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基于IPA分析自噬對大鼠肝再生中樹突狀細(xì)胞的調(diào)節(jié)作用

發(fā)布時(shí)間:2018-05-21 21:30

  本文選題:肝再生 + 自噬; 參考:《遺傳》2015年03期


【摘要】:為探討自噬對大鼠肝再生中樹突狀細(xì)胞(Dendritic cells,DCs)的調(diào)節(jié)作用,文章通過Percoll密度梯度離心結(jié)合免疫磁珠分選分離大鼠DCs,Rat Genome 230 2.0芯片檢測大鼠肝再生中自噬相關(guān)基因表達(dá)變化,利用IPA等軟件分析自噬在DCs中的生理活動(dòng)。結(jié)果表明,LC3、BECN1、ATG7和SQSTM1等關(guān)鍵基因在部分肝切除后不同恢復(fù)時(shí)間段有明顯表達(dá)變化;芯片中對應(yīng)的自噬相關(guān)基因?yàn)?93個(gè),其中210個(gè)基因發(fā)生了有意義的變化。比較分析自噬生理活動(dòng)情況,發(fā)現(xiàn)自噬在再生早期和晚期階段增強(qiáng),增殖期減弱。與自噬相關(guān)的生理活動(dòng)主要有RNA表達(dá)、RNA轉(zhuǎn)錄細(xì)胞分化和增殖,其中涉及的信號(hào)通路主要有PPARα/RXRα激活、急性期反應(yīng)、TREM1信號(hào)通路、IL-6信號(hào)通路、IL-8信號(hào)通路和IL-1信號(hào)通路等,它們在肝再生階段發(fā)生了不同程度的上調(diào)或下調(diào)。Cluster分析還發(fā)現(xiàn),P53和AMPK信號(hào)參與調(diào)控DCs的自噬活動(dòng),在肝再生早期主要是AMPK信號(hào),在肝再生末期P53和AMPK信號(hào)共同參與自噬的調(diào)節(jié)。以上研究結(jié)果說明DCs自噬可能在肝再生早期激活細(xì)胞免疫反應(yīng)和后期清除DCs等方面發(fā)揮著重要作用。
[Abstract]:In order to investigate the regulation of autophagy on Dendritic cells (DCs) in rat liver regeneration, the expression of autophagy related genes in rat liver regeneration was detected by Percoll density gradient centrifugation combined with immunomagnetic beads, and Rat Genome 2302 chip was used to detect the changes of autophagy related gene expression in rat liver regeneration. The physiological activities of autophagy in DCs were analyzed by IPA and other software. The results showed that the key genes, such as LC3, BECN1, ATG7 and SQSTM1, were obviously expressed in different recovery periods after partial hepatectomy. The corresponding autophagy related genes in the chip were 593, of which 210 genes had significant changes. The autophagy was compared and analyzed, and the autophagy was enhanced in the early and late stages of regeneration. The physiological activities related to autophagy mainly include RNA expression, RNA transcriptional cell differentiation and proliferation. The signal pathways involved mainly include PPAR alpha /RXR alpha activation, acute phase reaction, TREM1 signaling pathway, IL-6 signaling pathway, IL-8 signaling pathway and IL-1 signaling pathway, which have been up or down to varying degrees in the stage of liver regeneration. The Cluster analysis also found that P53 and AMPK signals participate in the autophagy regulation of DCs, which is mainly the AMPK signal in the early stage of liver regeneration. The P53 and AMPK signals are involved in the regulation of autophagy at the end of the stage of liver regeneration. The above results suggest that autophagy may play an important role in activating cell immune response and clearing DCs in the early stage of liver regeneration.
【作者單位】: 河南師范大學(xué) 河南省生物工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;河南師范大學(xué) 河南省-科技部共建細(xì)胞分化調(diào)控國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育基地;河南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】:河南省重大科技攻關(guān)項(xiàng)目(編號(hào):111100910600) 河南師范大學(xué)博士啟動(dòng)課題(編號(hào):qd14175) 河南師范大學(xué)青年科學(xué)基金項(xiàng)目資助
【分類號(hào)】:R575

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本文編號(hào):1920913

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