基于高效液相色譜-質譜聯(lián)用技術的HBV相關性肝纖維化血清代謝標志物篩選研究
發(fā)布時間:2021-05-28 13:10
目的:探討乙型肝炎病毒(HBV)相關肝纖維化和慢性乙型肝炎(CHB)患者血清代謝組的差異,尋找與HBV相關性肝纖維化相關的潛在標志物。方法:采用高效液相色譜-質譜聯(lián)用技術(HPLC-MS)分析16名HBV相關性肝纖維化和16名CHB患者血清代謝譜;應用主成分分析、變量投影重要性分析值等統(tǒng)計分析及數(shù)據(jù)庫檢索,篩選鑒定有差異的代謝物;利用Metabo Analyst 4.0軟件對差異代謝物進行代謝通路富集分析,篩選出富集于主要代謝通路上的關鍵代謝物;利用受試者工作特征曲線(ROC)評價主要關鍵代謝物作為潛在標志物的診斷性能。結果:(1)共篩選并鑒定出神經鞘磷脂、1-磷酸-鞘氨醇、磷脂酰膽堿、磷脂酸、磷脂酰甘油、磷脂酰絲氨酸、磷脂酰肌醇、尿酸、蘇氨酸、乳酸、脫氧膽酸、肉桂酸、左旋肉堿(卡尼。ⅲㄉ窠洠┣拾贝、神經酰胺、酪氨酸、甘露醇等54種內源性差異代謝產物。(2)代謝通路分析和富集分析發(fā)現(xiàn),神經鞘磷脂、1-磷酸-鞘氨醇、(神經)鞘氨醇、神經酰胺等4種差異代謝物主要富集于鞘脂代謝通路(-log(p)=9.747,impact=0.420),而磷脂酰膽堿、磷脂酰絲氨酸、磷脂酰肌醇、磷脂酸、磷...
【文章來源】:西南醫(yī)科大學四川省
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
技術線路圖
-16-partialleastsquaresdiscriminationanalysis,OPLS-DA)進行建模分析。用OPLS-DA模型的變量投影重要性分析(variableimportanceintheprojection,VIP)值(閾值>1),并結合t-test的P值(P<0.05)來尋找差異性表達代謝物。通過搜索在線數(shù)據(jù)庫(http://metlin.scripps.edu/),比較質譜的質荷比(Masstochargeratio,m/z)或精確分子質量(Mass)對差異性代謝物進行鑒定。4.4差異代謝物富集分析和代謝通路分析使用MetaboAnalyst4.0在線分析軟件(https://www.metaboanalyst.ca)對鑒定的差異代謝物進行代謝通路分析與富集分析,以確定差異代謝物涉及的代謝途徑,并對富集在通路上的代謝差異物進行診斷性能分析。具體步驟如下:(1)首先,在“MetaboAnalysthome”界面,點擊“clickheretostart”,進入模塊選擇頁面,見下圖2;圖2代謝通路分析步驟1Figure2Metabolicpathwayanalysisstep1(2)在模塊選擇頁面,選擇“PathwayAnalysis”模塊,見下圖3;
-17-圖3代謝通路分析步驟2Figure3Metabolicpathwayanalysisstep2(3)上傳數(shù)據(jù),輸入化合物名稱,“InputType”選擇為化合物名稱,參數(shù)設置完成后,點擊“Submit”,見下圖4;圖4代謝通路分析步驟3Figure4Metabolicpathwayanalysisstep3(4)化合物名稱/ID檢查:希臘字母用英文名稱(即alpha,beta)替換;正常白色的查詢名稱表示完全匹配,在下載文件中標記為“1”;突出顯示的查詢名稱表示沒有完全匹配項或唯一匹配項,在下載的文件中標記
【參考文獻】:
期刊論文
[1]慢性乙型肝炎防治指南(2019年版)[J]. 王貴強,王福生,莊輝,李太生,鄭素軍,趙鴻,段鐘平,侯金林,賈繼東,徐小元,崔富強,魏來. 臨床肝膽病雜志. 2019(12)
