幽門螺桿菌cag致病島CagL蛋白的功能預測及其在消化道組織中的表達
發(fā)布時間:2021-02-21 22:15
幽門螺桿菌(Helicobacter pylori,H.pylori)是人類胃病的重要病原體之一,是一種可長期定植于人類胃粘膜的革蘭陰性螺旋形微需氧菌。目前,全球感染率已達到50%。已經證實,患有慢性胃炎、消化性潰瘍、胃癌和胃粘膜相關淋巴樣組織(MALT)淋巴瘤等的多種胃腸道疾病皆與H.pylori感染密切相關。I型H.pylori菌株因攜帶cag致病島(cag pathogenicity island,cag PAI)而致其毒性較強。幽門螺桿菌的重要毒力因子-細胞毒素相關基因A蛋白(Cytotoxin-associated gene A,CagA)被合成并通過致病島編碼的IV型分泌系統(tǒng)合成并轉運進入宿主細胞內,導致細胞功能紊亂。目前,已知致病島由27個基因組成,編碼27種蛋白,但大多數(shù)基因的功能和發(fā)病機制尚未完全明確。本文以cagL基因作為研究對象,利用生物信息學方法預測其功能,并通過微生物學、分子生物學和免疫學等技術驗證其功能,為進一步研究cag致病島的功能和致病機制奠定基礎。方法:1.用在線服務器及軟件計算CagL的各種理化參數(shù),分析其重復序列、疏水性曲線、抗原性曲線、進化樹;進...
【文章來源】:江蘇大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:51 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
英文縮略詞表
第一章 緒論
1.1 研究背景
1.1.1 幽門螺桿菌簡述
1.1.2 幽門螺桿菌致病機制的研究現(xiàn)狀
1.1.3 幽門螺桿菌cagPAI研究現(xiàn)狀
1.1.4 幽門螺桿菌cagPAI編碼的T4SS研究現(xiàn)狀
1.2 本研究的目的、內容及技術路線
1.2.1 研究目的
1.2.2 研究內容
1.2.3 技術路線
第二章 幽門螺桿菌幽門螺桿菌cagL基因的生物信息學分析
2.1 材料和方法
2.1.1 材料
2.1.2 方法
2.2 結果
2.2.1 CagL的序列組成和基本性質
2.2.2 同源性分析
2.2.3 二級結構的預測
2.2.4 三級結構預測
2.2.5 功能位點分析
2.3 討論
第三章 幽門螺桿菌cagL基因缺失株的構建及對CagA轉運的影響
3.1 材料
3.1.1 載體與菌株
3.1.2 主要試劑和儀器
3.2 方法
3.2.1 細菌的培養(yǎng)
3.2.2 自殺質粒同源臂片段的擴增
3.2.3 重組自殺質粒的構建和鑒定
3.2.4 cagL基因缺陷株的構建與鑒定
3.2.5 CagA蛋白轉運實驗
3.3 結果
3.3.1 cagL基因缺陷重組自殺質粒的構建
3.3.2 cagL基因缺陷株的鑒定
3.3.3 CagA蛋白轉運實驗
3.4 討論
第四章 CagL蛋白的亞細胞定位及其在消化道組織中的表達
4.1 方法
4.1.1 菌株、質粒
4.1.2 主要試劑
4.1.3 主要溶液配制
4.1.4 主要儀器
4.2 方法
4.2.1 H.pylori培養(yǎng)
4.2.2 H.pylori分離組分及亞細胞定位
4.2.3 免疫組化鑒定CagL蛋白胃組織中的表達
4.3 結果
4.3.1 CagL蛋白的亞細胞定位
4.3.2 免疫組化鑒定CagL蛋白在胃粘膜組織中的表達
4.4 討論
第五章 主要結論及展望
5.1 主要結論
5.2 主要展望
參考文獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]幽門螺桿菌Ⅳ型分泌系統(tǒng)cagT基因的克隆表達及其重組蛋白對SGC-7901細胞增殖和分泌細胞因子功能的影響[J]. 崔蕾蕾,邵世和,李良菊,王華,母潤紅,鞠小麗,董蘇榮,鐘橋. 微生物學報. 2008(04)
