HBeAg陽性慢性乙型肝炎患者乙型肝炎病毒基因變異的全基因組分析及其與干擾素α療效的關系
發(fā)布時間:2020-05-08 08:35
【摘要】: 目的研究HBeAg陽性慢性乙型肝炎(Chronic hepatitis B, CHB)患者乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)全基因組基因變異及其與干擾素α(interferon,IFN)療效的關系。 方法PCR擴增并克隆干擾素治療前慢性乙型肝炎患者血清中HBV全基因組DNA,測序并進行基因變異分析。 結果獲得干擾素治療前慢性乙型肝炎患者來源的33株HBV全基因組DNA,它們均屬于C或B基因型。與標準株相比,HBV缺失變異在B、C基因型間的發(fā)生率分別為14.3%(2/14)和63.2%(12/19)。其中,HBV pre-S2 nt19-nt56缺失突變只發(fā)生在C基因型干擾素治療有效的患者中,發(fā)生率為15.2%(5/33),占C基因型有效病例的50%(5/10);TP+space區(qū)6株缺失變異HBV全基因組DNA中,5例干擾素治療無效,1例有效。HBV插入突變一例,3460bp,B基因型,干擾素治療無效。HBV點突變結果顯示:4例C基因型ntG2699T變異為干擾素有效病例,占C基因型有效病例的40%,且發(fā)生在無pre-S2缺失的病例中。因此,pre-S2缺失變異和ntG2699T變異占C基因型有效病例的90%,可作為預測干擾素應答的因素。另外,體外實驗有抗干擾素作用的T1504C、A1762T、G1764AG1896A變異在本研究中對干擾素療效無影響。TP257研究發(fā)現(xiàn),B基因型的H135Y和Q176H,C基因型的N89D和K142Q/K142E可能有抗干擾素作用。 結論HBV缺失變異在B、C基因型間的發(fā)生率存在顯著性差異;HBV pre-S2缺失突變和ntG2699T變異與C基因型干擾素應答相關;B基因型的H135Y和Q176H,C基因型的N89D和K142Q/K142E可能有抗干擾素作用。
【圖文】:
Ml斗卿
.加入400林l等體積的飽和酚(Tris一HCIpH8.0),振蕩混勻,120009,4“C離心10min。.吸取上層水相約350川,加入350閃等體積的酚/氯仿(酚:氯仿:異醇/25:24:1),振蕩混勻,120009,4“C離心10min。.吸取上層水相約300林l,加入l/10倍體積3MNaAc(約30林l)、20酵母tRNA、2.5倍體積無水乙醇(約1ml),顛倒混勻,一20“C沉淀DNA或過夜。.12,0009離心15分鐘,棄去上清,D隊沉淀溶于50灘滅菌去離子水,,于一20“C保存。2.2HBV基因組DNA克隆如下圖2所示:Hind111SaclHBVS,1821一18413,
【學位授予單位】:福建醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2010
【分類號】:R512.62
【圖文】:
Ml斗卿
.加入400林l等體積的飽和酚(Tris一HCIpH8.0),振蕩混勻,120009,4“C離心10min。.吸取上層水相約350川,加入350閃等體積的酚/氯仿(酚:氯仿:異醇/25:24:1),振蕩混勻,120009,4“C離心10min。.吸取上層水相約300林l,加入l/10倍體積3MNaAc(約30林l)、20酵母tRNA、2.5倍體積無水乙醇(約1ml),顛倒混勻,一20“C沉淀DNA或過夜。.12,0009離心15分鐘,棄去上清,D隊沉淀溶于50灘滅菌去離子水,,于一20“C保存。2.2HBV基因組DNA克隆如下圖2所示:Hind111SaclHBVS,1821一18413,
【學位授予單位】:福建醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2010
【分類號】:R512.62
【參考文獻】
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1 彭R
本文編號:2654413
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