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基于SNP-MaP慢性乙型肝炎不同臨床轉(zhuǎn)歸全基因組關(guān)聯(lián)研究和乙型重型肝炎預(yù)后模型的構(gòu)建

發(fā)布時間:2021-12-28 16:10
  目的:慢性乙型肝炎的臨床轉(zhuǎn)歸包括乙肝病毒攜帶者肝、硬化、肝癌、乙型重型肝炎,它是一組有明確病因的復(fù)雜多基因疾病,應(yīng)用SNP-MaP(snp microarray and pooling)完成全基因組掃描,尋找慢性乙型肝炎重癥化的易感位點,并擴大樣本驗證其易感性位點。方法:根據(jù)慢性乙型肝炎的臨床轉(zhuǎn)歸的表型將樣本分為乙肝病毒攜帶者,肝硬化,肝癌,乙型重型肝炎。應(yīng)用affymatrix SNP 6.0掃描各組中100個樣本隨機挑選86個組成DNA pool,并完成3個生物學(xué)重復(fù)。分別運用兩種不同的統(tǒng)計學(xué)方法進行分析,挑選差異性最強的SNP位點。在乙肝病毒攜帶者234例,肝硬化300例,肝癌300例,乙型重型肝炎171例進行個體驗證。結(jié)果:通過嚴(yán)格的統(tǒng)計學(xué)挑選,一共挑選7個SNP進行個體的基因分型。發(fā)現(xiàn)兩個與肝硬化易感性的多態(tài)性位點分別是轉(zhuǎn)錄因子TBX5 SNP位點rs3825214在于對照組相比(共顯性模型P=0.024,顯性模型P=0.008 OR1.8(1.1-2.9))和膜蛋白SCUBE3 SNP位點rs 3800385在于對照組相比(顯性模型P=0.0076 OR 1.6(1.1-2... 

【文章來源】:華中科技大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:107 頁

【學(xué)位級別】:博士

【文章目錄】:
英文縮略詞
第一部分:基于SNP-MaP慢性乙肝不同臨床轉(zhuǎn)歸全基因組關(guān)聯(lián)研究
    中文摘要
    英文摘要
    正文
        前言
        一、材料和方法
        二、結(jié)果
        三、討論
        參考文獻
第二部分:乙型重型肝炎預(yù)后模型的構(gòu)建
    中文摘要
    英文摘要
    正文
        前言
        一、材料和方法
        二、統(tǒng)計
        三.結(jié)果
        四、討論
        參考文獻
綜述
已發(fā)表文章
附一:Affymatrix工作流程圖
附二:DNA實驗樣本96孔板
附三:384孔板加樣
附四:973病人調(diào)查表格
附五:VG2圖TBX5 SCUBE3
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
[1]慢性乙型肝炎急性發(fā)作患者血清病毒準(zhǔn)種動力學(xué)研究[J]. 劉霖,王宇明,蘭林,李俊剛,鄧國宏,夏杰,趙學(xué)蘭,張緒清.  中華肝臟病雜志. 2006(01)
[2]Analyses of prognostic indices of chronic liver failure caused by hepatitis virus[J]. Xiao-Mao Li, Lin Ma, Yue-Bo Yang, Zhong-Jie Shi, Shui-Sheng Zhou, Department of Obstetrics and Gynecology, Third Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University, Guangzhou 510630, Guangdong Province, China.  World Journal of Gastroenterology. 2005(18)



本文編號:3554351

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