應用基于質譜技術的代謝組學研究肝損傷標志物
發(fā)布時間:2021-07-28 16:49
肝臟是機體代謝的樞紐,承擔了大部分的合成、分解、轉化等代謝過程,其中某些酶系和功能是肝臟所特有的,因此,系統(tǒng)研究肝臟損傷后的代謝組變化非常重要。代謝組學主要研究細胞調節(jié)過程的終端產物,研究結果能夠定量、定性的反映生物體對基因或環(huán)境變化的復雜響應,為了解生命奧秘提供了一個新途徑。本文將液相色譜-質譜聯(lián)用技術和化學計量學相結合,整合建立了一個代謝組學的研究平臺,并將該平臺應用于研究肝損傷的標志物。給Wistar大鼠口服了經典的肝毒性化合物四氯化碳,建立肝毒性模型。在給藥前一天和給藥后六天內,連續(xù)收集了實驗動物的尿液和膽汁。采用具有較廣泛樣品適應性的液相色譜作為分離手段,以高靈敏度、高選擇性的質譜作為檢測儀器,分析復雜生物樣品。在大鼠尿液中找出的病理標志物表明,四氯化碳減緩了大鼠的能量代謝,引起急性肝、腎損傷。大鼠的膽汁排泄也因肝功能受損而減緩,并發(fā)現(xiàn)膽汁中卵磷脂的含量有所增加。用代謝組學的研究方法對乙肝病人和正常病人的血清樣品進行比對,發(fā)現(xiàn)病人血清中的一些組分例如肌酸苷、蘇氨酸、酪氨酸和鵝脫氧膽酰甘氨酸等會因為受到病毒感染而濃度升高。實驗同時證實臨床案例存在很大的個體差異,增加了代謝組學應...
【文章來源】:天津大學天津市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:115 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
目錄
縮略語說明
第一章 文獻綜述
1.1 代謝組學簡介
1.1.1 代謝組學的概念
1.1.2 代謝組學與系統(tǒng)生物學
1.2 代謝組學的研究流程
1.2.1 樣品的采集和制備
1.2.2 分析檢測方法
1.2.3 數(shù)據(jù)處理
1.2.4 生物標志物的解析
1.3 基于核磁共振的代謝組學
1.3.1 核磁共振氫譜
1.3.2 核磁共振碳譜
1.3.3 核磁共振譜的輔助技術
1.4 基于質譜的代謝組學
1.4.1 氣相色譜與質譜聯(lián)用
1.4.2 液相色譜與質譜聯(lián)用
1.4.3 色質聯(lián)用技術鑒定生物標志物
1.5 代謝組學的應用
1.5.1 病理機制研究
1.5.2 臨床診斷
1.5.3 新藥安全性評價
1.6 本課題的研究意義和研究內容
1.6.1 本課題的研究意義
1.6.2 本課題的研究內容
第二章 基于液質聯(lián)用技術的代謝組學研究平臺
2.1 XCMS 數(shù)據(jù)轉換方法的評價
2.1.1 XCMS 簡介
2.1.2 考察XCMS 的靈敏度
2.2 尋找溴莫普林在大鼠體內的代謝產物
2.2.1 動物實驗
2.2.2 樣品處理
2.2.3 液質聯(lián)用分析
2.2.4 數(shù)據(jù)處理
2.2.5 實驗結果和討論
2.2.6 實驗結論
2.3 討論
2.3.1 代謝組學樣品的處理方法
2.3.2 液質聯(lián)用分析
2.3.3 代謝組學數(shù)據(jù)分析
2.3.4 代謝物的鑒定
第三章 四氯化碳肝毒性模型大鼠尿液中的肝損傷標志物
3.1 引言
3.2 實驗部分
3.2.1 實驗試劑和材料
3.2.2 動物實驗
3.2.3 尿樣處理
3.2.4 血清生物化學
3.2.5 組織病理學
3.2.6 液質聯(lián)用分析
3.2.7 數(shù)據(jù)分析
3.2.8 內源性代謝物的鑒定
3.3 實驗結果
3.3.1 血清生物化學和組織檢查
3.3.2 大鼠尿樣的預處理
3.3.3 液質聯(lián)用分析
3.3.4 數(shù)據(jù)處理
3.3.5 解析尿液中的肝損傷標志物
3.4 討論
3.4.1 液質聯(lián)用方法進行代謝組學研究
3.4.2 生物標志物解析四氯化碳引發(fā)的毒性機制
3.4.3 尿液中的生物標志物用于毒理研究
第四章 四氯化碳肝毒性模型大鼠膽汁中的肝損傷標志物
4.1 引言
4.2 實驗部分
4.2.1 實驗試劑和材料
4.2.2 動物實驗
4.2.3 膽汁樣品處理
4.2.4 液質聯(lián)用分析
4.2.5 數(shù)據(jù)分析
4.2.6 內源性代謝物的鑒定
4.3 實驗結果
4.3.1 膽汁的排泄量
4.3.2 液質聯(lián)用分析
4.3.3 數(shù)據(jù)處理
4.3.4 解析膽汁中的肝損傷標志物
4.4 討論
4.4.1 液質聯(lián)用分析
4.4.2 數(shù)據(jù)處理
4.4.3 解析膽汁中的肝損傷標志物
4.4.4 膽汁作為組學研究對象
第五章 乙型肝炎病人血清中的肝損傷標志物
5.1 引言
5.2 實驗部分
5.2.1 樣品來源