[2]NF-κB and ERK-signaling pathways contribute to the gene expression induced by cag PAI-positive-Helicobacter pylori infection[J]. Wataru Shibata,Yoshihiro Hirata,Haruhiko Yoshida,Motoyuki Otsuka,Yujin Hoshida,Keiji Ogura,Shin Maeda,Tomoya Ohmae,Ayako Yanai,Yuzo Mitsuno,Naohiko Seki,Takao Kawabe,Masao Omata. World Journal of Gastroenterology. 2005(39)
本文編號:3045001
【文章來源】:江蘇大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:51 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
英文縮略詞表
第一章 緒論
1.1 研究背景
1.1.1 幽門螺桿菌簡述
1.1.2 幽門螺桿菌致病機制的研究現(xiàn)狀
1.1.3 幽門螺桿菌cagPAI研究現(xiàn)狀
1.1.4 幽門螺桿菌cagPAI編碼的T4SS研究現(xiàn)狀
1.2 本研究的目的、內容及技術路線
1.2.1 研究目的
1.2.2 研究內容
1.2.3 技術路線
第二章 幽門螺桿菌幽門螺桿菌cagL基因的生物信息學分析
2.1 材料和方法
2.1.1 材料
2.1.2 方法
2.2 結果
2.2.1 CagL的序列組成和基本性質
2.2.2 同源性分析
2.2.3 二級結構的預測
2.2.4 三級結構預測
2.2.5 功能位點分析
2.3 討論
第三章 幽門螺桿菌cagL基因缺失株的構建及對CagA轉運的影響
3.1 材料
3.1.1 載體與菌株
3.1.2 主要試劑和儀器
3.2 方法
3.2.1 細菌的培養(yǎng)
3.2.2 自殺質粒同源臂片段的擴增
3.2.3 重組自殺質粒的構建和鑒定
3.2.4 cagL基因缺陷株的構建與鑒定
3.2.5 CagA蛋白轉運實驗
3.3 結果
3.3.1 cagL基因缺陷重組自殺質粒的構建
3.3.2 cagL基因缺陷株的鑒定
3.3.3 CagA蛋白轉運實驗
3.4 討論
第四章 CagL蛋白的亞細胞定位及其在消化道組織中的表達
4.1 方法
4.1.1 菌株、質粒
4.1.2 主要試劑
4.1.3 主要溶液配制
4.1.4 主要儀器
4.2 方法
4.2.1 H.pylori培養(yǎng)
4.2.2 H.pylori分離組分及亞細胞定位
4.2.3 免疫組化鑒定CagL蛋白胃組織中的表達
4.3 結果
4.3.1 CagL蛋白的亞細胞定位
4.3.2 免疫組化鑒定CagL蛋白在胃粘膜組織中的表達
4.4 討論
第五章 主要結論及展望
5.1 主要結論
5.2 主要展望
參考文獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]幽門螺桿菌Ⅳ型分泌系統(tǒng)cagT基因的克隆表達及其重組蛋白對SGC-7901細胞增殖和分泌細胞因子功能的影響[J]. 崔蕾蕾,邵世和,李良菊,王華,母潤紅,鞠小麗,董蘇榮,鐘橋. 微生物學報. 2008(04)
[2]NF-κB and ERK-signaling pathways contribute to the gene expression induced by cag PAI-positive-Helicobacter pylori infection[J]. Wataru Shibata,Yoshihiro Hirata,Haruhiko Yoshida,Motoyuki Otsuka,Yujin Hoshida,Keiji Ogura,Shin Maeda,Tomoya Ohmae,Ayako Yanai,Yuzo Mitsuno,Naohiko Seki,Takao Kawabe,Masao Omata. World Journal of Gastroenterology. 2005(39)
本文編號:3045001
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