福建地區(qū)慢性乙肝患者HBV聚合酶區(qū)rtM204和rtN236位點(diǎn)自然變異株調(diào)查分析
發(fā)布時(shí)間:2021-08-14 06:53
目的1..檢測(cè)HBV rtM204位點(diǎn)的自然變異株在慢性乙型肝炎輕度、中度、重度組、肝硬化組中發(fā)生的頻率,探討分析rtM204位點(diǎn)(YMDD)自然變異的臨床意義。2.檢測(cè)HBV rtN236位點(diǎn)的自然變異株在慢性乙型肝炎輕度、中度、重度組以及肝硬化組中發(fā)生的頻率,探討該自然變異株與不同慢性肝病類型的關(guān)系。方法1.應(yīng)用引物特異性實(shí)時(shí)熒光定量PCR的方法檢測(cè)患者拉米夫定rtM204V/I突變。2.應(yīng)用巢式聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析技術(shù)(ntPCR-RFLP)檢測(cè)乙型肝炎病毒阿德福韋酯rtN236T位點(diǎn)突變。結(jié)果1.在250例未使用抗病毒藥物治療的慢性乙肝患者中,拉米夫定rtM204V/I位點(diǎn)突變例(2%),其中1例為YIDD陽(yáng)性,2例為YVDD陽(yáng)性,2例為YIDD、YVDD混合型。未使用抗病毒藥物慢性乙肝患者乙肝基因分型C亞型占56.40%(141/250),B亞型占43.60%(109/250)。rtM204V/I變異與未變異組在慢性乙型肝炎臨床分型(包括慢性輕度、中度、重度、乙肝肝硬化)中的分布無(wú)顯著性差異;颊逪BV基因分型、性別、HBeAg狀態(tài)、HBV DNA水平、AL...
【文章來(lái)源】:福建醫(yī)科大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:49 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
HBV-DNArtN236T位點(diǎn)目的基因的擴(kuò)增產(chǎn)物
圖 1b: HBV-DNA rtN236T 位點(diǎn)目的基因的擴(kuò)增產(chǎn)物圖 1b 中左起第一孔為為對(duì)照(C),左起第二至十孔為樣本孔(S1-S10),樣本孔分子量 300bp 左右,未被酶切為 304bp,被酶切則為 285bp,變異株為 S2 及S9。2.4 HBV RT 區(qū)基因序列測(cè)定通過(guò)巢式 PCR 引物擴(kuò)增 RT 區(qū),目標(biāo)測(cè)序范圍約為 aa170-aa250。擴(kuò)增純化后,通過(guò) Sanger 雙脫氧法在 ABI3770 測(cè)序儀(購(gòu)自美國(guó) ABI 公司)進(jìn)4 份血清標(biāo)本中均檢出 rtN236T 變異。經(jīng) HBVDNA 測(cè)序證實(shí),患者 HBV 基因組位堿基由腺嘌呤(A)突變?yōu)榘奏?C),從而導(dǎo)致 HBV 聚合酶 D 區(qū) a236 氨基冬酰胺(asparagine,N)變異為蘇氨酸(threonine,T)。HBV RT 區(qū)基因序列果與 RFLP 分析結(jié)果一致。其中一個(gè)病人的部分測(cè)序截圖如下圖(圖 2):
圖 1b: HBV-DNA rtN236T 位點(diǎn)目的基因的擴(kuò)增產(chǎn)物圖 1b 中左起第一孔為為對(duì)照(C),左起第二至十孔為樣本孔(S1-S1孔分子量 300bp 左右,未被酶切為 304bp,被酶切則為 285bp,變異株S9。2.4 HBV RT 區(qū)基因序列測(cè)定通過(guò)巢式 PCR 引物擴(kuò)增 RT 區(qū),目標(biāo)測(cè)序范圍約為 aa170-aa化后,通過(guò) Sanger 雙脫氧法在 ABI3770 測(cè)序儀(購(gòu)自美國(guó) ABI 份血清標(biāo)本中均檢出 rtN236T 變異。經(jīng) HBVDNA 測(cè)序證實(shí),患者 H堿基由腺嘌呤(A)突變?yōu)榘奏?C),從而導(dǎo)致 HBV 聚合酶 D 區(qū) 酰胺(asparagine,N)變異為蘇氨酸(threonine,T)。HBV RT 區(qū)與 RFLP 分析結(jié)果一致。其中一個(gè)病人的部分測(cè)序截圖如下圖(
