聚乙二醇姜黃素衍生物（Curc-mPEG454）對肝細(xì)胞脂肪變的改善作用及機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間：2020-12-31 16:50
背景:非酒精性脂肪性肝�。∟AFLD）是我國最常見的慢性肝病,但目前尚無特異性藥物用于治療NAFLD。前期研究證實(shí)聚乙二醇姜黃素衍生物Curc-mPEG454可顯著降低高脂飲食（HFD）喂養(yǎng)小鼠的體重增長值和血清甘油三酯（TG）水平,但尚不清楚Curc-mPEG454調(diào)節(jié)肝臟脂質(zhì)與脂肪酸代謝的機(jī)制,也不清楚它是否對人肝細(xì)胞脂肪變有類似的改善作用。本研究采用生物信息學(xué)方法分析Curc-mPEG454治療后的小鼠肝臟RNA測序數(shù)據(jù),以探究Curc-mPEG454是否調(diào)節(jié)脂質(zhì)代謝相關(guān)的關(guān)鍵基因,并使用體外游離脂肪酸（FFA）誘導(dǎo)的HepG2細(xì)胞脂肪變模型來考察Curc-mPEG454對人肝細(xì)胞脂肪變的作用及機(jī)制。材料與方法:1.RNA測序及差異基因的識(shí)別:提取對照組、HFD組、Curc-mPEG454 50mg/kg治療組的小鼠肝組織RNA,質(zhì)控合格后送華大基因公司進(jìn)行RNA測序。采用FPKM法計(jì)算基因表達(dá)水平,并應(yīng)用NOISeq方法按差異表達(dá)倍數(shù)>2、偏離概率值>0.7為顯著性標(biāo)準(zhǔn)篩選差異表達(dá)基因。2.差異基因GO分析和KEGG分析:使用基于R語言的clusterProfile...
【文章來源】：重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁數(shù)】：66 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
姜黃素和聚乙二醇姜黃素衍生物Curc-mPEG454化學(xué)結(jié)構(gòu)圖
3.2 差異基因的識(shí)別為了進(jìn)一步挖掘 Curc-mPEG454 降脂作用的潛在機(jī)制，我們通過高通量測序來觀察各基因在轉(zhuǎn)錄組水平的變化。通過對原始數(shù)據(jù)質(zhì)控處理后，共檢測到 17154個(gè)基因。我們以差異表達(dá)倍數(shù)＞2 倍及偏離概率值＞0.7 為條件篩選差異表達(dá)基因，結(jié)果見圖 1-1，發(fā)現(xiàn) HFD 共導(dǎo)致 1319 個(gè)基因顯著改變，其中包括 638 個(gè)基因表達(dá)上調(diào)，681 個(gè)基因下調(diào)。與 HFD 組相比，Curc-mPEG454 治療組有 511 個(gè)基因變化明顯，包括 136 個(gè)基因上調(diào)和 375 個(gè)基因下調(diào)。通過比較 HFD 組的 1319 個(gè)差異基因和 Curc-mPEG454 治療組的 511 個(gè)差異基因，我們發(fā)現(xiàn)有 152 個(gè)基因同時(shí)在治療前后有明顯變化。其中，有 74 個(gè)基因在 HFD 組高表達(dá)，而 Curc-mPEG454 治療后表達(dá)下降；有 18 個(gè)基因從 HFD 組低表達(dá)轉(zhuǎn)變?yōu)橹委熃M中高表達(dá)狀態(tài)。這 152個(gè)差異基因表達(dá)情況見圖 1-1，通過熱圖我們可以看出，差異基因在組內(nèi)表達(dá)相似，從另一方面反映出我們數(shù)據(jù)質(zhì)量可信，可進(jìn)行后續(xù)分析。
分析可以明確差異基因主要參與的生物學(xué)過程，以便進(jìn)一步了解差異作用。圖 1-2 展示了 HFD 組和 Curc-mPEG454 治療組 GO-BP 分析中變 5 條生物學(xué)過程。HFD 引起的生物學(xué)改變主要富集在脂肪酸代謝過程酸代謝過程的有 50 個(gè)基因，其中有 21 個(gè)基因主要參與長鏈脂肪酸代D36、FATP4、SCD1、CYP2E1、ACOT 等基因。Curc-mPEG454 治療改變主要富集在脂肪酸代謝過程，包括 37 個(gè)基因如 CD36、PPAR 、PPA10、ACOT、ACADM。鑒于脂肪酸代謝過程在 HFD 組和治療組均發(fā)，我們進(jìn)一步分析了參與脂肪酸代謝的基因在治療前后的改變。我們發(fā)造成大多數(shù)基因表達(dá)上調(diào)（如 CD36、FATP4、APOA2），進(jìn)而導(dǎo)致脂多并蓄積在肝細(xì)胞內(nèi)。然而，Curc-mPEG454 可以顯著下調(diào)這些基因的D36、PPARγ、CYP4A10、ACOT2、ACADM 和 ACOX1），從而減少取和代謝。
