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CPA1、PRSS1基因突變檢測及其與慢性胰腺炎相關(guān)性研究

發(fā)布時間:2020-12-21 16:13
  慢性胰腺炎(chronic pancreatitis,CP)是一種胰腺實質(zhì)性病變,最終可致胰腺內(nèi)外分泌功能不全。我國CP發(fā)病率較低,但近年來有明顯上升的趨勢,因此明確CP發(fā)病機制將有助于對其進行早期診斷及治療。如今醫(yī)學(xué)、分子生物學(xué)和生物信息學(xué)等交叉學(xué)科不斷在發(fā)展,已有研究證實CP是由于環(huán)境因素和遺傳因素聯(lián)合作用所致。本研究包括兩部分內(nèi)容,分別探討了四川地區(qū)漢族人群慢性胰腺炎CPA1和PRSS1基因突變情況以及CPA1和PRSS1基因與慢性胰腺炎的相關(guān)性。本研究在中國四川地區(qū)漢族人群中篩查CPA1和PRSS1基因突變,并篩選CPA1和PRSS1基因上標(biāo)簽SNPs位點,以探索CPA1和PRSS1基因與中國四川地區(qū)漢族人群CP發(fā)病的相關(guān)性。運用Sanger直接測序法進行CPA1和PRSS1基因全部外顯子區(qū)域目的片段的測序。將測序結(jié)果通過UCSC數(shù)據(jù)庫進行在線比對并核準,同時將正常對照組的結(jié)果進行同步比對以明確突變的性質(zhì)(SNP或新發(fā)現(xiàn)的突變),并通過SIFT網(wǎng)站預(yù)測突變位點的性質(zhì),通過千人基因組計劃數(shù)據(jù)庫查詢突變位點是否為新發(fā)現(xiàn)突變。同時通過Haploview軟件挑選CPA1和PRSS1基因... 

【文章來源】:電子科技大學(xué)四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:71 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

CPA1、PRSS1基因突變檢測及其與慢性胰腺炎相關(guān)性研究


CP相關(guān)基因突變機制示意圖

慢性胰腺炎,影像學(xué)表現(xiàn)


年 11 月期間在電子科技大學(xué)附屬醫(yī)院·四川省人民醫(yī)院及電子科技大學(xué)附屬醫(yī)院·四川省人民醫(yī)院崇州分院招募的志愿者,其中慢性胰腺炎組共 192 例,全部患者均排除腫瘤、高血壓、糖尿病等代謝性疾病、自身免疫性疾病等基礎(chǔ)疾病。同期收集健康體檢者 240 例為對照組,病例組與對照組年齡、性別相匹配且均無親緣關(guān)系。該研究已獲得電子科技大學(xué)附屬醫(yī)院·四川省人民醫(yī)院倫理委員會批準,并在研究前受試者均同意并簽訂了知情同意書。2.1.1.1 慢性胰腺炎病例組的納入標(biāo)準依據(jù) 2014 年中華醫(yī)學(xué)會外科學(xué)分會胰腺外科學(xué)組制訂的《慢性胰腺炎診治指南》[69],慢性胰腺炎病例組的納入標(biāo)準如下(下列任何一項):a. 胰管結(jié)石,見圖 2-2(a);b. 胰腺多發(fā)性鈣化,見圖 2-2(b);c. 主胰管和分支胰管不規(guī)則擴張,見圖 2-2(c);d. 6 個月內(nèi)有 2 次或 2 次以上的胰腺外分泌功能檢測結(jié)果異常;e. 血清和尿胰酶水平異常。

基因序列,數(shù)據(jù),離心管,樣本


00r/min 離心 10min,將上清液轉(zhuǎn)移到另一支新的已編好號的離心管。向裝有的新離線管中分別加入 4ml 異丙醇溶液,顛倒混勻 10 至 15 次,3000r/min 離min 后,輕輕去掉上清。再向離心管中各加入 2ml 75%乙醇溶液,稍作搖晃00r/min 離心 10min,輕輕去掉上清。將離心管室溫干燥 1-2h 待乙醇充分揮發(fā)入 200μl-300μl 滅菌蒸餾水溶解備用,-20℃保存。(3)測定DNA濃度與純度:吸取1μl提取完畢的樣本DNA溶液,用Nano D00 分光光度計檢測樣本的 DNA 濃度與純度。確定實驗用 DNA 樣本濃度 0nm/280nm 比值在 1.6-1.8 之間,濃度大于 500ng/μl,則說明所提取 DNA 樣本達標(biāo),然后將樣本 DNA 整理后置于-20℃冰箱,保存?zhèn)溆谩?.3 CPA1 和 PRSS1 基因測序.3.1 基因序列數(shù)據(jù)CPA1 基因位于 7q32.2,全長約 7.738kb,位于 CPAS 和 CEP41 基因之間, 10 個外顯子。(見圖 2-3)

【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:2930119

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