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]拉米夫定治療前后乙型肝炎病毒YMDD變異的相關(guān)因素分析[J]. 曹新鮮,李佳,邱隆敏,羅亞文,陳應(yīng)華,冉燕. 中華肝臟病雜志. 2009 (09)
[2]福州市乙肝病毒基因型和基因亞型的分布及其與前C、C基因啟動(dòng)子變異的關(guān)系[J]. 郭燕,鄭能雄,姚栩,紀(jì)惠玲,陳智偉,陳艷,徐珊,張彩云,黃曉霞,楊建娜,盧園. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2008(10)
[3]未經(jīng)抗病毒治療的HBV P基因YMDD基因序列變異及與基因型的關(guān)系[J]. 陳乃玲,趙紹林,劉曉彬,韋玉芳,吳惠毅,趙文海. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2008(10)
[4]拉米夫定耐藥者乙肝病毒P基因區(qū)的突變分析[J]. 何煦,江南. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2007(05)
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[6]苦參素聯(lián)合單磷酸阿糖腺苷治療慢性乙型肝炎YMDD變異臨床研究[J]. 顧小軍,馬明,孫薇薇,李定坤. 實(shí)用臨床醫(yī)藥雜志. 2007(05)
[7]Comparison of amplicon-sequencing, pyrosequencing and real-time PCR for detection of YMDD mutants in patients with chronic hepatitis B[J]. Zhi-Jun Yang, Mei-Zeng Tu, Management School, Shangha Jiaotong University, Shanghai 200052, China Jian Liu, Laboratory Center, First Hospital of Yangzhou Yangzhou 225001, Jiangsu Province, China Xiao-Ling Wang, Laboratory Center, Subei People’s Hospital Yangzhou 225001, Jiangsu Province, China Hong-Zhi Jin, School of Life Science, Shanghai Jiaotong University, Shanghai 200240, China. World Journal of Gastroenterology. 2006(44)
[8]YMDD自然變異毒株流行病學(xué)調(diào)查[J]. 霍紅,趙書(shū)民,蔡雄,繆曉輝. 肝臟. 2006(04)
[9]未經(jīng)拉米夫定治療HBVYMDD變異的臨床分析[J]. 區(qū)映研,衛(wèi)建均,曾文鋌,朱科倫,馬佩球. 熱帶醫(yī)學(xué)雜志. 2006(07)
[10]應(yīng)用巢式聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)技術(shù)檢測(cè)乙型肝炎病毒阿德福韋耐藥變異-rtN236T變異[J]. 閆杰,謝雯,王磊,馮鑫,宋淑靜,王晶波,劉順愛(ài),魏紅山. 胃腸病學(xué)和肝病學(xué)雜志. 2006(03)
本文編號(hào):3341997
【文章來(lái)源】:福建醫(yī)科大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:49 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
HBV-DNArtN236T位點(diǎn)目的基因的擴(kuò)增產(chǎn)物
