白介素-8基因多態(tài)性與HBV背景下肝炎、肝硬化、肝癌遺傳易感性研究
發(fā)布時(shí)間:2020-06-15 19:29
【摘要】:目的:研究白介素(IL)-8基因多態(tài)性在廣西HBV背景下肝炎、肝硬化、肝癌患者中的分布和頻率;探討具有代表性的IL-8單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)的基因多態(tài)性與HBV背景下肝炎、肝硬化、肝癌的關(guān)系,為從基因水平對(duì)HBV背景下肝臟疾病的預(yù)防、發(fā)生發(fā)展及治療提供遺傳新指標(biāo)。 方法:選取連續(xù)入院的HBV感染患者390例包括慢性乙型肝炎患者(CHB)160例、乙型肝炎肝硬化患者(LC)80例和HBV相關(guān)性肝癌患者(HCC)150例及健康體檢者(對(duì)照組)150例。通過(guò)聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)技術(shù)檢測(cè)IL-8基因-251A/T位點(diǎn)和+781C/T位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性,并利用直接測(cè)序法鑒定其基因型。應(yīng)用SPSS13.0軟件檢驗(yàn)各位點(diǎn)Hardy-Weinberg遺傳平衡性(HWE)、分析基因型及等位基因頻率在病例組和對(duì)照組中的分布差異。Logistic回歸分析篩選獨(dú)立的易感與保護(hù)基因型和等位基因,以比值比(OR)及其95%可信區(qū)間(CI)表示相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度。運(yùn)用SHEsis在線軟件進(jìn)行連鎖不平衡及單倍型分析。 結(jié)果: 1.對(duì)照組和病例組中IL-8基因-251A/T和+781C/T位點(diǎn)的基因型頻率已達(dá)到遺傳平衡,具有群體代表性(P0.05)。 2. IL-8基因-251A/T位點(diǎn)AA、AT、TT三種基因型及A、T兩種等位基因和+781C/T位點(diǎn)CC、CT、TT三種基因型及C、T兩種等位基因在不同組別間的分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。 3. logistic回歸分析校正年齡、性別因素的影響后發(fā)現(xiàn),與TT基因型相比,IL-8基因-251A/T位點(diǎn)AA基因型顯著降低了LC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.135;95%CI,0.021-0.865;P=0.035)。同時(shí)A等位基因相對(duì)T等位基因,LC組的風(fēng)險(xiǎn)度降低了47.7%(95%CI,0.247-0.920;P=0.027)。提示IL-8基因-251A/T位點(diǎn)AA基因型和A等位基因可能是乙型肝炎肝硬化的保護(hù)因素。但Logistic回歸分析未發(fā)現(xiàn)IL-8基因+781C/T位點(diǎn)多態(tài)性與廣西地區(qū)人群CHB、LC、HCC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)(P0.05)。 4.對(duì)性別分層后,無(wú)論是在男性人群中還是女性人群中,IL-8基因-251A/T位點(diǎn)AA、AT、TT三種基因型及A、T兩種等位基因和+781C/T位點(diǎn)CC、CT、TT三種基因型及C、T兩種等位基因在不同組別間的分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),并且兩位點(diǎn)多態(tài)性與廣西地區(qū)人群CHB、LC、HCC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無(wú)關(guān)(P0.05)。 5.本研究150例廣西地區(qū)對(duì)照者的IL-8基因-251A/T和+781C/T位點(diǎn)多態(tài)性與國(guó)際人類基因組單體型圖(HapMap)計(jì)劃中報(bào)道的北京人群、歐洲人群分布較一致(P0.05),而與東京人群和撒哈拉以南非洲尼日利亞人群有差異(P0.05)。 6.