[2]HPLC/MS分析乙肝相關性肝細胞癌的血清代謝輪廓分析[J]. 張磊,范志娟,康華,王宇凡,劉樹業(yè),單忠強. 南方醫(yī)科大學學報. 2019(01)
[3]多項肝纖維化無創(chuàng)診斷模型在乙肝后肝硬化中的診斷效能[J]. 姚文軍,謝群,王文星,胡忠群,柯凌霞. 現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2018(16)
[4]Progress in non-invasive detection of liver fibrosis[J]. Chengxi Li,Rentao Li,Wei Zhang. Cancer Biology & Medicine. 2018(02)
[5]中國2007-2016年59歲以下普通人群HBsAg陽性率的Meta分析[J]. 張維璐,吉兆華,付婷,張磊,蘇海霞,閆永平. 中華流行病學雜志. 2017 (09)
[6]慢性乙型肝炎防治指南(2015年版)[J]. 王貴強,王福生,成軍,任紅,莊輝,孫劍,李蘭娟,李杰,孟慶華,趙景民,段鐘平,侯金林,賈繼東,唐紅,盛吉芳,彭劼,魯鳳民,謝青,魏來. 實用肝臟病雜志. 2016(03)
[7]《2015年世界衛(wèi)生組織慢性乙型肝炎病毒感染預防、關懷和治療指南》解讀:慢性乙型肝炎的抗病毒治療策略比較[J]. 戴明佳,冷雪君,顏學兵. 臨床肝膽病雜志. 2015(07)
[8]血清鞘脂類的變化與肝纖維化進展及治療效果的關系[J]. 孔文麗,李婉玉,Grammatikos G. 臨床肝膽病雜志. 2015(04)
[9]瞬時彈性成像在慢性乙型肝炎肝纖維化診斷中的應用[J]. 徐燕,馮艷玲,施裕新. 山東醫(yī)藥. 2014(47)
[10]代謝組學及其分析技術的研究進展[J]. 李寧,范雪梅,王義明,王玉,羅國安. 中南藥學. 2014(07)
博士論文
[1]HBV相關肝纖維化組織的蛋白質組學和轉錄組學研究[D]. 闞方明.北京協(xié)和醫(yī)學院 2017
碩士論文
[1]肝癌中特異性磷脂改變的初步研究[D]. 戴超.南昌大學 2017
[2]miR-134在肝纖維化中的作用及其機制研究[D]. 王建雄.第二軍醫(yī)大學 2014
[3]循環(huán)miR-185對臨床肝纖維化診斷價值的研究[D]. 李彬彬.第二軍醫(yī)大學 2013
[4]肝纖維化無創(chuàng)診斷模型在慢性乙型肝炎患者中的驗證和探索[D]. 吳盛迪.復旦大學 2009
本文編號:3208173
【文章來源】:西南醫(yī)科大學四川省
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
技術線路圖
-16-partialleastsquaresdiscriminationanalysis,OPLS-DA)進行建模分析。用OPLS-DA模型的變量投影重要性分析(variableimportanceintheprojection,VIP)值(閾值>1),并結合t-test的P值(P<0.05)來尋找差異性表達代謝物。通過搜索在線數(shù)據(jù)庫(http://metlin.scripps.edu/),比較質譜的質荷比(Masstochargeratio,m/z)或精確分子質量(Mass)對差異性代謝物進行鑒定。4.4差異代謝物富集分析和代謝通路分析使用MetaboAnalyst4.0在線分析軟件(https://www.metaboanalyst.ca)對鑒定的差異代謝物進行代謝通路分析與富集分析,以確定差異代謝物涉及的代謝途徑,并對富集在通路上的代謝差異物進行診斷性能分析。具體步驟如下:(1)首先,在“MetaboAnalysthome”界面,點擊“clickheretostart”,進入模塊選擇頁面,見下圖2;圖2代謝通路分析步驟1Figure2Metabolicpathwayanalysisstep1(2)在模塊選擇頁面,選擇“PathwayAnalysis”模塊,見下圖3;
