本文關鍵詞：VEGFR1基因多態(tài)性及環(huán)境因素與年齡相關性黃斑變性的關聯(lián)分析

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【摘要】：目的:1.探討寧夏地區(qū)人群血管內(nèi)皮生長因子受體1(vascular endothelial growth factor receptor1,VEGFR1)基因單核苷酸多態(tài)性與年齡相關性黃斑變性(age-related macular degeneration,AMD)的相關性及可能的環(huán)境危險因素;2.VEGFR1基因單核苷酸多態(tài)性分別與寧夏地區(qū)漢族、回族AMD的關聯(lián)性;3.分別探討VEGFR1基因單核苷酸多態(tài)性與早中期及其新生血管性AMD的關聯(lián)性。方法:采用病例對照研究的分析方法,收集寧夏地區(qū)AMD患者432例做為病例組,其中包括漢族患者325例,回族107例;早中期患者139例,新生血管性患者287例。選擇性別、民族與之相匹配的906例進行白內(nèi)障手術并以能夠觀察眼底的患者作為對照組,包括漢族受檢者698例,回族208例。收集所有受檢者基本資料,除姓名、性別、年齡外,還包括吸煙史、高血壓、糖尿病史等因素,并進行詳細的眼科檢查。提取所有受檢者外周血DNA。選取VEGFR1基因上8個單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位點,運用時間飛行質譜MALDI-TOF分析軟件對這些位點進行基因分型。采用SPSS 17.5及plink軟件包進行數(shù)據(jù)分析。運用非條件Logistic逐步回歸模型對環(huán)境因素進行分析,篩選出AMD的主要環(huán)境危險因素;通過卡方檢驗和Logistics回歸分析在不同遺傳模型下各位點的基因型和等位基因頻率分布及關聯(lián)性研究并計算矯正后的比值比(odds ratios,ORs)和95%可信區(qū)間(95%confidence intervals,CIs),同時對多重比較進行Bonferroni檢驗校正。運用haploview4.2軟件分析各連鎖不平衡(linkagedisequilibrium,ld)區(qū)塊和基于連鎖不平衡的單體型,利用置換次數(shù)為50000次的置換檢驗進行多重檢驗校正。此外,應用非條件logistic回歸對回、漢族及早中期、新生血管性amd與vegfr1基因型、等位基因的關聯(lián)性進行分析,計算其矯正后的ors和95%cis值。結果:1.單因素及多因素logistic回歸分析后發(fā)現(xiàn)吸煙、高血壓與amd發(fā)生與否有統(tǒng)計學差異(p0.05),ors和95%cis分別為2.147(1.556-2.943)和2.388(1.871-3.048)。在snps基因分型中,amd組與對照組間共有6個snps位點的p值小于0.05;但經(jīng)bonferroni多重檢驗校正后,只有rs9554322和rs9582036兩個snps位點的基因型和等位基因頻率在amd組與對照組間的差異具有統(tǒng)計學意義(p0.0062)。rs9554322位點攜帶cc基因型個體比gg基因型罹患amd的風險高出6倍多(or=6.057,95%ci:3.099 11.839)。此外rs9943922位點在基因型分布和隱性模型中也與amd顯著相關(p=0.004)。在連鎖不平衡分析中,我們發(fā)現(xiàn)位點rs9582036和rs9554320的單體型ca與amd相關(p=0.035),但在進行了50000次置換檢驗后卻沒有相關性。2.寧夏漢族、回族患者等位基因頻率差異無統(tǒng)計學意義(p0.05)。漢族amd組與漢族正常對照組的rs9554322及rs9582036snps基因型分布及等位基因頻率的比較差異均有統(tǒng)計學意義(p=0.000、p=0.006),各位點等位基因的ors值和95%cis分別為1.671(1.234-2.262)及1.477(1.124-1.940)。rs9943922在漢族病例與對照組基因型分布間差異有統(tǒng)計學意義(p=0.001)。寧夏回族amd患者與回族正常對照者僅rs9554322基因型及等位基因頻率分布差異有統(tǒng)計學意義(p=0.000)。吸煙會增加漢族amd發(fā)病風險,差異有統(tǒng)計學意義(p=0.000,or=2.622,95%ci:1.899-3.619)。3.早中期及新生血管性amd組與對照組的rs9554322snp基因型分布及等位基因頻率的比較差異均有統(tǒng)計學意義,等位基因的ors和95%cis分別為2.181(1.476-3.222)和1.838(1.376-2.454)。而rs9582036在新生血管病例與對照組等位基因分布間差異有統(tǒng)計學意義(P=0.002)。結論:1.吸煙、高血壓兩個因素是AMD發(fā)病的獨立危險因素。VEGFR1基因的SNPs位點rs9554322,rs9582036和rs9943922與寧夏地區(qū)人群AMD的發(fā)生存在相關性,是AMD發(fā)病的危險因素。2.VEGFR1基因rs9554322、rs9582036及rs9943922 SNPs可能與寧夏地區(qū)漢族AMD發(fā)病相關,其中僅rs9554322與回族人群AMD有關聯(lián)性。3.Rs9554322與寧夏地區(qū)不同分期AMD的發(fā)病均相關,而rs9582036僅與寧夏地區(qū)新生血管性AMD患者發(fā)病有關聯(lián)性。
【關鍵詞】：年齡相關性黃斑變性 單核苷酸多態(tài)性 血管內(nèi)皮生長因子受體1基因 民族 環(huán)境因素
【學位授予單位】：寧夏醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R774.5
【目錄】：

• 摘要4-7
• ABSTRACT7-11
• 中英文縮略詞11-13
• 前言13-17
• 材料與方法17-28
• 實驗材料17-18
• 研究對象18-19
• 研究方法19-28
• 結果28-48
• 受檢者臨床特征28
• AMD環(huán)境危險因素的分析28-29
• AMD患者與VEGFR1基因相關性分析29-35
• 我們對資料人群按照回族漢族進一步分層研究所得結果如下35-42
• 我們根據(jù) AMD 的分型將早中期AMD及新生血管性AMD單獨篩選出來進行分析結果如下42-48
• 討論48-53
• 結論53-54
• 參考文獻54-60
• 文獻綜述60-72
• 參考文獻70-72
• 致謝72-73
• 攻讀學位期間發(fā)表的學術論文目錄73

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本文編號：998463