連鎖不平衡和單體型檢驗(yàn)顯示:1) IL-8基因-251A/T與+781C/T位點(diǎn)存在連鎖不平衡關(guān)系(D'=0.710,r2=0.356,P0.001); 2)在本研究的人群中存在A~(251)C~(781)、A~(251)T~(781)、T~(251)C~(781)、T~(251)T~(781)四種單體型;3)所有單體型在各病例組和對(duì)照組的頻率分布均無(wú)顯著差異,并且與CHB、LC、HCC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)均無(wú)關(guān)(P0.05)。 結(jié)論: IL-8基因-251A/T位點(diǎn)AA基因型和A等位基因,對(duì)廣西地區(qū)人群乙型肝炎肝硬化可能有一定的保護(hù)作用。
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2011
【分類號(hào)】:R512.62
【圖文】:
圖 1 -251A/T 位點(diǎn)擴(kuò)增片段電泳圖(M 泳道為 Maker,1-8 泳道為樣本擴(kuò)增產(chǎn)物)(2)+781C/T 位點(diǎn)擴(kuò)增產(chǎn)物片段長(zhǎng)度為 203bp,見圖 2。圖 2 +781C/T 位點(diǎn)擴(kuò)增片段電泳圖(M 泳道為 Maker,1-8 泳道為樣本擴(kuò)增產(chǎn)物)2.酶切產(chǎn)物電泳結(jié)果(1)173bp 的-251A/T 位點(diǎn)擴(kuò)增產(chǎn)物可被 AseI 內(nèi)切酶切為 152bp 和 21bp 兩個(gè)片段,當(dāng)堿基 A→T 時(shí),酶切位點(diǎn)消失,因此只顯示為 173bp 一條酶切產(chǎn)物
圖 2 +781C/T 位點(diǎn)擴(kuò)增片段電泳圖(M 泳道為 Maker,1-8 泳道為樣本擴(kuò)增產(chǎn)物)2.酶切產(chǎn)物電泳結(jié)果(1)173bp 的-251A/T 位點(diǎn)擴(kuò)增產(chǎn)物可被 AseI 內(nèi)切酶切為 152bp 和 21bp 兩個(gè)片段,當(dāng)堿基 A→T 時(shí),酶切位點(diǎn)消失,因此只顯示為 173bp 一條酶切產(chǎn)物的,表示為純合子-251TT 基因型;有 173、152、 21(不顯示)bp 三條酶切產(chǎn)物,表示為雜合子-251AT 基因型;有 152 和 21(不顯示)bp 兩條酶切產(chǎn)物,表示為純合子-251AA 基因型,見圖 3。
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2011
【分類號(hào)】:R512.62
【圖文】:
圖 1 -251A/T 位點(diǎn)擴(kuò)增片段電泳圖(M 泳道為 Maker,1-8 泳道為樣本擴(kuò)增產(chǎn)物)(2)+781C/T 位點(diǎn)擴(kuò)增產(chǎn)物片段長(zhǎng)度為 203bp,見圖 2。圖 2 +781C/T 位點(diǎn)擴(kuò)增片段電泳圖(M 泳道為 Maker,1-8 泳道為樣本擴(kuò)增產(chǎn)物)2.酶切產(chǎn)物電泳結(jié)果(1)173bp 的-251A/T 位點(diǎn)擴(kuò)增產(chǎn)物可被 AseI 內(nèi)切酶切為 152bp 和 21bp 兩個(gè)片段,當(dāng)堿基 A→T 時(shí),酶切位點(diǎn)消失,因此只顯示為 173bp 一條酶切產(chǎn)物
圖 2 +781C/T 位點(diǎn)擴(kuò)增片段電泳圖(M 泳道為 Maker,1-8 泳道為樣本擴(kuò)增產(chǎn)物)2.酶切產(chǎn)物電泳結(jié)果(1)173bp 的-251A/T 位點(diǎn)擴(kuò)增產(chǎn)物可被 AseI 內(nèi)切酶切為 152bp 和 21bp 兩個(gè)片段,當(dāng)堿基 A→T 時(shí),酶切位點(diǎn)消失,因此只顯示為 173bp 一條酶切產(chǎn)物的,表示為純合子-251TT 基因型;有 173、152、 21(不顯示)bp 三條酶切產(chǎn)物,表示為雜合子-251AT 基因型;有 152 和 21(不顯示)bp 兩條酶切產(chǎn)物,表示為純合子-251AA 基因型,見圖 3。
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本文編號(hào):2714885
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