-17-圖3代謝通路分析步驟2Figure3Metabolicpathwayanalysisstep2(3)上傳數(shù)據(jù),輸入化合物名稱,“InputType”選擇為化合物名稱,參數(shù)設置完成后,點擊“Submit”,見下圖4;圖4代謝通路分析步驟3Figure4Metabolicpathwayanalysisstep3(4)化合物名稱/ID檢查:希臘字母用英文名稱(即alpha,beta)替換;正常白色的查詢名稱表示完全匹配,在下載文件中標記為“1”;突出顯示的查詢名稱表示沒有完全匹配項或唯一匹配項,在下載的文件中標記
【參考文獻】:
期刊論文
[1]慢性乙型肝炎防治指南(2019年版)[J]. 王貴強,王福生,莊輝,李太生,鄭素軍,趙鴻,段鐘平,侯金林,賈繼東,徐小元,崔富強,魏來. 臨床肝膽病雜志. 2019(12)
[2]HPLC/MS分析乙肝相關性肝細胞癌的血清代謝輪廓分析[J]. 張磊,范志娟,康華,王宇凡,劉樹業(yè),單忠強. 南方醫(yī)科大學學報. 2019(01)
[3]多項肝纖維化無創(chuàng)診斷模型在乙肝后肝硬化中的診斷效能[J]. 姚文軍,謝群,王文星,胡忠群,柯凌霞. 現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2018(16)
[4]Progress in non-invasive detection of liver fibrosis[J]. Chengxi Li,Rentao Li,Wei Zhang. Cancer Biology & Medicine. 2018(02)
[5]中國2007-2016年59歲以下普通人群HBsAg陽性率的Meta分析[J]. 張維璐,吉兆華,付婷,張磊,蘇海霞,閆永平. 中華流行病學雜志. 2017 (09)
[6]慢性乙型肝炎防治指南(2015年版)[J]. 王貴強,王福生,成軍,任紅,莊輝,孫劍,李蘭娟,李杰,孟慶華,趙景民,段鐘平,侯金林,賈繼東,唐紅,盛吉芳,彭劼,魯鳳民,謝青,魏來. 實用肝臟病雜志. 2016(03)
[7]《2015年世界衛(wèi)生組織慢性乙型肝炎病毒感染預防、關懷和治療指南》解讀:慢性乙型肝炎的抗病毒治療策略比較[J]. 戴明佳,冷雪君,顏學兵. 臨床肝膽病雜志. 2015(07)
[8]血清鞘脂類的變化與肝纖維化進展及治療效果的關系[J]. 孔文麗,李婉玉,Grammatikos G. 臨床肝膽病雜志. 2015(04)
[9]瞬時彈性成像在慢性乙型肝炎肝纖維化診斷中的應用[J]. 徐燕,馮艷玲,施裕新. 山東醫(yī)藥. 2014(47)
[10]代謝組學及其分析技術的研究進展[J]. 李寧,范雪梅,王義明,王玉,羅國安. 中南藥學. 2014(07)
博士論文
[1]HBV相關肝纖維化組織的蛋白質組學和轉錄組學研究[D]. 闞方明.北京協(xié)和醫(yī)學院 2017
碩士論文
[1]肝癌中特異性磷脂改變的初步研究[D]. 戴超.南昌大學 2017
[2]miR-134在肝纖維化中的作用及其機制研究[D]. 王建雄.第二軍醫(yī)大學 2014
[3]循環(huán)miR-185對臨床肝纖維化診斷價值的研究[D]. 李彬彬.第二軍醫(yī)大學 2013
[4]肝纖維化無創(chuàng)診斷模型在慢性乙型肝炎患者中的驗證和探索[D]. 吳盛迪.復旦大學 2009
本文編號:3208173
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