5.2.2 樣品處理方法
5.2.3 液質聯(lián)用分析
5.2.4 數(shù)據(jù)分析
5.3 實驗結果
5.3.1 液質聯(lián)用分析
5.3.2 數(shù)據(jù)分析
5.3.3 鑒定肝損傷標志物
5.3.4 解析血清中的肝損傷標志物
5.4 討論
5.4.1 未知代謝物鑒定
5.4.2 個體差異與臨床診斷
5.4.3 比較動物模型和人的肝損傷標志物
第六章 結論與展望
6.1 結論
6.2 創(chuàng)新點
6.3 展望
參考文獻
發(fā)表論文和參加科研情況說明
致謝
本文編號:3308274
【文章來源】:天津大學天津市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:115 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
目錄
縮略語說明
第一章 文獻綜述
1.1 代謝組學簡介
1.1.1 代謝組學的概念
1.1.2 代謝組學與系統(tǒng)生物學
1.2 代謝組學的研究流程
1.2.1 樣品的采集和制備
1.2.2 分析檢測方法
1.2.3 數(shù)據(jù)處理
1.2.4 生物標志物的解析
1.3 基于核磁共振的代謝組學
1.3.1 核磁共振氫譜
1.3.2 核磁共振碳譜
1.3.3 核磁共振譜的輔助技術
1.4 基于質譜的代謝組學
1.4.1 氣相色譜與質譜聯(lián)用
1.4.2 液相色譜與質譜聯(lián)用
1.4.3 色質聯(lián)用技術鑒定生物標志物
1.5 代謝組學的應用
1.5.1 病理機制研究
1.5.2 臨床診斷
1.5.3 新藥安全性評價
1.6 本課題的研究意義和研究內容
1.6.1 本課題的研究意義
1.6.2 本課題的研究內容
第二章 基于液質聯(lián)用技術的代謝組學研究平臺
2.1 XCMS 數(shù)據(jù)轉換方法的評價
2.1.1 XCMS 簡介
2.1.2 考察XCMS 的靈敏度
2.2 尋找溴莫普林在大鼠體內的代謝產物
2.2.1 動物實驗
2.2.2 樣品處理
2.2.3 液質聯(lián)用分析
2.2.4 數(shù)據(jù)處理
2.2.5 實驗結果和討論
2.2.6 實驗結論
2.3 討論
2.3.1 代謝組學樣品的處理方法
2.3.2 液質聯(lián)用分析
2.3.3 代謝組學數(shù)據(jù)分析
2.3.4 代謝物的鑒定
第三章 四氯化碳肝毒性模型大鼠尿液中的肝損傷標志物
3.1 引言
3.2 實驗部分
3.2.1 實驗試劑和材料
3.2.2 動物實驗
3.2.3 尿樣處理
3.2.4 血清生物化學
3.2.5 組織病理學
3.2.6 液質聯(lián)用分析
3.2.7 數(shù)據(jù)分析
3.2.8 內源性代謝物的鑒定
3.3 實驗結果
3.3.1 血清生物化學和組織檢查
3.3.2 大鼠尿樣的預處理
3.3.3 液質聯(lián)用分析
3.3.4 數(shù)據(jù)處理
3.3.5 解析尿液中的肝損傷標志物
3.4 討論
3.4.1 液質聯(lián)用方法進行代謝組學研究
3.4.2 生物標志物解析四氯化碳引發(fā)的毒性機制
3.4.3 尿液中的生物標志物用于毒理研究
第四章 四氯化碳肝毒性模型大鼠膽汁中的肝損傷標志物
4.1 引言
4.2 實驗部分
4.2.1 實驗試劑和材料
4.2.2 動物實驗
4.2.3 膽汁樣品處理
4.2.4 液質聯(lián)用分析
4.2.5 數(shù)據(jù)分析
4.2.6 內源性代謝物的鑒定
4.3 實驗結果
4.3.1 膽汁的排泄量
4.3.2 液質聯(lián)用分析
4.3.3 數(shù)據(jù)處理
4.3.4 解析膽汁中的肝損傷標志物
4.4 討論
4.4.1 液質聯(lián)用分析
4.4.2 數(shù)據(jù)處理
4.4.3 解析膽汁中的肝損傷標志物
4.4.4 膽汁作為組學研究對象
第五章 乙型肝炎病人血清中的肝損傷標志物
5.1 引言
5.2 實驗部分
5.2.1 樣品來源
5.2.2 樣品處理方法
5.2.3 液質聯(lián)用分析
5.2.4 數(shù)據(jù)分析
5.3 實驗結果
5.3.1 液質聯(lián)用分析
5.3.2 數(shù)據(jù)分析
5.3.3 鑒定肝損傷標志物
5.3.4 解析血清中的肝損傷標志物
5.4 討論
5.4.1 未知代謝物鑒定
5.4.2 個體差異與臨床診斷
5.4.3 比較動物模型和人的肝損傷標志物
第六章 結論與展望
6.1 結論
6.2 創(chuàng)新點
6.3 展望
參考文獻
發(fā)表論文和參加科研情況說明
致謝
本文編號:3308274
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