發(fā)布時間：2017-10-12 00:39

  本文關鍵詞：HBV相關性肝癌中HBV cccDNA突變位點的研究

  更多相關文章： 乙型肝炎病毒 共價閉合環(huán)狀DNA 核苷酸突變 候選因子 靶向治療

【摘要】：目的:研究乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染導致的肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者共價閉合環(huán)狀DNA(covalently closed circular DNA,cccDNA)的表達水平及各區(qū)間位點的變異,探討HBV ccc DNA不同區(qū)域核苷酸位點突變與HCC疾病的關系。基于基因表達譜數(shù)據(jù)篩選HBV感染的HCC疾病關鍵基因因子,為基因靶向性預防和治療肝癌提供參考因子。方法:收集49例重慶醫(yī)科大學附屬第一和第二醫(yī)院HBV感染形成的HCC患者的血清及肝臟癌組織和配對的癌旁組織,首先檢測患者臨床病毒學指標,再用特異性熒光定量Tag Man探針方法檢測肝組織內(nèi)HBV ccc DNA和DNA在HCC癌組織及癌旁組織中的表達水平;然后利用滾環(huán)擴增(Roling circle amplification,RCA)技術特異性擴增癌組織及癌旁組織中肝臟內(nèi)的cccDNA。進一步分析患者癌組織和癌旁組織HBV cccDNA和DNA表達水平的差異及ccc DNA在X區(qū)和前C/C區(qū)核苷酸突變位點及突變組合與HCC發(fā)生的關系;下載Gene Expression Ominibus(GEO)數(shù)據(jù)庫中5對HBV感染的HCC配對樣本基因表達譜數(shù)據(jù),通過生物信息學分析方法篩選與HCC直接關聯(lián)的關鍵候選因子。結果:(1)在49對hcc病人中,共有35例配對的癌組織和癌旁組織的cccdna有效檢測,cccdna在癌組織中總體表達水平顯著低于對應的癌組織(5.20vs.9.35copiesy/cell,p=0.0033);配對的癌組織和癌旁組織的cccdna經(jīng)過rca擴增后,在x和prec/c區(qū)分別有18對和16對能有效擴增,cccdnax區(qū)域位點突變率在癌組織中顯著高于癌旁組織(28.63%和20.94%,p=0.0313);序列比對后發(fā)現(xiàn)x區(qū)t1721g位點和prec/c區(qū)域a1979g的突變在hcc癌組織中發(fā)生的個數(shù)顯著地高于癌旁組織(p=0.04075,or=10.1598;p=0.0155,or=13.7529);由t1727g突變形成的組合突變a1703g/t1727g、a1762t/g1764a/t1727g、a1703g/t1727g/a1762t/g1764a,a1979g突變形成的組合突變a1979g/a2189、a1979g/a2189c/t/c2288a、a1979g/a2189c/t/c2288a/a2075t在癌組織中發(fā)生的次數(shù)高于癌旁組織。(2)篩選得到的高風險肝癌模塊中(75%)過量表達基因egr1,fos,dusp1,且共同參與mapk信號通路和下游通路細胞周期調(diào)控。結論:既往文獻報道的hcc中的典型突變位點a1762t/g1764a、g1896a/g1899a等在本研究的樣本中cccdna的x區(qū)間和prec/c區(qū)間在癌組織和癌旁組織中均有突變,且無明顯差別;發(fā)現(xiàn)的t1721g和a1979g單核苷酸突變及組合位點突變更具有特征性,它們的突變可能與hbv感染的hcc疾病的發(fā)展關聯(lián)密切。篩選得到的egr1,fos,dusp1基因很可能成為早期識別hcc的生物標志,同時也為基因靶向性治療HCC提供了候選因子。
【關鍵詞】：乙型肝炎病毒 共價閉合環(huán)狀DNA 核苷酸突變 候選因子 靶向治療
【學位授予單位】：重慶醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R512.62;R735.7
【目錄】：

• 英漢縮略語名詞對照4-6
• 中文摘要6-9
• 英文摘要9-12
• 前言12-14
• 第一部分 HBV相關的肝癌中HBV cccDNA核苷酸突變研究14-39
• 1 材料與儀器14-15
• 2.方法15-18
• 3.結果18-29
• 4 討論29-34
• 小結34-35
• 參考文獻35-39
• 第二部分 HBV相關性肝癌關鍵基因因子的篩選39-51
• 1 材料39
• 2.方法39-42
• 3.結果42-47
• 4 討論47-48
• 小結48-49
• 參考文獻49-51
• 文獻綜述51-55
• 參考文獻53-55
• 致謝55-56
• 攻讀學位期間撰寫和發(fā)表的論文56

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 Xin Zhang;Hui-Guo Ding;;Key role of hepatitis B virus mutation in chronic hepatitis B development to hepatocellular carcinoma[J];World Journal of Hepatology;2015年09期

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本文編號：1015723