圖 1b: HBV-DNA rtN236T 位點(diǎn)目的基因的擴(kuò)增產(chǎn)物圖 1b 中左起第一孔為為對(duì)照(C),左起第二至十孔為樣本孔(S1-S10),樣本孔分子量 300bp 左右,未被酶切為 304bp,被酶切則為 285bp,變異株為 S2 及S9。2.4 HBV RT 區(qū)基因序列測(cè)定通過(guò)巢式 PCR 引物擴(kuò)增 RT 區(qū),目標(biāo)測(cè)序范圍約為 aa170-aa250。擴(kuò)增純化后,通過(guò) Sanger 雙脫氧法在 ABI3770 測(cè)序儀(購(gòu)自美國(guó) ABI 公司)進(jìn)4 份血清標(biāo)本中均檢出 rtN236T 變異。經(jīng) HBVDNA 測(cè)序證實(shí),患者 HBV 基因組位堿基由腺嘌呤(A)突變?yōu)榘奏?C),從而導(dǎo)致 HBV 聚合酶 D 區(qū) a236 氨基冬酰胺(asparagine,N)變異為蘇氨酸(threonine,T)。HBV RT 區(qū)基因序列果與 RFLP 分析結(jié)果一致。其中一個(gè)病人的部分測(cè)序截圖如下圖(圖 2):
圖 1b: HBV-DNA rtN236T 位點(diǎn)目的基因的擴(kuò)增產(chǎn)物圖 1b 中左起第一孔為為對(duì)照(C),左起第二至十孔為樣本孔(S1-S1孔分子量 300bp 左右,未被酶切為 304bp,被酶切則為 285bp,變異株S9。2.4 HBV RT 區(qū)基因序列測(cè)定通過(guò)巢式 PCR 引物擴(kuò)增 RT 區(qū),目標(biāo)測(cè)序范圍約為 aa170-aa化后,通過(guò) Sanger 雙脫氧法在 ABI3770 測(cè)序儀(購(gòu)自美國(guó) ABI 份血清標(biāo)本中均檢出 rtN236T 變異。經(jīng) HBVDNA 測(cè)序證實(shí),患者 H堿基由腺嘌呤(A)突變?yōu)榘奏?C),從而導(dǎo)致 HBV 聚合酶 D 區(qū) 酰胺(asparagine,N)變異為蘇氨酸(threonine,T)。HBV RT 區(qū)與 RFLP 分析結(jié)果一致。其中一個(gè)病人的部分測(cè)序截圖如下圖(
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]未經(jīng)抗病毒治療的HBV P基因YMDD基因序列變異及與基因型的關(guān)系[J]. 陳乃玲,趙紹林,劉曉彬,韋玉芳,吳惠毅,趙文海. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2008(10)
[4]拉米夫定耐藥者乙肝病毒P基因區(qū)的突變分析[J]. 何煦,江南. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2007(05)
[5]乙型肝炎病毒基因YMDD自然變異的檢測(cè)及意義[J]. 鄭南紅,紀(jì)礽斌,周文紅,應(yīng)豪,胡家定,丁世雄,舒晉峰. 臨床肝膽病雜志. 2007(03)
[6]苦參素聯(lián)合單磷酸阿糖腺苷治療慢性乙型肝炎YMDD變異臨床研究[J]. 顧小軍,馬明,孫薇薇,李定坤. 實(shí)用臨床醫(yī)藥雜志. 2007(05)
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[8]YMDD自然變異毒株流行病學(xué)調(diào)查[J]. 霍紅,趙書(shū)民,蔡雄,繆曉輝. 肝臟. 2006(04)
[9]未經(jīng)拉米夫定治療HBVYMDD變異的臨床分析[J]. 區(qū)映研,衛(wèi)建均,曾文鋌,朱科倫,馬佩球. 熱帶醫(yī)學(xué)雜志. 2006(07)
[10]應(yīng)用巢式聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)技術(shù)檢測(cè)乙型肝炎病毒阿德福韋耐藥變異-rtN236T變異[J]. 閆杰,謝雯,王磊,馮鑫,宋淑靜,王晶波,劉順愛(ài),魏紅山. 胃腸病學(xué)和肝病學(xué)雜志. 2006(03)
本文編號(hào):3341997
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