同臨床轉歸全基因組關聯研究和乙型重型肝炎預后模型的構建
發(fā)布時間:2021-12-28 16:10
目的:慢性乙型肝炎的臨床轉歸包括乙肝病毒攜帶者肝、硬化、肝癌、乙型重型肝炎,它是一組有明確病因的復雜多基因疾病,應用SNP-MaP(snp microarray and pooling)完成全基因組掃描,尋找慢性乙型肝炎重癥化的易感位點,并擴大樣本驗證其易感性位點。方法:根據慢性乙型肝炎的臨床轉歸的表型將樣本分為乙肝病毒攜帶者,肝硬化,肝癌,乙型重型肝炎。應用affymatrix SNP 6.0掃描各組中100個樣本隨機挑選86個組成DNA pool,并完成3個生物學重復。分別運用兩種不同的統(tǒng)計學方法進行分析,挑選差異性最強的SNP位點。在乙肝病毒攜帶者234例,肝硬化300例,肝癌300例,乙型重型肝炎171例進行個體驗證。結果:通過嚴格的統(tǒng)計學挑選,一共挑選7個SNP進行個體的基因分型。發(fā)現兩個與肝硬化易感性的多態(tài)性位點分別是轉錄因子TBX5 SNP位點rs3825214在于對照組相比(共顯性模型P=0.024,顯性模型P=0.008 OR1.8(1.1-2.9))和膜蛋白SCUBE3 SNP位點rs 3800385在于對照組相比(顯性模型P=0.0076 OR 1.6(1.1-2...
【文章來源】:華中科技大學湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:107 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
英文縮略詞
第一部分:基于SNP-MaP慢性乙肝不同臨床轉歸全基因組關聯研究
中文摘要
英文摘要
正文
前言
一、材料和方法
二、結果
三、討論
參考文獻
第二部分:乙型重型肝炎預后模型的構建
中文摘要
英文摘要
正文
前言
一、材料和方法
二、統(tǒng)計
三.結果
四、討論
參考文獻
綜述
已發(fā)表文章
附一:Affymatrix工作流程圖
附二:DNA實驗樣本96孔板
附三:384孔板加樣
附四:973病人調查表格
附五:VG2圖TBX5 SCUBE3
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]慢性乙型肝炎急性發(fā)作患者血清病毒準種動力學研究[J]. 劉霖,王宇明,蘭林,李俊剛,鄧國宏,夏杰,趙學蘭,張緒清. 中華肝臟病雜志. 2006(01)
[2]Analyses of prognostic indices of chronic liver failure caused by hepatitis virus[J]. Xiao-Mao Li, Lin Ma, Yue-Bo Yang, Zhong-Jie Shi, Shui-Sheng Zhou, Department of Obstetrics and Gynecology, Third Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University, Guangzhou 510630, Guangdong Province, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(18)
本文編號:3554351
【文章來源】:華中科技大學湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:107 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
英文縮略詞
第一部分:基于SNP-MaP慢性乙肝不同臨床轉歸全基因組關聯研究
中文摘要
英文摘要
正文
前言
一、材料和方法
二、結果
三、討論
參考文獻
第二部分:乙型重型肝炎預后模型的構建
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英文摘要
正文
前言
一、材料和方法
二、統(tǒng)計
三.結果
四、討論
參考文獻
綜述
已發(fā)表文章
附一:Affymatrix工作流程圖
附二:DNA實驗樣本96孔板
附三:384孔板加樣
附四:973病人調查表格
附五:VG2圖TBX5 SCUBE3
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]慢性乙型肝炎急性發(fā)作患者血清病毒準種動力學研究[J]. 劉霖,王宇明,蘭林,李俊剛,鄧國宏,夏杰,趙學蘭,張緒清. 中華肝臟病雜志. 2006(01)
[2]Analyses of prognostic indices of chronic liver failure caused by hepatitis virus[J]. Xiao-Mao Li, Lin Ma, Yue-Bo Yang, Zhong-Jie Shi, Shui-Sheng Zhou, Department of Obstetrics and Gynecology, Third Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University, Guangzhou 510630, Guangdong Province, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(18)
本文編號:3554351
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