腸道菌群特征與抗結(jié)核藥物性肝損傷的關(guān)系研究
發(fā)布時間:2021-07-28 05:26
目的探究肺結(jié)核患者治療前、后腸道菌群的動態(tài)改變情況,并分析腸道菌群與抗結(jié)核藥物性肝損傷(ADLI)的關(guān)系;分析四種一線抗結(jié)核藥物構(gòu)建肝損傷模型大鼠的腸道菌群構(gòu)成及腸道屏障功能的變化。利用篩檢出的菌株構(gòu)建干預(yù)模型,探究其在抗結(jié)核藥物性肝損傷中潛在作用機制。方法首先,收集2017年10月2018年10月期間在內(nèi)蒙古呼倫貝爾市傳染病醫(yī)院確診的肺結(jié)核患者治療前(TI)和治療后(T2)的兩份糞便標(biāo)本,并按照治療后34周間是否發(fā)生肝損傷將患者分為肝損傷組(ADLI組)和非肝損傷組(NonADLI組)。利用細(xì)菌16S rDNA高通量測序方法分析腸道菌群的差異、全自動生化分析儀檢測肝功能指標(biāo)的變化、ELISA法檢測血清TNF-α和IL-6水平的變化。其次,使用四種抗結(jié)核藥物異煙肼(H)、利福平(R)、吡嗪酰胺(Z)、乙胺丁醇(E)聯(lián)合給藥建立大鼠肝損傷模型。大鼠隨機分為對照組(D組,n=8)、HRZE給藥15天組(HRZET1,n=8)、HRZE給藥30天組(HRZET2,n=8),16S r...
【文章來源】:華北理工大學(xué)河北省
【文章頁數(shù)】:142 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
肝損傷組和非肝損傷組從T1到T2時肝功能指標(biāo)的變化
ADLI與Non_ADLI組比較,TNF-α和IL-6蛋白的含量在ADLI_T1 vs Non_ADLI_T1時均無統(tǒng)計學(xué)差異(均P>0.05),而在ADLI_T2 vs Non_ADLI_T2時均存在統(tǒng)計學(xué)差異(均P<0.05),且在ADLI_T2組水平均要高于Non_ADLI_T2組。1.2.4 測序序列的統(tǒng)計分析
121例患者(44例ADLI患者和77例Non-ADLI患者)在T1和T2兩個時點共242份糞便樣本經(jīng)測序共獲得8637463條有效序列,每個樣本的平均序列數(shù)目為35692.00±11546.38條,這些序列長度主要集中在421-440bp之間(圖3),平均長度為417.88±5.07bp。利用Usearch軟件在0.97相似度下進行OTU聚類,再將所有clean reads比對到OTU序列上,最終得到7660593條mapped reads,平均每個樣本的mapped reads數(shù)量為31655.34±10292.11條,各樣本劃分的OTU數(shù)目總共27322個。就各分組而言,ADLI_T1組和ADLI_T2組有效序列分別為1558272條(平均序列數(shù)為35415.27±13221.70條)和1620855條(平均序列數(shù)為36837.61±10543.88條),經(jīng)OTU聚類后分別得到1341473條高質(zhì)量序列(平均序列數(shù)為30488.02±11792.23條)和1452003條高質(zhì)量序列(平均序列數(shù)為33000.07±9874.82條);Non_ADLI_T1組和Non_ADLI_T2組有效序列分別為2650870條(平均序列數(shù)為34426.88±11260.36條)和2807466條(平均序列數(shù)為36460.609±11435.34條),經(jīng)OTU聚類后分別得到2370341條高質(zhì)量序列(平均序列數(shù)為30783.65±10559.31條)和2496776條高質(zhì)量序列(平均序列數(shù)目為32425.66±9345.99條)。每個樣本詳細(xì)的MiSeq測序信息見表5。圖3 序列長度的統(tǒng)計分布
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Akkermansia muciniphila: a promising target for the therapy of metabolic syndrome and related diseases[J]. ZHOU Ji-Chao,ZHANG Xiao-Wei. Chinese Journal of Natural Medicines. 2019(11)
[2]Gut microbiota dysbiosis in patients with nonalcoholic fatty liver disease[J]. Feng Shen,Rui-Dan Zheng,Xing-Qiang Sun,Wen-Jin Ding,Xiao-Ying Wang,Jian-Gao Fan. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2017(04)
[3]role of the normal gut microbiota[J]. Sai Manasa Jandhyala,Rupjyoti Talukdar,Chivkula Subramanyam,Harish Vuyyuru,Mitnala Sasikala,D Nageshwar Reddy. World Journal of Gastroenterology. 2015(29)
本文編號:3307311
【文章來源】:華北理工大學(xué)河北省
【文章頁數(shù)】:142 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
肝損傷組和非肝損傷組從T1到T2時肝功能指標(biāo)的變化
ADLI與Non_ADLI組比較,TNF-α和IL-6蛋白的含量在ADLI_T1 vs Non_ADLI_T1時均無統(tǒng)計學(xué)差異(均P>0.05),而在ADLI_T2 vs Non_ADLI_T2時均存在統(tǒng)計學(xué)差異(均P<0.05),且在ADLI_T2組水平均要高于Non_ADLI_T2組。1.2.4 測序序列的統(tǒng)計分析
121例患者(44例ADLI患者和77例Non-ADLI患者)在T1和T2兩個時點共242份糞便樣本經(jīng)測序共獲得8637463條有效序列,每個樣本的平均序列數(shù)目為35692.00±11546.38條,這些序列長度主要集中在421-440bp之間(圖3),平均長度為417.88±5.07bp。利用Usearch軟件在0.97相似度下進行OTU聚類,再將所有clean reads比對到OTU序列上,最終得到7660593條mapped reads,平均每個樣本的mapped reads數(shù)量為31655.34±10292.11條,各樣本劃分的OTU數(shù)目總共27322個。就各分組而言,ADLI_T1組和ADLI_T2組有效序列分別為1558272條(平均序列數(shù)為35415.27±13221.70條)和1620855條(平均序列數(shù)為36837.61±10543.88條),經(jīng)OTU聚類后分別得到1341473條高質(zhì)量序列(平均序列數(shù)為30488.02±11792.23條)和1452003條高質(zhì)量序列(平均序列數(shù)為33000.07±9874.82條);Non_ADLI_T1組和Non_ADLI_T2組有效序列分別為2650870條(平均序列數(shù)為34426.88±11260.36條)和2807466條(平均序列數(shù)為36460.609±11435.34條),經(jīng)OTU聚類后分別得到2370341條高質(zhì)量序列(平均序列數(shù)為30783.65±10559.31條)和2496776條高質(zhì)量序列(平均序列數(shù)目為32425.66±9345.99條)。每個樣本詳細(xì)的MiSeq測序信息見表5。圖3 序列長度的統(tǒng)計分布
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Akkermansia muciniphila: a promising target for the therapy of metabolic syndrome and related diseases[J]. ZHOU Ji-Chao,ZHANG Xiao-Wei. Chinese Journal of Natural Medicines. 2019(11)
[2]Gut microbiota dysbiosis in patients with nonalcoholic fatty liver disease[J]. Feng Shen,Rui-Dan Zheng,Xing-Qiang Sun,Wen-Jin Ding,Xiao-Ying Wang,Jian-Gao Fan. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2017(04)
[3]role of the normal gut microbiota[J]. Sai Manasa Jandhyala,Rupjyoti Talukdar,Chivkula Subramanyam,Harish Vuyyuru,Mitnala Sasikala,D Nageshwar Reddy. World Journal of Gastroenterology. 2015(29)
本文編號:3307311
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