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Silymarin: An option to treat non-alcoholic fatty liver disease[J]. Carmela Colica,Luigi Boccuto,Ludovico Abenavoli. World Journal of Gastroenterology. 2017(47)
[2]CD36在非酒精性脂肪性肝病中的作用[J]. 詹柱,任紅,彭明利. 中華肝臟病雜志. 2017 (12)
[3]非那西丁探針法動(dòng)態(tài)觀測非酒精性脂肪肝大鼠發(fā)病進(jìn)程中的CYP1A2活性[J]. 劉瑩,金涌,蔣培培,吳德敏,方慧子,周靜婷,季俊虬. 中國藥房. 2012(17)
本文編號：2949974
【文章來源】：重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁數(shù)】：66 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
姜黃素和聚乙二醇姜黃素衍生物Curc-mPEG454化學(xué)結(jié)構(gòu)圖
3.2 差異基因的識(shí)別為了進(jìn)一步挖掘 Curc-mPEG454 降脂作用的潛在機(jī)制，我們通過高通量測序來觀察各基因在轉(zhuǎn)錄組水平的變化。通過對原始數(shù)據(jù)質(zhì)控處理后，共檢測到 17154個(gè)基因。我們以差異表達(dá)倍數(shù)＞2 倍及偏離概率值＞0.7 為條件篩選差異表達(dá)基因，結(jié)果見圖 1-1，發(fā)現(xiàn) HFD 共導(dǎo)致 1319 個(gè)基因顯著改變，其中包括 638 個(gè)基因表達(dá)上調(diào)，681 個(gè)基因下調(diào)。與 HFD 組相比，Curc-mPEG454 治療組有 511 個(gè)基因變化明顯，包括 136 個(gè)基因上調(diào)和 375 個(gè)基因下調(diào)。通過比較 HFD 組的 1319 個(gè)差異基因和 Curc-mPEG454 治療組的 511 個(gè)差異基因，我們發(fā)現(xiàn)有 152 個(gè)基因同時(shí)在治療前后有明顯變化。其中，有 74 個(gè)基因在 HFD 組高表達(dá)，而 Curc-mPEG454 治療后表達(dá)下降；有 18 個(gè)基因從 HFD 組低表達(dá)轉(zhuǎn)變?yōu)橹委熃M中高表達(dá)狀態(tài)。這 152個(gè)差異基因表達(dá)情況見圖 1-1，通過熱圖我們可以看出，差異基因在組內(nèi)表達(dá)相似，從另一方面反映出我們數(shù)據(jù)質(zhì)量可信，可進(jìn)行后續(xù)分析。
分析可以明確差異基因主要參與的生物學(xué)過程，以便進(jìn)一步了解差異作用。圖 1-2 展示了 HFD 組和 Curc-mPEG454 治療組 GO-BP 分析中變 5 條生物學(xué)過程。HFD 引起的生物學(xué)改變主要富集在脂肪酸代謝過程酸代謝過程的有 50 個(gè)基因，其中有 21 個(gè)基因主要參與長鏈脂肪酸代D36、FATP4、SCD1、CYP2E1、ACOT 等基因。Curc-mPEG454 治療改變主要富集在脂肪酸代謝過程，包括 37 個(gè)基因如 CD36、PPAR 、PPA10、ACOT、ACADM。鑒于脂肪酸代謝過程在 HFD 組和治療組均發(fā)，我們進(jìn)一步分析了參與脂肪酸代謝的基因在治療前后的改變。我們發(fā)造成大多數(shù)基因表達(dá)上調(diào)（如 CD36、FATP4、APOA2），進(jìn)而導(dǎo)致脂多并蓄積在肝細(xì)胞內(nèi)。然而，Curc-mPEG454 可以顯著下調(diào)這些基因的D36、PPARγ、CYP4A10、ACOT2、ACADM 和 ACOX1），從而減少取和代謝。
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Silymarin: An option to treat non-alcoholic fatty liver disease[J]. Carmela Colica,Luigi Boccuto,Ludovico Abenavoli. World Journal of Gastroenterology. 2017(47)
[2]CD36在非酒精性脂肪性肝病中的作用[J]. 詹柱,任紅,彭明利. 中華肝臟病雜志. 2017 (12)
[3]非那西丁探針法動(dòng)態(tài)觀測非酒精性脂肪肝大鼠發(fā)病進(jìn)程中的CYP1A2活性[J]. 劉瑩,金涌,蔣培培,吳德敏,方慧子,周靜婷,季俊虬. 中國藥房. 2012(17)
本文編號：2949974
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